216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2763 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
344 aa  700    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  61.61 
 
 
343 aa  430  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  57.14 
 
 
352 aa  395  1e-109  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  49.38 
 
 
335 aa  310  2e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  44.64 
 
 
333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  44.95 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  45.71 
 
 
334 aa  303  3.0000000000000004e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  42.02 
 
 
328 aa  291  9e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  43.96 
 
 
323 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  42.5 
 
 
329 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  39.21 
 
 
334 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  40.31 
 
 
334 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  41.44 
 
 
332 aa  281  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  42.24 
 
 
328 aa  277  2e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  42.9 
 
 
328 aa  268  7e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  42.24 
 
 
329 aa  268  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  39.38 
 
 
331 aa  263  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  40.79 
 
 
332 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  38.75 
 
 
325 aa  257  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  40.81 
 
 
327 aa  239  6.999999999999999e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  37.96 
 
 
334 aa  235  9e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  39.88 
 
 
329 aa  234  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  38.87 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  39.04 
 
 
328 aa  231  1e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  38.14 
 
 
328 aa  229  4e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  33.63 
 
 
372 aa  223  4e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  33.43 
 
 
359 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  33.43 
 
 
359 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  33.43 
 
 
359 aa  217  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  36.64 
 
 
366 aa  216  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  35.4 
 
 
359 aa  216  5e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  36.3 
 
 
367 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  32.95 
 
 
363 aa  214  1.9999999999999998e-54  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  35.52 
 
 
353 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  32.55 
 
 
363 aa  209  4e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  34.85 
 
 
375 aa  209  4e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  34.53 
 
 
348 aa  209  4e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  33.03 
 
 
325 aa  185  8e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  32.42 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  33.8 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  30.95 
 
 
314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  32.62 
 
 
326 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  32.62 
 
 
326 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  31.29 
 
 
351 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  33.45 
 
 
381 aa  169  8e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  31.68 
 
 
334 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  30.56 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  30.34 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  30.56 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  30.03 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  30.56 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  30.56 
 
 
322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  29.32 
 
 
322 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2334  flagellar motor switch protein FliM  30.43 
 
 
320 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  29.45 
 
 
324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  29.6 
 
 
336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  32.1 
 
 
323 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  29.75 
 
 
341 aa  160  4e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  28.1 
 
 
335 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  28.1 
 
 
335 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  30.58 
 
 
334 aa  159  6e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  28.82 
 
 
336 aa  159  7e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  31.27 
 
 
334 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  32 
 
 
323 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  31.69 
 
 
334 aa  157  2e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  31.06 
 
 
337 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  31.08 
 
 
395 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  31.06 
 
 
337 aa  158  2e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  29.38 
 
 
338 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 
326 aa  157  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  30.86 
 
 
333 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  28.22 
 
 
343 aa  157  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  31.69 
 
 
323 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  28.22 
 
 
343 aa  157  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  28.22 
 
 
343 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  28.22 
 
 
343 aa  156  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  27.51 
 
 
335 aa  155  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  29.75 
 
 
342 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  28.83 
 
 
343 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  28.53 
 
 
342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  30.56 
 
 
332 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  29.88 
 
 
334 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  27.52 
 
 
332 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  29.88 
 
 
334 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  27.52 
 
 
332 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 
332 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  27.52 
 
 
332 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  27.52 
 
 
332 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  27.52 
 
 
332 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  29.72 
 
 
334 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  26.61 
 
 
332 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  26.59 
 
 
326 aa  151  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  27.49 
 
 
342 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  28.53 
 
 
342 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  27.49 
 
 
342 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  27.61 
 
 
352 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  27.49 
 
 
342 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  27.52 
 
 
332 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  29.22 
 
 
333 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  27.52 
 
 
332 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>