219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3100 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3100  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 327 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  79.88 
 
 		 328 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  67.38 
 
 		 328 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  68 
 
 		 325 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  64.65 
 
 		 331 aa  447  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  64.11 
 
 		 325 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  63.8 
 
 		 325 aa  424  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  36.36 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  34.8 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  34.48 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  35.11 
 
 		 326 aa  205  9e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  34.48 
 
 		 326 aa  202  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  32.92 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  32.49 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  31.03 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  31.97 
 
 		 322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0581  flagellar motor switch protein FliM  30.3 
 
 		 336 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  31.58 
 
 		 326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  31.35 
 
 		 322 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  31.35 
 
 		 322 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  31.35 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  31.58 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  31.58 
 
 		 337 aa  171  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  32.01 
 
 		 395 aa  170  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  30.46 
 
 		 322 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  30.15 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  29.54 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  31.46 
 
 		 334 aa  166  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  32.7 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  31.35 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  30.89 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  29.25 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  30.89 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  31.08 
 
 		 333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  31.25 
 
 		 343 aa  162  6e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  31.25 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  31.25 
 
 		 343 aa  162  7e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  32.41 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  30.67 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  30.67 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  30.58 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  30.49 
 
 		 354 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  31.54 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  30.67 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  30.25 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  30.12 
 
 		 334 aa  155  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  30.67 
 
 		 352 aa  155  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  28.74 
 
 		 331 aa  155  8e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  31.68 
 
 		 348 aa  154  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  30.37 
 
 		 342 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  31.48 
 
 		 333 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1169  flagellar biosynthesis protein, component of motor switch  27.49 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  30 
 
 		 336 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  30.41 
 
 		 334 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  29.56 
 
 		 329 aa  153  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  30.94 
 
 		 341 aa  153  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  29.45 
 
 		 352 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  31.03 
 
 		 343 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  29.14 
 
 		 341 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  32.41 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  30.87 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  30.63 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  29.97 
 
 		 334 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  30.63 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  29.69 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  29.69 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  29.69 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  28.88 
 
 		 335 aa  150  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  30.56 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  28.1 
 
 		 343 aa  149  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  29.87 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  29.38 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  30.09 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  30.09 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  30.09 
 
 		 334 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  29.45 
 
 		 339 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  30.07 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  28.28 
 
 		 375 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  28.67 
 
 		 352 aa  144  3e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  26.63 
 
 		 332 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  26.52 
 
 		 332 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 		 332 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  26.32 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1756  flagellar motor switch protein FliM  28.43 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  27.33 
 
 		 332 aa  139  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  26.93 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  28.67 
 
 		 376 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  26.93 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  26.93 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  26.46 
 
 		 332 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  26.01 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1509  flagellar motor switch protein FliM  28.81 
 
 		 404 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>