220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2381 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
330 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  55.86 
 
 
332 aa  378  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  52.62 
 
 
334 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  51.09 
 
 
327 aa  343  2e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  49.53 
 
 
323 aa  331  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  43.43 
 
 
328 aa  286  4e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  42.02 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  38.7 
 
 
329 aa  253  3e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  42.38 
 
 
343 aa  247  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  38.77 
 
 
331 aa  246  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  38.87 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  37.69 
 
 
334 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  36.45 
 
 
328 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  35.09 
 
 
332 aa  223  4e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  35.69 
 
 
334 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  36.31 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  36.96 
 
 
335 aa  219  6e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  38.05 
 
 
334 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  36.17 
 
 
352 aa  211  1e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  36.36 
 
 
331 aa  207  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  31.58 
 
 
325 aa  206  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  36.42 
 
 
329 aa  204  1e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  38.08 
 
 
328 aa  203  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  37.77 
 
 
328 aa  202  8e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  34.84 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  34.84 
 
 
366 aa  200  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  33.55 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  31.83 
 
 
372 aa  195  7e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  34.3 
 
 
363 aa  195  7e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  32.04 
 
 
359 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  32.04 
 
 
359 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  32.04 
 
 
359 aa  193  3e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  35.31 
 
 
359 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  32.26 
 
 
363 aa  188  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  32.44 
 
 
375 aa  182  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  33.64 
 
 
329 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  31.23 
 
 
326 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  30.96 
 
 
348 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  30.06 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  31.76 
 
 
326 aa  159  9e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  30.82 
 
 
326 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  30.31 
 
 
325 aa  150  3e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1663  flagellar motor switch protein FliM  31.72 
 
 
314 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.327123  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  31.82 
 
 
347 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1636  flagellar motor switch protein FliM  25.63 
 
 
329 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240245  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  28.76 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  27.43 
 
 
334 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0965  flagellar motor switch protein FliM  29.03 
 
 
321 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  27.04 
 
 
322 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  27.73 
 
 
334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  26.74 
 
 
335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  26.74 
 
 
335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  25.56 
 
 
326 aa  130  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  28.84 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  26.02 
 
 
342 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2334  flagellar motor switch protein FliM  31.06 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  26.42 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  27.27 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  26.1 
 
 
322 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  26.1 
 
 
322 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  26.1 
 
 
322 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0062  surface presentation of antigens (SPOA) protein  24.15 
 
 
322 aa  125  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  25.79 
 
 
322 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  26.57 
 
 
381 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  25.79 
 
 
322 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  28.18 
 
 
333 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  25.96 
 
 
326 aa  124  3e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  26.65 
 
 
348 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  27.49 
 
 
328 aa  123  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  26.33 
 
 
348 aa  123  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  25.16 
 
 
341 aa  123  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  24.69 
 
 
324 aa  123  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  23.36 
 
 
329 aa  123  5e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  26.48 
 
 
337 aa  122  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  27.3 
 
 
351 aa  122  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  26.48 
 
 
337 aa  122  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  23.47 
 
 
339 aa  121  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  26.36 
 
 
338 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  26.33 
 
 
343 aa  121  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1569  flagellar motor switch protein FliM  29.39 
 
 
338 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.278688  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  24.84 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  24.13 
 
 
332 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  25.71 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2536  flagellar motor switch protein FliM  29 
 
 
334 aa  121  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  25.47 
 
 
342 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  24.07 
 
 
333 aa  120  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  24.84 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  24.84 
 
 
343 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  24.07 
 
 
335 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  24.84 
 
 
343 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  24.83 
 
 
332 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  24.48 
 
 
332 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  24.48 
 
 
334 aa  119  7.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  24.48 
 
 
332 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  28.44 
 
 
333 aa  119  9e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  24.83 
 
 
332 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  23.77 
 
 
334 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2139  flagellar motor switch protein FliM  28.48 
 
 
334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  24.45 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  25.26 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>