173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0150 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0150  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 
302 aa  585  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  29.37 
 
 
314 aa  122  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0965  flagellar motor switch protein FliM  30.69 
 
 
321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  23.51 
 
 
332 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2979  surface presentation of antigens (SPOA) protein  33.11 
 
 
298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.475386 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  25.94 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  26.1 
 
 
329 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2334  flagellar motor switch protein FliM  28.83 
 
 
320 aa  112  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0746  flagellar motor switch protein FliM  31.01 
 
 
335 aa  109  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  25.99 
 
 
328 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  25.17 
 
 
325 aa  107  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  26.8 
 
 
323 aa  106  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  24.92 
 
 
330 aa  106  6e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  24.07 
 
 
331 aa  105  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  26.64 
 
 
335 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 
344 aa  102  8e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  25.09 
 
 
343 aa  102  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  27.12 
 
 
331 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  24.83 
 
 
352 aa  97.4  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  24.48 
 
 
359 aa  97.1  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2014  flagellar motor switch protein FliM  24.57 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  23.51 
 
 
334 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1663  flagellar motor switch protein FliM  29.72 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.327123  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  28.98 
 
 
327 aa  94  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  26.25 
 
 
329 aa  90.5  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  27.27 
 
 
334 aa  89.4  7e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  23.96 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31090  flagellar motor switch protein  27.48 
 
 
315 aa  86.3  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  0.579605 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  23.05 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  23.34 
 
 
328 aa  85.5  0.000000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  24.23 
 
 
348 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  24.9 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  23.93 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  23.73 
 
 
329 aa  81.3  0.00000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  22.22 
 
 
328 aa  80.5  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  23.41 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  23.41 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  23.41 
 
 
359 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  24.66 
 
 
328 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  23.21 
 
 
366 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  23.47 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  22.97 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  23.47 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  24.51 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  23.94 
 
 
353 aa  75.9  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  22.6 
 
 
363 aa  75.9  0.0000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1703  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0313377  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  21.05 
 
 
372 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  23.31 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2139  flagellar motor switch protein FliM  23.49 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002967 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2134  flagellar motor switch protein FliM  23.49 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1143  flagellar motor switch protein FliM  23.49 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1266  flagellar motor switch protein FliM  23.49 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2192  flagellar motor switch protein FliM  23.49 
 
 
334 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  0.814379 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  23.33 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  24.56 
 
 
351 aa  72.8  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0581  flagellar motor switch protein FliM  22.76 
 
 
336 aa  72.8  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2536  flagellar motor switch protein FliM  22.66 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2399  flagellar motor switch protein FliM  21.79 
 
 
333 aa  70.5  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.569338  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  24.52 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0062  surface presentation of antigens (SPOA) protein  26.1 
 
 
322 aa  70.1  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  24.57 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2299  flagellar motor switch protein FliM  22.48 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  21.9 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  23.37 
 
 
322 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  27.42 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  22.15 
 
 
333 aa  68.9  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1756  flagellar motor switch protein FliM  25.99 
 
 
353 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  22.04 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  22.37 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  22.37 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1547  flagellar motor switch protein FliM  22.5 
 
 
343 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  23.32 
 
 
322 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  25 
 
 
326 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  22.03 
 
 
343 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1756  flagellar motor switch protein FliM  25.55 
 
 
353 aa  65.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  22.39 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  22.07 
 
 
343 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  22.03 
 
 
352 aa  65.9  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  22.18 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  22.18 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  22.18 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  23.23 
 
 
375 aa  65.1  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  24.22 
 
 
326 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  22.18 
 
 
342 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  22.01 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  22.01 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  22.01 
 
 
322 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  21.68 
 
 
352 aa  63.5  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  22.45 
 
 
326 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  24.23 
 
 
348 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  24.49 
 
 
343 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  23.21 
 
 
348 aa  63.2  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  26.91 
 
 
337 aa  62.4  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  26.91 
 
 
337 aa  62.4  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  20.78 
 
 
335 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>