184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1089 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 311 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1712  flagellar motor switch protein FliM  54.03 
 
 		 309 aa  353  2e-96  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  0.0773135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  51.01 
 
 		 303 aa  348  6e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  50.52 
 
 		 340 aa  330  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  50.52 
 
 		 344 aa  330  3e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  49.48 
 
 		 335 aa  328  7e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0019  surface presentation of antigens (SPOA) protein  48 
 
 		 314 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2805  flagellar motor switch protein FliM  45.08 
 
 		 313 aa  301  9e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2564  flagellar motor switch protein FliM  31.38 
 
 		 374 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525902 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  29.54 
 
 		 384 aa  152  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5507  flagellar motor switch protein FliM  28.27 
 
 		 400 aa  144  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  28.21 
 
 		 401 aa  143  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0820  flagellar motor switch protein FliM  29.37 
 
 		 404 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  normal  0.0356889 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  31.07 
 
 		 376 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  28.21 
 
 		 401 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1509  flagellar motor switch protein FliM  28.37 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0973  flagellar motor switch protein FliM  29.63 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3274  flagellar motor switch protein FliM  28.98 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3050  flagellar motor switch protein FliM  28.98 
 
 		 406 aa  138  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4715  flagellar motor switch protein FliM  28.37 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179233  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4200  flagellar motor switch protein FliM  29.08 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  28.98 
 
 		 405 aa  137  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3482  flagellar motor switch protein FliM  28.19 
 
 		 395 aa  135  8e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138981  normal  0.137747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3784  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 		 401 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1686  flagellar motor switch protein FliM  26.95 
 
 		 400 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157036  normal  0.0866038 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1434  flagellar motor switch protein FliM  29.93 
 
 		 377 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4420  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 		 400 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0125  flagellar motor switch protein FliM, putative  25 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.626103  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4218  surface presentation of antigens (SPOA) protein  23.36 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.208016  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  24.09 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  24.09 
 
 		 335 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  22.42 
 
 		 332 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1149  flagellar motor switch protein FliM  20.13 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  23.36 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  23.33 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  23.33 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  23.33 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  23.33 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  23.33 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  23.33 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  23.33 
 
 		 332 aa  88.2  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  24.73 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  23.27 
 
 		 335 aa  86.3  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  22.42 
 
 		 332 aa  85.9  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  22.14 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  22.51 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  23.64 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  22.51 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  22.51 
 
 		 332 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  22.55 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  21.19 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  23.05 
 
 		 338 aa  80.9  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  22.14 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  22.14 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  22.14 
 
 		 332 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  20.96 
 
 		 334 aa  80.5  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  25.24 
 
 		 333 aa  79.3  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  21.77 
 
 		 332 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0344  surface presentation of antigens (SPOA) protein  26.67 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.566243  normal  0.0312386 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  21.79 
 
 		 341 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0312  surface presentation of antigens (SPOA) protein  27.92 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  23.02 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  21.43 
 
 		 343 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1756  flagellar motor switch protein FliM  20.21 
 
 		 353 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  21.07 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  21.07 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  21.07 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1756  flagellar motor switch protein FliM  20.07 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  21.77 
 
 		 333 aa  73.6  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  21.07 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  21.07 
 
 		 343 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  25.24 
 
 		 336 aa  73.2  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  21.07 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  21.07 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  21.77 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  21.07 
 
 		 342 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0304  surface presentation of antigens (SPOA) protein  21.71 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  24.88 
 
 		 334 aa  72.8  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  21.07 
 
 		 342 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  21.22 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  21.43 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  22.51 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  20.71 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  24.76 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  24.76 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  23.53 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  23.53 
 
 		 337 aa  70.5  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  21.56 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  24.76 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  21.66 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  20.45 
 
 		 326 aa  68.9  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  24.43 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  24.27 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  20.96 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  18.82 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0249  surface presentation of antigens (SPOA) protein  20.59 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0668942  normal  0.696712 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  21.22 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  21.52 
 
 		 333 aa  65.5  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  20.62 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  20.48 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>