212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3568 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3568  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
332 aa  676    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  31.93 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  31.93 
 
 
326 aa  169  6e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  32.43 
 
 
326 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  29.66 
 
 
325 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  29.52 
 
 
326 aa  168  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  29.43 
 
 
333 aa  149  7e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  28.22 
 
 
324 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  31.27 
 
 
395 aa  145  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
328 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  28.01 
 
 
334 aa  139  7e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  26.65 
 
 
334 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
332 aa  136  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  26.36 
 
 
325 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  26.28 
 
 
325 aa  135  9e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  25.89 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  26.38 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  26.38 
 
 
335 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  24.7 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  27.44 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  24.7 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  24.7 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  24.7 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  27.86 
 
 
334 aa  133  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  27.22 
 
 
347 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  30.15 
 
 
381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  24.7 
 
 
332 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  26.41 
 
 
333 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  24.7 
 
 
332 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  25.6 
 
 
326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  24.39 
 
 
332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  24.39 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  25.67 
 
 
344 aa  129  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  26.13 
 
 
328 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  27.05 
 
 
334 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 
337 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
332 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  26.27 
 
 
335 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  24.32 
 
 
332 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  26.83 
 
 
334 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  27.05 
 
 
329 aa  127  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  26.28 
 
 
352 aa  125  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  26.57 
 
 
348 aa  125  7e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  27.11 
 
 
354 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
322 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  25.6 
 
 
336 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  25.15 
 
 
336 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  26.22 
 
 
338 aa  124  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  25.62 
 
 
326 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  25.53 
 
 
335 aa  123  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
322 aa  123  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  25.67 
 
 
336 aa  123  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0581  flagellar motor switch protein FliM  26.67 
 
 
336 aa  123  4e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  24.92 
 
 
334 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 
335 aa  123  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  26.09 
 
 
334 aa  123  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  26.09 
 
 
334 aa  123  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3100  flagellar motor switch protein FliM  25.9 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  25.53 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  25.53 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  26.52 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  24.39 
 
 
322 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  24.39 
 
 
322 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  25.87 
 
 
341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
332 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
343 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
343 aa  119  6e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
328 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  24.55 
 
 
323 aa  119  7e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  24.09 
 
 
322 aa  119  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
343 aa  119  9e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  24.17 
 
 
342 aa  119  9e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  23.78 
 
 
322 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
343 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
342 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
342 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
323 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
342 aa  116  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
332 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  23.24 
 
 
322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  23.48 
 
 
343 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 
343 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  22.55 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  22.55 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  22.55 
 
 
359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  24.02 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  24.38 
 
 
350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  24.17 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
331 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  24.02 
 
 
339 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>