136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0125 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0125  flagellar motor switch protein FliM, putative  100 
 
 
316 aa  646    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.626103  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4218  surface presentation of antigens (SPOA) protein  81.21 
 
 
317 aa  523  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208016  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1149  flagellar motor switch protein FliM  37.58 
 
 
323 aa  244  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  25.67 
 
 
303 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  26.96 
 
 
335 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1712  flagellar motor switch protein FliM  26.86 
 
 
309 aa  116  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  0.0773135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2805  flagellar motor switch protein FliM  25.84 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  25.94 
 
 
340 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  25.94 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0019  surface presentation of antigens (SPOA) protein  25.8 
 
 
314 aa  99.8  6e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0304  surface presentation of antigens (SPOA) protein  28.74 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0344  surface presentation of antigens (SPOA) protein  23.98 
 
 
316 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566243  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  24.7 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  24.6 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  24.7 
 
 
337 aa  72.4  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  25.53 
 
 
326 aa  72.4  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1509  flagellar motor switch protein FliM  20.7 
 
 
404 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645408  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5507  flagellar motor switch protein FliM  20.35 
 
 
400 aa  70.1  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485441  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  24.46 
 
 
338 aa  69.3  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0312  surface presentation of antigens (SPOA) protein  21.24 
 
 
316 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  20.2 
 
 
401 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  21.78 
 
 
401 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3784  flagellar motor switch protein FliM  20.27 
 
 
401 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  23.71 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  25.22 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  22.48 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  17.18 
 
 
384 aa  65.9  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1686  flagellar motor switch protein FliM  20.62 
 
 
400 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157036  normal  0.0866038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4420  flagellar motor switch protein FliM  20.27 
 
 
400 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2564  flagellar motor switch protein FliM  20.21 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.525902 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  26.09 
 
 
347 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  24.68 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  22.53 
 
 
405 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0820  flagellar motor switch protein FliM  21.54 
 
 
404 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  normal  0.0356889 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4200  flagellar motor switch protein FliM  21.83 
 
 
403 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592562  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
334 aa  63.2  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1756  flagellar motor switch protein FliM  20 
 
 
353 aa  62.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  22.61 
 
 
332 aa  62.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  24.26 
 
 
322 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  24.26 
 
 
322 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0249  surface presentation of antigens (SPOA) protein  23.14 
 
 
315 aa  62.8  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0668942  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  24.26 
 
 
322 aa  62.4  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  24.56 
 
 
339 aa  62.4  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  23.11 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1756  flagellar motor switch protein FliM  20.32 
 
 
353 aa  60.8  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  23.53 
 
 
342 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  21.55 
 
 
334 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  22.59 
 
 
341 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3274  flagellar motor switch protein FliM  21.74 
 
 
406 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3050  flagellar motor switch protein FliM  21.74 
 
 
406 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  23.28 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  23.64 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  23.28 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  23.28 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  23.43 
 
 
342 aa  60.1  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  23.05 
 
 
332 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  24.46 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  22.28 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  24.46 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  24.46 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  24.46 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4715  flagellar motor switch protein FliM  21.43 
 
 
403 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179233  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  21.76 
 
 
332 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0726  flagellar motor switch protein  22.03 
 
 
319 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
324 aa  59.7  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  21.92 
 
 
395 aa  59.3  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  20.26 
 
 
335 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  21.01 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  24.46 
 
 
332 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  21.34 
 
 
342 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  21.76 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  21.55 
 
 
329 aa  58.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  21.83 
 
 
332 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  20.5 
 
 
342 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  24.24 
 
 
381 aa  57.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  20.5 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  20.92 
 
 
343 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  23.58 
 
 
323 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  20.5 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  20.5 
 
 
342 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  23.79 
 
 
325 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  24.03 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  20.59 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  20.59 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  24.03 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  24.03 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  20.59 
 
 
343 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  21.79 
 
 
334 aa  57.4  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  21.45 
 
 
359 aa  57.4  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  24.03 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  24.03 
 
 
332 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  24.03 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  24.03 
 
 
332 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  22.52 
 
 
324 aa  57  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  22.27 
 
 
322 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  19.67 
 
 
325 aa  56.2  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  23.4 
 
 
322 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  20.28 
 
 
335 aa  56.2  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  26.55 
 
 
336 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>