246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0246 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0246  lateral flagellar export/assembly protein LfiN  100 
 
 		 123 aa  238  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3386  surface presentation of antigens (SPOA) protein  97.56 
 
 		 123 aa  233  6e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0707  flagellar motor switch protein FliN  62.07 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00348203  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0238  flagellar switch protein  62.07 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.137291  normal  0.0537834 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0627  flagellar motor switch protein FliN  64.2 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001181  flagellar motor switch protein FliN  48.74 
 
 		 123 aa  93.6  7e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04968  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  62.86 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0168  flagellar motor switch protein FliN  49.49 
 
 		 115 aa  88.2  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0217  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein  52.38 
 
 		 115 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4421  flagellar motor switch protein FliN  57.75 
 
 		 123 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.465417 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4649  flagellar motor switch protein FliN  42.98 
 
 		 113 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.519755  normal  0.588244 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0088  flagellar motor switch protein FliN  40.2 
 
 		 118 aa  79  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4357  flagellar motor switch protein  55.56 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.146422  normal  0.629251 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3919  flagellar motor switch protein  55.56 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0082  flagellar motor switch protein FliN  46.48 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1509  flagellar motor switch protein  55.56 
 
 		 154 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.785237  normal  0.0757312 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0976  flagellar motor switch protein FliN  50.79 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.232649  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3683  flagellar motor switch protein  55.56 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0262858  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1970  flagellar motor switch protein FliN  41.07 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.18125  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3446  flagellar motor switch protein  53.97 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.686911  normal  0.950111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3883  flagellar motor switch protein  53.97 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.444092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45790  flagellar motor switch protein  53.97 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1547  flagellar motor switch protein  53.97 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0443324  normal  0.531569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3663  surface presentation of antigens (SPOA) protein  46.84 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0486  flagellar motor switch protein FliN  50.79 
 
 		 174 aa  73.9  0.0000000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.182803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1986  flagellar motor switch protein  52.38 
 
 		 166 aa  73.6  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.958214  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2814  flagellar motor switch protein  52.38 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.535531  normal  0.0823858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1329  flagellar motor switch protein FliN  49.21 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.101515  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2174  surface presentation of antigens (SpoA) protein  52.38 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2164  surface presentation of antigens (SPOA) protein  45.71 
 
 		 143 aa  72  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1350  flagellar motor switch protein  42.27 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0172691  normal  0.386045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3983  surface presentation of antigens (SPOA) protein  45.21 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3480  flagellar motor switch protein FliN  45.83 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0708  flagellar motor switch protein FliN  42.86 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3436  flagellar motor switch protein FliN  47.76 
 
 		 153 aa  71.2  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2568  flagellar motor switch protein  42.27 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4176  flagellar motor switch protein FliN  47.06 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2928  flagellar motor switch protein  42.27 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3060  flagellar motor switch protein  42.27 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.255596  normal  0.369101 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2918  flagellar motor switch protein  42.27 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1445  flagellar motor switch protein  42.27 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0098879  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002823  flagellar motor switch protein FliN  42.27 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02879  flagellar motor switch protein  49.21 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3220  flagellar motor switch protein  41.24 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0061  flagellar motor switch FliN protein  45.45 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.517527  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3223  Type III secretion system outer membrane O protein  34.21 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.248269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3039  flagellar motor switch protein  49.21 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1290  flagellar motor switch protein  41.24 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.471773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1357  flagellar motor switch protein  41.24 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24150  Flagellar motor switch protein  39.58 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03153  flagellar motor switch protein  42.27 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2289  flagellar motor switch protein  49.21 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.912954 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1696  flagellar motor switch protein FliN  45.45 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000449848 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0377  flagellar motor switch protein FliN  49.21 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3058  flagellar motor switch protein  49.21 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.173815  normal  0.141137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5883  Type III secretion system outer membrane O protein  41.03 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.6073  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1431  Type III secretion system outer membrane O protein  49.21 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1353  surface presentation of antigens (SPOA) protein  49.21 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1334  flagellar motor switch protein  49.21 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1963  flagellar motor switch FliN  47.22 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5299  flagellar motor switch FliN  41.03 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.934631  normal  0.10372 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1190  flagellar motor switch protein  49.21 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1369  flagellar motor switch protein  49.21 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0582  flagellar motor switch protein FliN  50.79 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0042  flagellar motor switch protein FliN  35.51 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1374  flagellar motor switch protein  49.21 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.480393  normal  0.143651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1649  flagellar motor switch protein FliN  45.07 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.211247  normal  0.704014 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1680  flagellar motor switch protein  38.3 
 
 		 375 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4755  flagellar motor switch protein FliN  47.06 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.853225 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3678  flagellar motor switch protein FliN  47.06 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0028  flagellar motor switch protein FliN  35.71 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182038  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1970  flagellar motor switch FliN  49.21 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.222538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0031  flagellar motor switch protein FliN  35.58 
 
 		 161 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0040  flagellar motor switch protein FliN  34.86 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1626  flagellar motor switch protein  49.21 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2763  flagellar motor switch protein FliN  45.59 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0241  flagellar motor switch protein FliN  45.59 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.593105  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1166  flagellar motor switch protein FliN  47.62 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.256199  normal  0.0772727 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0031  flagellar motor switch FliN  34.86 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0039  flagellar motor switch protein FliN  34.86 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3496  flagellar motor switch protein FliN  45.59 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1866  flagellar motor switch protein FliN  45.59 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.996713  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0030  flagellar motor switch protein FliN  47.62 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0030  flagellar motor switch protein FliN  47.62 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2686  flagellar motor switch protein FliN  45.59 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0058  flagellar motor switch protein FliN  34.86 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2300  flagellar motor switch protein  47.62 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00973  flagellar protein  47.62 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0380826  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2939  flagellar motor switch protein FliN  45.59 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06193  flagellar protein  47.62 
 
 		 112 aa  67.8  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0573  flagellar motor switch protein  36.63 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0422  flagellar motor switch protein FliN  48.44 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1608  flagellar motor switch/type III secretory pathway protein FliN  49.21 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429927  normal  0.0945773 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1459  flagellar motor switch protein FliN  44.87 
 
 		 107 aa  67.4  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.717183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1024  flagellar motor switch protein FliN  40 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3778  flagellar motor switch protein FliN  46.03 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3099  flagellar motor switch FliN  46.97 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1568  flagellar motor switch protein FliN  45.59 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.183846  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0765  Type III secretion system outer membrane O protein  44.12 
 
 		 147 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2537  flagellar motor switch protein FliN  38.68 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.464076  normal  0.964599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>