220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4202 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
328 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  71.08 
 
 
328 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  68.1 
 
 
331 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  69.85 
 
 
325 aa  464  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  70.43 
 
 
325 aa  462  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  69.54 
 
 
325 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3100  flagellar motor switch protein FliM  67.38 
 
 
327 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  39.81 
 
 
325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  36.68 
 
 
326 aa  220  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  37.3 
 
 
326 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  36.76 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  37.3 
 
 
326 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  34.27 
 
 
324 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  32.91 
 
 
326 aa  189  8e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0581  flagellar motor switch protein FliM  33.74 
 
 
336 aa  185  9e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  31.65 
 
 
347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  31.76 
 
 
322 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  31.45 
 
 
322 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  31.76 
 
 
322 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  31.76 
 
 
322 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  31.76 
 
 
322 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  31.13 
 
 
322 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  32.19 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  31.29 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  32.29 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  31.29 
 
 
337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  31.13 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  32.1 
 
 
381 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  33.22 
 
 
343 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  32.11 
 
 
395 aa  172  9e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  32.51 
 
 
333 aa  171  2e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  32.86 
 
 
343 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  32.3 
 
 
323 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  32.86 
 
 
343 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  32.86 
 
 
343 aa  170  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  32.3 
 
 
323 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  30.16 
 
 
336 aa  169  4e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  31.64 
 
 
339 aa  167  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  30.84 
 
 
333 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  30.84 
 
 
334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  30.82 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  33.22 
 
 
349 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  30.19 
 
 
324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  32.98 
 
 
342 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  32.51 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  33.45 
 
 
348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  32.99 
 
 
348 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  29.57 
 
 
331 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  32.16 
 
 
341 aa  162  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  31.58 
 
 
354 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1169  flagellar biosynthesis protein, component of motor switch  29.14 
 
 
331 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  32.16 
 
 
342 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  29.78 
 
 
336 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  32.16 
 
 
342 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  32.16 
 
 
342 aa  160  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  28.66 
 
 
326 aa  159  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  29.72 
 
 
334 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  30.41 
 
 
342 aa  159  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  30.09 
 
 
338 aa  158  9e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  31.1 
 
 
341 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  31.23 
 
 
352 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  30.03 
 
 
334 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  31.8 
 
 
342 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  31.45 
 
 
352 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  31.69 
 
 
342 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  29.66 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  29.66 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  32.16 
 
 
343 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  28.27 
 
 
335 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  28.27 
 
 
335 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  29.39 
 
 
334 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  31.8 
 
 
342 aa  154  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 
334 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  29.32 
 
 
329 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  28.22 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  27.1 
 
 
332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  28.96 
 
 
328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  27.83 
 
 
335 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  29.19 
 
 
401 aa  147  3e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  26.38 
 
 
332 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  27.41 
 
 
332 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  27.73 
 
 
332 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  27.73 
 
 
332 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  27.73 
 
 
332 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  27.73 
 
 
332 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.73 
 
 
332 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.73 
 
 
332 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  27.73 
 
 
332 aa  146  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1756  flagellar motor switch protein FliM  29.35 
 
 
353 aa  145  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  28.88 
 
 
401 aa  145  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  27.46 
 
 
334 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1756  flagellar motor switch protein FliM  29.35 
 
 
353 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  27.86 
 
 
405 aa  143  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  27.73 
 
 
332 aa  144  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  30.14 
 
 
333 aa  143  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  27.41 
 
 
332 aa  143  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  27.1 
 
 
332 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  26.69 
 
 
332 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 
332 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 
332 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>