219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0581 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0581  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 336 aa  683    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1169  flagellar biosynthesis protein, component of motor switch  37.23 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  31.53 
 
 		 331 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  32.32 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  33.74 
 
 		 328 aa  185  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  30.91 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3100  flagellar motor switch protein FliM  30.3 
 
 		 327 aa  169  7e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  30.63 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  31.17 
 
 		 325 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  31.37 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  27.78 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  29.19 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  29.1 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  27.88 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  29.23 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  28.88 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  29.19 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  28.21 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  26.97 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  26.97 
 
 		 337 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  27.78 
 
 		 326 aa  142  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 		 342 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  28.84 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  28.84 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  28.53 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  28.84 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  27.27 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  27.9 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  28.66 
 
 		 395 aa  139  4.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  26.38 
 
 		 343 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  27.03 
 
 		 352 aa  138  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  25.55 
 
 		 334 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  28.35 
 
 		 336 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 		 352 aa  138  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  26.07 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  26.07 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  26.07 
 
 		 343 aa  137  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  27.19 
 
 		 343 aa  137  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  24.3 
 
 		 336 aa  136  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  25.16 
 
 		 337 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  24.4 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  24.4 
 
 		 335 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  25.88 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  26.46 
 
 		 334 aa  135  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  26.43 
 
 		 354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  29.47 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  29.38 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  26.15 
 
 		 333 aa  133  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  24.4 
 
 		 335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  26.22 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  26.22 
 
 		 342 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  26.22 
 
 		 342 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  27.02 
 
 		 341 aa  132  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 		 336 aa  132  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  27.22 
 
 		 381 aa  132  9e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  25.77 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  26.07 
 
 		 343 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  29.47 
 
 		 323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  26.97 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1547  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 		 343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  27.06 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  28.4 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  27.33 
 
 		 375 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  26.2 
 
 		 349 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  27.95 
 
 		 337 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  25.69 
 
 		 343 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  25.47 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  25.47 
 
 		 334 aa  130  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1756  flagellar motor switch protein FliM  28.27 
 
 		 353 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  24.16 
 
 		 335 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  27.55 
 
 		 332 aa  129  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  26.4 
 
 		 334 aa  129  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1756  flagellar motor switch protein FliM  28.27 
 
 		 353 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  25.23 
 
 		 350 aa  128  1.0000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2134  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1266  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  25.9 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2192  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  0.814379 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  25.16 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2139  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.002967 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  26.48 
 
 		 347 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1143  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 		 334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1703  flagellar motor switch protein FliM  26.54 
 
 		 334 aa  127  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0313377  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  22.88 
 
 		 338 aa  126  6e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  27.64 
 
 		 337 aa  126  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  24.84 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 		 348 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  25.15 
 
 		 342 aa  125  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  23.6 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  23.91 
 
 		 332 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  26.07 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  25.54 
 
 		 331 aa  124  3e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3568  flagellar motor switch protein FliM  26.67 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>