30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0304 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0304  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 
311 aa  608  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0726  flagellar motor switch protein  26.73 
 
 
319 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0249  surface presentation of antigens (SPOA) protein  28.09 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0668942  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0312  surface presentation of antigens (SPOA) protein  24.46 
 
 
316 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2805  flagellar motor switch protein FliM  24.19 
 
 
313 aa  85.9  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0344  surface presentation of antigens (SPOA) protein  24.54 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566243  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  26.37 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  25.72 
 
 
340 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  25.72 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0125  flagellar motor switch protein FliM, putative  28.74 
 
 
316 aa  77  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.626103  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  24.44 
 
 
303 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  21.71 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1149  flagellar motor switch protein FliM  25.45 
 
 
323 aa  71.6  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1712  flagellar motor switch protein FliM  24.34 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  0.0773135 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4218  surface presentation of antigens (SPOA) protein  24.07 
 
 
317 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208016  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0019  surface presentation of antigens (SPOA) protein  22.86 
 
 
314 aa  59.3  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  18.96 
 
 
329 aa  50.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  21.57 
 
 
338 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  24.37 
 
 
338 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  24.58 
 
 
332 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  25.41 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  25.41 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  22.13 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  25.42 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  25.42 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  25.42 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  25.42 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  25.42 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  22.76 
 
 
334 aa  43.1  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  23.77 
 
 
334 aa  42.4  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>