211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1124 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
401 aa  811    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3784  flagellar motor switch protein FliM  86.15 
 
 
401 aa  682    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1509  flagellar motor switch protein FliM  86.53 
 
 
404 aa  696    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645408  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4420  flagellar motor switch protein FliM  87.37 
 
 
400 aa  702    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1686  flagellar motor switch protein FliM  85.86 
 
 
400 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157036  normal  0.0866038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  95.51 
 
 
401 aa  762    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5507  flagellar motor switch protein FliM  85.14 
 
 
400 aa  686    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485441  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  61.07 
 
 
384 aa  457  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  62.98 
 
 
376 aa  457  1e-127  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4200  flagellar motor switch protein FliM  54.11 
 
 
403 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592562  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4715  flagellar motor switch protein FliM  55.32 
 
 
403 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0820  flagellar motor switch protein FliM  56.35 
 
 
404 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  normal  0.0356889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  53.32 
 
 
405 aa  441  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3050  flagellar motor switch protein FliM  54.23 
 
 
406 aa  435  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3274  flagellar motor switch protein FliM  54.23 
 
 
406 aa  435  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1434  flagellar motor switch protein FliM  71.84 
 
 
377 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2564  flagellar motor switch protein FliM  66.67 
 
 
374 aa  427  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.525902 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3482  flagellar motor switch protein FliM  45.79 
 
 
395 aa  320  3.9999999999999996e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138981  normal  0.137747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0973  flagellar motor switch protein FliM  44.3 
 
 
337 aa  249  4e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  32.5 
 
 
325 aa  177  4e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  32.92 
 
 
326 aa  176  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  34.41 
 
 
326 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  34.77 
 
 
326 aa  170  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  33 
 
 
326 aa  168  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  31.19 
 
 
334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  30.86 
 
 
334 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  28.44 
 
 
335 aa  160  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  29.57 
 
 
343 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  29.06 
 
 
335 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  29.06 
 
 
335 aa  159  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  31.35 
 
 
334 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  28.35 
 
 
352 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  30.86 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  30.43 
 
 
334 aa  156  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  30.43 
 
 
334 aa  156  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  30.79 
 
 
334 aa  155  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 
354 aa  155  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 
332 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 
332 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 
332 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 
332 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  28.3 
 
 
332 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  28 
 
 
332 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  28.3 
 
 
332 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  28.3 
 
 
332 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 
332 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 
332 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 
332 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  30.12 
 
 
329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  27.99 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 
332 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 
332 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  27.08 
 
 
332 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  28.1 
 
 
335 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  28.7 
 
 
343 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  28.7 
 
 
343 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  29.94 
 
 
333 aa  152  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  29.6 
 
 
349 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  30.12 
 
 
325 aa  152  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  29.81 
 
 
325 aa  151  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  28.35 
 
 
343 aa  151  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  28.61 
 
 
348 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  28.7 
 
 
343 aa  151  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  27.69 
 
 
332 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  30.77 
 
 
335 aa  150  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  26.77 
 
 
332 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  28.31 
 
 
348 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  29.52 
 
 
337 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  29.52 
 
 
337 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  28.14 
 
 
341 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  26.77 
 
 
332 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  29.15 
 
 
395 aa  149  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  27.99 
 
 
334 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  29.82 
 
 
381 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  30 
 
 
340 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  30 
 
 
344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  27.13 
 
 
342 aa  147  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 
342 aa  147  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  29.19 
 
 
328 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  29.28 
 
 
324 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  28.21 
 
 
343 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  28.05 
 
 
342 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  27.22 
 
 
352 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  28.27 
 
 
342 aa  145  9e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  28.05 
 
 
342 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  29.64 
 
 
303 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  28.05 
 
 
342 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  28.13 
 
 
338 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1712  flagellar motor switch protein FliM  29.93 
 
 
309 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  0.0773135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  27.61 
 
 
342 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  28.26 
 
 
326 aa  144  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  31.03 
 
 
331 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  26.25 
 
 
341 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  27.24 
 
 
342 aa  142  9e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  27.19 
 
 
326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  28.21 
 
 
311 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  27.95 
 
 
337 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  27.04 
 
 
336 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  25.67 
 
 
339 aa  140  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  26.01 
 
 
336 aa  139  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>