208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2840 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 384 aa  781    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  64.29 
 
 		 376 aa  466  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  61.07 
 
 		 401 aa  463  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  60.75 
 
 		 401 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1434  flagellar motor switch protein FliM  63.66 
 
 		 377 aa  457  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4420  flagellar motor switch protein FliM  60.66 
 
 		 400 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2564  flagellar motor switch protein FliM  66.88 
 
 		 374 aa  447  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5507  flagellar motor switch protein FliM  59.24 
 
 		 400 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1509  flagellar motor switch protein FliM  56.99 
 
 		 404 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1686  flagellar motor switch protein FliM  58.87 
 
 		 400 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157036  normal  0.0866038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3784  flagellar motor switch protein FliM  59.13 
 
 		 401 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4200  flagellar motor switch protein FliM  51.94 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4715  flagellar motor switch protein FliM  55.43 
 
 		 403 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0820  flagellar motor switch protein FliM  51.9 
 
 		 404 aa  411  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  normal  0.0356889 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  51.25 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3274  flagellar motor switch protein FliM  49.73 
 
 		 406 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3050  flagellar motor switch protein FliM  49.73 
 
 		 406 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3482  flagellar motor switch protein FliM  49.05 
 
 		 395 aa  336  5e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138981  normal  0.137747 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0973  flagellar motor switch protein FliM  47.24 
 
 		 337 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  32.98 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  32.62 
 
 		 344 aa  173  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  32.62 
 
 		 340 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1712  flagellar motor switch protein FliM  35.23 
 
 		 309 aa  170  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  0.0773135 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  29.97 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  29.56 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  30.06 
 
 		 354 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  32.26 
 
 		 326 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  32.62 
 
 		 303 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  30.56 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  30.84 
 
 		 349 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  29.97 
 
 		 326 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  28.34 
 
 		 326 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  29.32 
 
 		 352 aa  156  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  28.79 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  28.79 
 
 		 343 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  28.88 
 
 		 342 aa  154  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  25.94 
 
 		 332 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  28.79 
 
 		 343 aa  153  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  29.5 
 
 		 334 aa  153  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  28.3 
 
 		 333 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  29.1 
 
 		 343 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  29.54 
 
 		 311 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  27.95 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  26.56 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  27.95 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  26.56 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  26.56 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  28.35 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  29.28 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  25.77 
 
 		 332 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  26.25 
 
 		 332 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  27.04 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  27.04 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  27.04 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  27.04 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  26.56 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  29.41 
 
 		 343 aa  149  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  28.21 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  30.48 
 
 		 322 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  28.21 
 
 		 334 aa  149  9e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  25.94 
 
 		 332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  26.25 
 
 		 332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  26.88 
 
 		 332 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  27.85 
 
 		 334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  30.16 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  30.16 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  26.67 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  26.25 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 		 342 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  28.16 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  28.16 
 
 		 337 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  26.73 
 
 		 335 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  29.25 
 
 		 324 aa  146  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  26.5 
 
 		 334 aa  146  6e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  28.88 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 		 342 aa  146  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  29.34 
 
 		 395 aa  146  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  28.53 
 
 		 341 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 		 342 aa  146  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  28.48 
 
 		 343 aa  145  9e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  29.52 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 		 342 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  27.95 
 
 		 342 aa  145  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  28.53 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  28.44 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  29.34 
 
 		 338 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  27.13 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  26.71 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  27.27 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0019  surface presentation of antigens (SPOA) protein  27.21 
 
 		 314 aa  143  6e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  27.51 
 
 		 328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  28.66 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  28.35 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  26.48 
 
 		 329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2805  flagellar motor switch protein FliM  27.27 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  28.62 
 
 		 331 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>