211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2280 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2280  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 151 aa  298  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0283  flagellar switch protein FliY  33.02 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1658  flagellar motor switch protein FliN  38.16 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0062  surface presentation of antigens (SPOA) protein  39.13 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1322  flagellar motor switch protein FliN  36.23 
 
 		 375 aa  57  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  39.13 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1310  hypothetical protein  38.96 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2970  surface presentation of antigens (SPOA) protein  38.96 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.450675 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2743  surface presentation of antigens (SPOA) protein  37.66 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.207596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  37.68 
 
 		 249 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2333  flagellar motor switch protein FliN  36.23 
 
 		 250 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0940353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  29.55 
 
 		 118 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  33.78 
 
 		 249 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  29.17 
 
 		 118 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1459  flagellar motor switch protein FliN  36.23 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.717183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1938  flagellar motor switch protein FliN  30.43 
 
 		 359 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31080  flagellar motor switch protein FliN  30.85 
 
 		 247 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.713514  normal  0.558701 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  33.33 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  31.51 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  29.21 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3592  surface presentation of antigens (SPOA) protein  36.23 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0305  flagellar motor switch protein FliN  31.94 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  33.68 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1531  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.78 
 
 		 357 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0249  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  34.78 
 
 		 346 aa  50.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2978  flagellar motor switch protein FliN  32.91 
 
 		 238 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.563329 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0251  CheC, inhibitor of MCP methylation  34.78 
 
 		 346 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  28.92 
 
 		 175 aa  50.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  30.26 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  37.68 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1635  flagellar motor switch FliN  37.93 
 
 		 252 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.115471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0862  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.27 
 
 		 398 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0855  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 123 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.172432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0174  flagellar motor switch protein FliN  31.58 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1702  flagellar motor switch protein FliN  34.15 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000907552  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  30.43 
 
 		 372 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2723  flagellar motor switch protein FliN  34.15 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0704854  normal  0.317166 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1238  flagellar motor switch protein FliN  34.15 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.133965  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  30.67 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  30.77 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2945  surface presentation of antigens (SPOA) protein  34.67 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.429594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0055  flagellar motor switch protein FliN  32.43 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1067  flagellar motor switch protein FliN  34.15 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000602287  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  28.24 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2179  flagellar motor switch protein FliN  34.15 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000312484  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2046  flagellar motor switch protein FliN  34.15 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00538012  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  34.15 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1696  flagellar motor switch protein FliN  34.15 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.433623  normal  0.0279018 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2013  flagellar motor switch protein FliN  34.78 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1299  CheC, inhibitor of MCP methylation  33.33 
 
 		 370 aa  49.3  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  24.55 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2035  surface presentation of antigens (SPOA) protein  31.71 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.853353  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  30.12 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  23.08 
 
 		 375 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1123  flagellar motor switch protein  29.33 
 
 		 401 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  24.55 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1750  flagellar motor switch protein  28 
 
 		 546 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  29.87 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1344  flagellar motor switch protein  27.45 
 
 		 554 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2015  flagellar motor switch protein  31.88 
 
 		 393 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  29.87 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  28 
 
 		 548 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  29.87 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2017  flagellar motor switch protein  36.36 
 
 		 360 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1544  flagellar motor switch protein  28 
 
 		 546 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1519  flagellar motor switch protein  28 
 
 		 546 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1508  flagellar motor switch protein  28 
 
 		 546 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1729  flagellar motor switch protein  28 
 
 		 546 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1662  flagellar motor switch protein  28 
 
 		 546 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80774  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4069  flagellar motor switch protein FliN  30.43 
 
 		 189 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.810666  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  28 
 
 		 546 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1151  flagellar motor switch protein fliY  25 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1807  flagellar motor switch protein  28 
 
 		 546 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.35056  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  28 
 
 		 545 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  28.99 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2140  flagellar motor switch protein FliN  32.93 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00280572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1265  flagellar motor switch protein FliN  32.93 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1142  flagellar motor switch protein FliN  32.93 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0539046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  28.57 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2193  flagellar motor switch protein FliN  32.93 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2135  flagellar motor switch protein FliN  32.93 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.120788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1873  flagellar motor switch protein  29.81 
 
 		 115 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0944  flagellar motor switch protein  29.13 
 
 		 116 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.342827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  28.57 
 
 		 130 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0683  flagellar motor switch protein  30.14 
 
 		 118 aa  47.4  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.455198  normal  0.747466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1406  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  33.33 
 
 		 422 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.545677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2955  flagellar motor switch protein FliN  33.33 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2762  flagellar motor switch protein FliY  30.43 
 
 		 393 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4142  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  28.57 
 
 		 417 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3843  flagellar motor switch protein  27.18 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0103448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0248  flagellar motor switch protein FliN  27.78 
 
 		 215 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00193923  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0375  flagellar motor switch protein FliN  27.66 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1883  flagellar motor switch protein FliN  32 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1275  flagellar motor switch protein  27.18 
 
 		 116 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.665997  normal  0.991309 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2583  flagellar motor switch protein FliN  32 
 
 		 137 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4220  flagellar motor switch protein FliN  31.88 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.278556  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1460  flagellar motor switch protein  27.18 
 
 		 115 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.775368  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2300  flagellar motor switch protein FliN  32 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3461  flagellar motor switch protein FliN  30.61 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.5644  normal  0.0306476 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2400  flagellar motor switch protein FliN  32 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>