197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31090 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31090  flagellar motor switch protein  100 
 
 		 315 aa  634    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.854888  normal  0.579605 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2014  flagellar motor switch protein FliM  56.71 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2979  surface presentation of antigens (SPOA) protein  42.72 
 
 		 298 aa  224  2e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.475386 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  39.32 
 
 		 314 aa  195  9e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0746  flagellar motor switch protein FliM  37.33 
 
 		 335 aa  186  4e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0965  flagellar motor switch protein FliM  36.36 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2334  flagellar motor switch protein FliM  36.67 
 
 		 320 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1663  flagellar motor switch protein FliM  38.7 
 
 		 314 aa  168  9e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.327123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  31.77 
 
 		 344 aa  133  3e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  29.84 
 
 		 333 aa  125  8.000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  29.04 
 
 		 329 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  28.38 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  25.87 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  30.61 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  30.94 
 
 		 343 aa  117  3e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  29.24 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  26.99 
 
 		 359 aa  115  6.9999999999999995e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  27.53 
 
 		 329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  26.6 
 
 		 352 aa  114  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  25.68 
 
 		 331 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  24.49 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  28.52 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  27.93 
 
 		 327 aa  108  9.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  24.21 
 
 		 348 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  27.8 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  22.15 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  26.21 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  27.27 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  26.19 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  25.42 
 
 		 332 aa  99.8  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  23.57 
 
 		 372 aa  99  8e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  24.74 
 
 		 334 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  23.86 
 
 		 330 aa  95.1  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1169  flagellar biosynthesis protein, component of motor switch  24.07 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  25.36 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  25.54 
 
 		 325 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  26.22 
 
 		 328 aa  89.4  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  24.56 
 
 		 347 aa  87.4  3e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  25.54 
 
 		 325 aa  87  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  25.87 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  23.51 
 
 		 363 aa  85.9  7e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  22.18 
 
 		 334 aa  85.9  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  23.9 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  26.51 
 
 		 326 aa  84.7  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  25.66 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  26.98 
 
 		 363 aa  83.6  0.000000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  24.09 
 
 		 326 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  27.51 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  26.52 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  26.52 
 
 		 359 aa  82.8  0.000000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  26.52 
 
 		 359 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  24.65 
 
 		 325 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  24.65 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  22.7 
 
 		 325 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  28.29 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  23.83 
 
 		 328 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  23.15 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  25.6 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  24.87 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  24.75 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  24.75 
 
 		 337 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  22.38 
 
 		 328 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0581  flagellar motor switch protein FliM  22.76 
 
 		 336 aa  77  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  22.46 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  25.26 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  25.26 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  24.57 
 
 		 322 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  25.26 
 
 		 322 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  23.64 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  23.64 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  22.22 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  21.84 
 
 		 354 aa  73.2  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  23.57 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  22.58 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  21.28 
 
 		 352 aa  72  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  22.99 
 
 		 326 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1636  flagellar motor switch protein FliM  22.99 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  25.61 
 
 		 332 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  23.53 
 
 		 334 aa  70.5  0.00000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  23.26 
 
 		 326 aa  70.1  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  28.07 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  27.75 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  22.82 
 
 		 352 aa  69.7  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  23.43 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  22.85 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  24.48 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  22.35 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  22.05 
 
 		 348 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  24.67 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  24.49 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  27.27 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  24.66 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  22.34 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  22.73 
 
 		 341 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  22.06 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  21.59 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  21.59 
 
 		 342 aa  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  21.59 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  21.59 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2134  flagellar motor switch protein FliM  22.62 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.08804 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>