224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2703 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 325 aa  661    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  47.2 
 
 		 329 aa  342  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  47.24 
 
 		 328 aa  328  9e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  44.48 
 
 		 328 aa  316  3e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  45.54 
 
 		 332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  41.1 
 
 		 333 aa  295  6e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  42.81 
 
 		 328 aa  294  2e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  39.94 
 
 		 334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  40.31 
 
 		 331 aa  270  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  35.91 
 
 		 323 aa  259  3e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  38.75 
 
 		 344 aa  257  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  40.3 
 
 		 343 aa  256  3e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  37.77 
 
 		 335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  36.96 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  38.99 
 
 		 334 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  37.54 
 
 		 352 aa  226  4e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  36.84 
 
 		 327 aa  222  8e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  33.23 
 
 		 331 aa  216  5e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  35.22 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  32.1 
 
 		 332 aa  210  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  32.21 
 
 		 334 aa  210  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  31.58 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  33.03 
 
 		 329 aa  204  2e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  35.83 
 
 		 328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  35.51 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  35.08 
 
 		 329 aa  196  5.000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  32.15 
 
 		 375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  30.82 
 
 		 372 aa  187  1e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  32.31 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  31.19 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  31.19 
 
 		 359 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  31.19 
 
 		 359 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  31.21 
 
 		 363 aa  183  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  30.79 
 
 		 366 aa  182  6e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  31.52 
 
 		 363 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  30.49 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  29.09 
 
 		 348 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  28.84 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 		 326 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  29.48 
 
 		 336 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  29.15 
 
 		 325 aa  151  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  30.37 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  29.14 
 
 		 335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  29.01 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 		 328 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  28.87 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  26.77 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  28.22 
 
 		 326 aa  142  7e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  28.48 
 
 		 351 aa  142  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  28.35 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  27.08 
 
 		 334 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 		 328 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  28.17 
 
 		 331 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  28.79 
 
 		 325 aa  135  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3568  flagellar motor switch protein FliM  25.89 
 
 		 332 aa  135  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  26.23 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  27.41 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  27.61 
 
 		 333 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  27.08 
 
 		 339 aa  133  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  25.62 
 
 		 324 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  27.47 
 
 		 334 aa  132  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1550  flagellar motor switch protein FliM  27.91 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000560769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1760  flagellar motor switch protein FliM  27.91 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1729  flagellar motor switch protein FliM  27.91 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  24.22 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1539  flagellar motor switch protein FliM  27.91 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.879101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  28.53 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  27.55 
 
 		 338 aa  130  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3615  flagellar motor switch protein FliM  27.91 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0073075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  28.07 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1378  flagellar motor switch protein FliM  28.75 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000132056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1586  flagellar motor switch protein FliM  27.91 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.676139  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3050  flagellar motor switch protein FliM  29.36 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3274  flagellar motor switch protein FliM  29.36 
 
 		 406 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  26.61 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  29.05 
 
 		 405 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3100  flagellar motor switch protein FliM  27.38 
 
 		 327 aa  129  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  23.91 
 
 		 332 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1783  flagellar motor switch protein FliM  27.91 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00985901  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1838  flagellar motor switch protein FliM  27.91 
 
 		 328 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000428754  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  26.15 
 
 		 334 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  26.23 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  29.57 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 		 332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  26.23 
 
 		 334 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  29.57 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  23.6 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0965  flagellar motor switch protein FliM  27.17 
 
 		 321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  23.6 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  23.6 
 
 		 332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  23.91 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  23.91 
 
 		 332 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>