219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0250 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0250  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 		 328 aa  663    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0252  flagellar motor switch protein FliM  98.17 
 
 		 328 aa  656    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1298  flagellar motor switch protein FliM  54.55 
 
 		 329 aa  335  7e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1532  flagellar motor switch protein FliM  53.35 
 
 		 329 aa  318  7e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0113  flagellar motor switch protein FliM  48.43 
 
 		 359 aa  295  9e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0436581  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1405  flagellar motor switch protein FliM  43.93 
 
 		 333 aa  276  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.322008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2161  flagellar motor switch protein FliM  42.5 
 
 		 329 aa  260  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.287606  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0861  hypothetical protein  43.17 
 
 		 328 aa  258  7e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1681  flagellar motor switch protein FliM  42.6 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0804  flagellar motor switch protein FliM  40.81 
 
 		 323 aa  253  3e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1937  flagellar motor switch protein FliM  40.62 
 
 		 343 aa  242  7.999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2763  flagellar motor switch protein FliM  38.14 
 
 		 344 aa  239  4e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4143  flagellar motor switch protein FliM  38.44 
 
 		 331 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2018  flagellar motor switch protein FliM  42.86 
 
 		 327 aa  238  9e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16750  flagellar motor switch protein FliM  40.8 
 
 		 334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2039  flagellar motor switch protein FliM  39.06 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0358231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1402  flagellar motor switch protein FliM  38.18 
 
 		 331 aa  226  4e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1737  flagellar motor switch protein FliM  38.25 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2381  flagellar motor switch protein FliM  38.39 
 
 		 330 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1122  flagellar motor switch protein FliM  38.55 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2703  flagellar motor switch protein FliM  36.45 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.250527  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0477  flagellar motor switch protein FliM  37.07 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00127431  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0716  flagellar motor switch protein FliM  36.86 
 
 		 334 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2014  flagellar motor switch protein FliM  36.59 
 
 		 334 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0284  flagellar motor switch protein FliM  37.85 
 
 		 352 aa  210  2e-53  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0707  flagellar motor switch protein FliM  35.89 
 
 		 372 aa  206  6e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1323  flagellar motor switch protein FliM  37.3 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2500  flagellar motor switch protein FliM  35.99 
 
 		 375 aa  202  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.564591  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1512  flagellar motor switch protein FliM  32.71 
 
 		 363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0297  flagellar motor switch protein FliM  32.92 
 
 		 353 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000388238  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1439  flagellar motor switch protein FliM  31.99 
 
 		 366 aa  187  3e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000909071  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0057  flagellar motor switch protein FliM  31.46 
 
 		 359 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0098  flagellar motor switch protein FliM  31.46 
 
 		 359 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0070  flagellar motor switch protein FliM  31.46 
 
 		 359 aa  186  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1020  flagellar motor switch protein FliM  32 
 
 		 367 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0820225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0768  flagellar motor switch protein FliM  36.86 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0237  flagellar motor switch protein FliM  31.37 
 
 		 363 aa  183  3e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0854  flagellar motor switch protein FliM  29.7 
 
 		 314 aa  145  6e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.631553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2014  flagellar motor switch protein FliM  32.36 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2074  flagellar motor switch protein FliM  27.24 
 
 		 326 aa  143  5e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0666183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2734  flagellar motor switch protein FliM  28.17 
 
 		 325 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1836  flagellar motor switch protein FliM  26.93 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1396  flagellar motor switch protein FliM  27.86 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2334  flagellar motor switch protein FliM  30 
 
 		 320 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213081  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0421  flagellar motor switch protein FliM  28.4 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.507489  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0412  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 		 351 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988738 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0746  flagellar motor switch protein FliM  29.12 
 
 		 335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.445125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3293  flagellar motor switch protein FliM  27.84 
 
 		 331 aa  125  7e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2708  flagellar motor switch protein FliM  27.91 
 
 		 326 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.944931  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  27.71 
 
 		 326 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0581  flagellar motor switch protein FliM  27.54 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  26.81 
 
 		 336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3911  flagellar motor switch protein FliM  28.92 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0263522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  28.57 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0965  flagellar motor switch protein FliM  28.79 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3827  flagellar motor switch protein FliM  28.61 
 
 		 325 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  25.67 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  27.91 
 
 		 334 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  27.8 
 
 		 381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  25.99 
 
 		 324 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3568  flagellar motor switch protein FliM  27.58 
 
 		 332 aa  115  6.9999999999999995e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1169  flagellar biosynthesis protein, component of motor switch  24.01 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  25.08 
 
 		 335 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1636  flagellar motor switch protein FliM  26.2 
 
 		 329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.240245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4202  flagellar motor switch protein FliM  27.25 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3100  flagellar motor switch protein FliM  26.73 
 
 		 327 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  25.97 
 
 		 335 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  27.93 
 
 		 338 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  25.6 
 
 		 354 aa  110  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  25.54 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  24.92 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  25.23 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  24.38 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  24.62 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  24.31 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  24.62 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  26.52 
 
 		 335 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  28.09 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  28.09 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  28.09 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  28.09 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  28.09 
 
 		 334 aa  109  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1703  flagellar motor switch protein FliM  28.09 
 
 		 334 aa  109  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0313377  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  26.88 
 
 		 332 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1547  flagellar motor switch protein FliM  29.31 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  26.88 
 
 		 332 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  29.05 
 
 		 337 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3437  flagellar motor switch protein FliM  27.05 
 
 		 325 aa  108  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  25.54 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  26.49 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  26.88 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1663  flagellar motor switch protein FliM  29.34 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.327123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  26.56 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  26.56 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  28.4 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  26.88 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  26.88 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  26.88 
 
 		 332 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2299  flagellar motor switch protein FliM  29.54 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>