218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0421 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 328 aa  672    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3100  flagellar motor switch protein FliM  79.88 
 
 		 327 aa  533  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  73.62 
 
 		 325 aa  487  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  69.3 
 
 		 331 aa  484  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  71.08 
 
 		 328 aa  483  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  65.54 
 
 		 325 aa  438  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  65.85 
 
 		 325 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  37.93 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  36.99 
 
 		 326 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  36.05 
 
 		 326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  36.68 
 
 		 326 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  36.68 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  34.16 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  33.23 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  32.92 
 
 		 326 aa  182  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  32.62 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  33.02 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  33.02 
 
 		 322 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  33.02 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0581  flagellar motor switch protein FliM  30.91 
 
 		 336 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  32.31 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  32.18 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  34.06 
 
 		 395 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  32 
 
 		 322 aa  175  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  33.96 
 
 		 332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  32.33 
 
 		 347 aa  172  9e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  32 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  32 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  32.71 
 
 		 334 aa  170  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  34.35 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  33.02 
 
 		 334 aa  168  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  34.35 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  32.92 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  32.7 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  31.17 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  31.17 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  31.56 
 
 		 336 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  32.92 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  31.08 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  32.42 
 
 		 343 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  31.13 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  32.39 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  31.13 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  32.1 
 
 		 335 aa  162  9e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  32.12 
 
 		 354 aa  162  9e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  31.71 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  29.48 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1169  flagellar biosynthesis protein, component of motor switch  27.71 
 
 		 331 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  31.6 
 
 		 348 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  31.71 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  31.71 
 
 		 343 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  31.4 
 
 		 343 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  32.21 
 
 		 352 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  32.32 
 
 		 381 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  31.6 
 
 		 348 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  31.29 
 
 		 352 aa  159  6e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  31.13 
 
 		 335 aa  159  7e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  31.4 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  31.4 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  31.13 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  29.5 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  31.13 
 
 		 334 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  30.09 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  30.09 
 
 		 334 aa  157  3e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  30.79 
 
 		 341 aa  155  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  30.49 
 
 		 341 aa  155  9e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1756  flagellar motor switch protein FliM  31.88 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  29.41 
 
 		 339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  31.71 
 
 		 342 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1756  flagellar motor switch protein FliM  31.52 
 
 		 353 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  30.42 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  31.1 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  30.18 
 
 		 342 aa  151  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  30.49 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  31.25 
 
 		 338 aa  150  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  30.49 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  28.96 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  30.49 
 
 		 342 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  30.89 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  31.61 
 
 		 342 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  28.13 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  27.91 
 
 		 332 aa  149  8e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  28.83 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  28.83 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  27.61 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  28.83 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  28.83 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  28.83 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  28.83 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  28.83 
 
 		 332 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  28.96 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  29.43 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  29.2 
 
 		 375 aa  146  4.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  28.53 
 
 		 332 aa  146  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  28.53 
 
 		 332 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  29.48 
 
 		 376 aa  145  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 		 325 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  28.53 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  28.09 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  28.53 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>