205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0973 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0973  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
337 aa  676    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2840  flagellar motor switch protein FliM  47.96 
 
 
384 aa  290  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1944  flagellar motor switch protein FliM  47.96 
 
 
376 aa  274  1.0000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.829502  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2564  flagellar motor switch protein FliM  45.79 
 
 
374 aa  262  6.999999999999999e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.525902 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1434  flagellar motor switch protein FliM  47.3 
 
 
377 aa  259  6e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0820  flagellar motor switch protein FliM  45.71 
 
 
404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.223563  normal  0.0356889 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1386  flagellar motor switch protein FliM  44.62 
 
 
401 aa  252  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.449583  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1124  flagellar motor switch protein FliM  44.3 
 
 
401 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.571971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3784  flagellar motor switch protein FliM  43.03 
 
 
401 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1509  flagellar motor switch protein FliM  45.42 
 
 
404 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.645408  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4420  flagellar motor switch protein FliM  43.95 
 
 
400 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4715  flagellar motor switch protein FliM  45.2 
 
 
403 aa  246  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179233  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1686  flagellar motor switch protein FliM  43.63 
 
 
400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.157036  normal  0.0866038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4200  flagellar motor switch protein FliM  44.48 
 
 
403 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.592562  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3248  flagellar motor switch protein FliM  44.12 
 
 
405 aa  242  6e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3050  flagellar motor switch protein FliM  44.12 
 
 
406 aa  240  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3274  flagellar motor switch protein FliM  44.12 
 
 
406 aa  240  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5507  flagellar motor switch protein FliM  42.09 
 
 
400 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.485441  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3482  flagellar motor switch protein FliM  39.68 
 
 
395 aa  231  2e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.138981  normal  0.137747 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1712  flagellar motor switch protein FliM  30.85 
 
 
309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0907404  normal  0.0773135 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1089  flagellar motor switch protein FliM  29.63 
 
 
311 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3213  flagellar motor switch protein FliM  30.85 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.466453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0621  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 
335 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0653  surface presentation of antigens (SPOA) protein  28.57 
 
 
340 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.115934 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0642  flagellar motor switch protein FliM  28.72 
 
 
344 aa  122  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.169011  normal  0.290424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2805  flagellar motor switch protein FliM  24.59 
 
 
313 aa  122  7e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  28.7 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0019  surface presentation of antigens (SPOA) protein  28.42 
 
 
314 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  27.08 
 
 
352 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  27.38 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  25.16 
 
 
339 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  27.38 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  26.75 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  26.46 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 
395 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  26.85 
 
 
343 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  26.54 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  26.02 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  24.92 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3100  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  28.27 
 
 
326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 
343 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 
343 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  25.38 
 
 
343 aa  110  5e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
342 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  26.26 
 
 
343 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  27.36 
 
 
326 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  25.97 
 
 
336 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  25.77 
 
 
342 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  25.77 
 
 
342 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  25.77 
 
 
342 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
348 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  27.73 
 
 
336 aa  106  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  25.7 
 
 
348 aa  106  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
343 aa  106  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  26.62 
 
 
342 aa  105  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  27.62 
 
 
326 aa  105  8e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  25.9 
 
 
342 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 
342 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  24.77 
 
 
349 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  27.18 
 
 
326 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  25.9 
 
 
331 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  26.13 
 
 
323 aa  104  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  22.6 
 
 
328 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  23.05 
 
 
335 aa  103  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  24.05 
 
 
325 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 
341 aa  102  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  27.21 
 
 
326 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  23.73 
 
 
325 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  25.94 
 
 
324 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  25.15 
 
 
347 aa  101  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  26.57 
 
 
322 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  25.97 
 
 
322 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  23.58 
 
 
326 aa  100  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  23.84 
 
 
325 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  25.67 
 
 
322 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  25.67 
 
 
322 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  24.48 
 
 
322 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  25.18 
 
 
342 aa  97.8  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  25.82 
 
 
323 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  25.82 
 
 
323 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  25.15 
 
 
333 aa  96.3  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  25.16 
 
 
333 aa  94.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  23.22 
 
 
328 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  23.58 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  23.88 
 
 
322 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  23.55 
 
 
329 aa  92.8  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  22.57 
 
 
335 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  21.65 
 
 
332 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  22.57 
 
 
335 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  21.65 
 
 
332 aa  92  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  23.4 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  22.26 
 
 
334 aa  91.3  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  23.01 
 
 
372 aa  91.7  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  20.43 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  26.12 
 
 
381 aa  90.9  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  20.55 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  20.55 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  20.55 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  20.55 
 
 
332 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>