More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1064 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3216  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  80 
 
 
526 aa  834    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.106134  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0365  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 
514 aa  1037    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.537641  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2587  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  88.91 
 
 
508 aa  861    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.095859  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, AMIC precursor protein  100 
 
 
514 aa  1037    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130481  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5895  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  88.76 
 
 
508 aa  868    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.617961 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2482  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  86.58 
 
 
515 aa  852    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0672514 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0910  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 
518 aa  1036    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0722  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  97.47 
 
 
514 aa  994    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.180636  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0746  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  79.7 
 
 
522 aa  823    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1952  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  88.3 
 
 
503 aa  853    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.370807  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0907  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 
518 aa  1036    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0733  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  87.35 
 
 
505 aa  855    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2611  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  87.94 
 
 
505 aa  862    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2563  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  88.91 
 
 
504 aa  857    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 
514 aa  1037    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.292024  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2500  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  100 
 
 
514 aa  1037    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0519  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  82.76 
 
 
515 aa  838    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2539  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AMIC precursor protein  57.01 
 
 
507 aa  542  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.687203 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0584  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  56.86 
 
 
499 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2815  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  56.57 
 
 
506 aa  533  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0526  cell wall hydrolase/autolysin  59.39 
 
 
497 aa  532  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105915 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2409  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.29 
 
 
507 aa  529  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262199  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  53.94 
 
 
448 aa  506  9.999999999999999e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1262  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.64 
 
 
452 aa  502  1e-141  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.826709  normal  0.137617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2027  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.74 
 
 
454 aa  477  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3199  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  53.91 
 
 
471 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.384074  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1170  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.35 
 
 
519 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0759959  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5127  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.35 
 
 
496 aa  465  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498717  normal  0.873024 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1305  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.78 
 
 
517 aa  464  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274894  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0983  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.02 
 
 
482 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.951769  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  53.82 
 
 
483 aa  458  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3303  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.2 
 
 
474 aa  455  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.125384  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1381  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.69 
 
 
443 aa  437  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1129  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.68 
 
 
523 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.418715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3049  cell wall hydrolase/autolysin  45.49 
 
 
449 aa  393  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.429243  normal  0.0314787 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1519  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  64.61 
 
 
418 aa  323  6e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.113628  normal  0.370562 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2532  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  56.21 
 
 
456 aa  320  3e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3463  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  67.5 
 
 
518 aa  304  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.159422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1783  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  64.1 
 
 
465 aa  290  6e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193017  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0337  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.71 
 
 
472 aa  282  8.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000027639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3384  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.86 
 
 
414 aa  282  9e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.25517  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0920  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.47 
 
 
414 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3004  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  60.17 
 
 
413 aa  277  3e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.695553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.22 
 
 
475 aa  277  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.183703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3260  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.55 
 
 
417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  55.47 
 
 
412 aa  272  9e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00703451  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3140  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  53.41 
 
 
419 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3228  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.2 
 
 
416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0709021  normal  0.49748 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3811  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.2 
 
 
417 aa  271  2.9999999999999997e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.145796  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0994  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.2 
 
 
416 aa  270  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.367182  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1046  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  53.82 
 
 
416 aa  269  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0326494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02626  hypothetical protein  52.27 
 
 
417 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02665  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.27 
 
 
417 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0874  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.27 
 
 
417 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3137  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  52.27 
 
 
417 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3045  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  52.27 
 
 
417 aa  266  5.999999999999999e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4082  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  52.27 
 
 
417 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.354645  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2964  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  52.27 
 
 
417 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2963  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiC  52.27 
 
 
417 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  52.27 
 
 
417 aa  266  5.999999999999999e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  40.58 
 
 
471 aa  262  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0569  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.24 
 
 
471 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2016  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  54.35 
 
 
406 aa  256  9e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.301828  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4688  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.83 
 
 
477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802168  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65370  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.44 
 
 
475 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0527105  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5676  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.44 
 
 
487 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.538418  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4949  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.83 
 
 
476 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0480001  normal  0.137764 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1274  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.45 
 
 
497 aa  252  1e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.730541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4773  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.34 
 
 
476 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4897  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  40.49 
 
 
476 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.019111  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2670  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  53.33 
 
 
447 aa  250  5e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.2261  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2772  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  53.68 
 
 
443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00294465  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4173  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.21 
 
 
439 aa  234  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0520  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.18 
 
 
473 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0449196  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0632  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  51.29 
 
 
471 aa  234  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.419176 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1188  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.68 
 
 
405 aa  233  5e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0677678  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.67 
 
 
440 aa  233  9e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2635  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 
442 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000028113  unclonable  0.00000000000694269 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.34 
 
 
521 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2753  hypothetical protein  35.47 
 
 
476 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0843  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.25 
 
 
399 aa  230  5e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.807823  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0570  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.76 
 
 
452 aa  229  6e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000754253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3208  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  49.38 
 
 
455 aa  229  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058641  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2626  hypothetical protein  50.86 
 
 
476 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0794  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  37.26 
 
 
440 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0595  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.71 
 
 
462 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000955274  hitchhiker  0.0000000140637 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3435  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.71 
 
 
462 aa  227  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000801055  normal  0.0458053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3770  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.84 
 
 
473 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000747673  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0555  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.84 
 
 
473 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000230448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3896  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.84 
 
 
473 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000116248  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0594  cell wall hydrolase/autolysin  48.71 
 
 
463 aa  227  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000169523  decreased coverage  0.000000280884 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3713  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.84 
 
 
473 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000484801  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0600  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.33 
 
 
463 aa  226  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3463  N-acetylmuramoyl-l-alanine amidase I  49.79 
 
 
299 aa  226  1e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73040  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.93 
 
 
397 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.487189  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3283  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.41 
 
 
476 aa  224  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000101703  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1296  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  47.35 
 
 
448 aa  224  4e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.85 
 
 
435 aa  224  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0563  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50.21 
 
 
439 aa  223  8e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538528  normal  0.250383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3314  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.87 
 
 
447 aa  223  9e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000664916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>