23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0062 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0062  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 103 aa  200  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2280  surface presentation of antigens (SPOA) protein  39.13 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2928  flagellar motor switch FliN  26.26 
 
 		 111 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0964  flagellar motor switch protein FliN  30.34 
 
 		 249 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0055  flagellar motor switch protein FliN  36.99 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1658  flagellar motor switch protein FliN  35.06 
 
 		 194 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  30.59 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0745  flagellar motor switch protein FliN  28.77 
 
 		 246 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1664  flagellar motor switch protein FliN  29.73 
 
 		 249 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.793475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0151  flagellar motor switch protein FliN  25.61 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16740  CheC, inhibitor of MCP methylation  26.51 
 
 		 375 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00409298  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  28.57 
 
 		 175 aa  41.6  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1015  flagellar motor switch protein  28.77 
 
 		 111 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0542  flagellar motor switch protein  22.68 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.20621  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1696  flagellar motor switch protein FliN  29.49 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449848 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1649  flagellar motor switch protein FliN  29.49 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211247  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0061  flagellar motor switch FliN protein  29.49 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.517527  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0411  flagellar motor switch protein FliN  28.57 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.860809 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1548  flagellar motor switch protein  27.4 
 
 		 548 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1168  putative flagellar motor switch protein FliN  32 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0114  CheC, inhibitor of MCP methylation / FliN fusion protein  27.03 
 
 		 372 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00175388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3649  flagellar motor switch protein  27.4 
 
 		 545 aa  40  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1697  flagellar motor switch protein  27.4 
 
 		 546 aa  40  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>