107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene plpp0053 on replicon NC_006365
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006365  plpp0053  hypothetical protein  100 
 
 
357 aa  732    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3597  hypothetical protein  54.76 
 
 
347 aa  362  6e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4779  hypothetical protein  52.51 
 
 
361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.975397  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1750  hypothetical protein  53.33 
 
 
354 aa  353  2.9999999999999997e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1088  hypothetical protein  52.14 
 
 
350 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.503621  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0820  hypothetical protein  51.66 
 
 
345 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2094  hypothetical protein  48.22 
 
 
342 aa  345  5e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0217  phage uncharacterized protein  49.7 
 
 
343 aa  340  2e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5402  protein of unknown function DUF1016  48.18 
 
 
358 aa  338  7e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185207  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0273  hypothetical protein  48.55 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.214242  unclonable  0.0000101179 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6349  hypothetical protein  47.48 
 
 
348 aa  333  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0420833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4508  hypothetical protein  48.93 
 
 
358 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2395  protein of unknown function DUF1016  46.11 
 
 
368 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1011  hypothetical protein  44.62 
 
 
387 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1219  hypothetical protein  45.58 
 
 
381 aa  324  1e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2940  hypothetical protein  45.11 
 
 
381 aa  312  4.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6844  protein of unknown function DUF1016  47.54 
 
 
360 aa  310  2e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1539  hypothetical protein  44.62 
 
 
382 aa  307  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1104  protein of unknown function DUF1016  43.02 
 
 
368 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.41725  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0036  hypothetical protein  44.88 
 
 
364 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.678422 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0539  hypothetical protein  40.34 
 
 
359 aa  272  7e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4438  hypothetical protein  39.05 
 
 
343 aa  264  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5974  hypothetical protein  50.19 
 
 
264 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0379  hypothetical protein  39.94 
 
 
344 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.206492  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4626  protein of unknown function DUF1016  38.6 
 
 
350 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3223  protein of unknown function DUF1016  36.47 
 
 
345 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0140947  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3444  protein of unknown function DUF1016  37.68 
 
 
351 aa  238  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1907  protein of unknown function DUF1016  36.28 
 
 
353 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0483682  normal  0.121025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4169  hypothetical protein  36.36 
 
 
339 aa  232  7.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000201243  hitchhiker  0.0000178427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34770  hypothetical protein  36.61 
 
 
353 aa  229  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118944  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1578  protein of unknown function DUF1016  35.67 
 
 
353 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.628841  normal  0.0190123 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3413  protein of unknown function DUF1016  32.97 
 
 
361 aa  227  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1183  hypothetical protein  36.89 
 
 
354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0542484  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6259  protein of unknown function DUF1016  35.47 
 
 
335 aa  193  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2497  protein of unknown function DUF1016  33.96 
 
 
349 aa  187  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2495  protein of unknown function DUF1016  35.65 
 
 
339 aa  187  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0702  hypothetical protein  33.87 
 
 
339 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3523  hypothetical protein  33.02 
 
 
367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3692  hypothetical protein  33.02 
 
 
361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3525  hypothetical protein  32.5 
 
 
367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0608  hypothetical protein  33.02 
 
 
338 aa  182  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.275105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3630  hypothetical protein  32.4 
 
 
367 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.448482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4537  hypothetical protein  31.69 
 
 
349 aa  181  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1268  hypothetical protein  34.86 
 
 
354 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.721029  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3718  hypothetical protein  33.54 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0317  protein of unknown function DUF1016  31.95 
 
 
345 aa  177  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3702  hypothetical protein  29.91 
 
 
375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6835  protein of unknown function DUF1016  33.33 
 
 
335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.573308 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3201  hypothetical protein  32.69 
 
 
350 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3539  protein of unknown function DUF1016  30.08 
 
 
389 aa  169  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0261  hypothetical protein  32.9 
 
 
356 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2557  protein of unknown function DUF1016  35.32 
 
 
393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2348  protein of unknown function DUF1016  30 
 
 
388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.106329  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0486  protein of unknown function DUF1016  29.85 
 
 
375 aa  166  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3044  hypothetical protein  31.09 
 
 
378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2744  hypothetical protein  31.09 
 
 
378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2602  protein of unknown function DUF1016  31.09 
 
 
378 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.684021 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1866  protein of unknown function DUF1016  29.81 
 
 
387 aa  165  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3074  protein of unknown function DUF1016  30.15 
 
 
340 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128849  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31270  hypothetical protein  29.53 
 
 
387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000967861  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1237  hypothetical protein  32.04 
 
 
358 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.108175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2845  protein of unknown function DUF1016  32.76 
 
 
353 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.24838  normal  0.105001 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2621  hypothetical protein  31.72 
 
 
355 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.165667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2788  hypothetical protein  31.99 
 
 
369 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0307  protein of unknown function DUF1016  32.26 
 
 
364 aa  161  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.310346  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0721  hypothetical protein  30.46 
 
 
337 aa  158  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.259935  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3516  protein of unknown function DUF1016  33.03 
 
 
351 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3962  hypothetical protein  33.1 
 
 
365 aa  157  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.144837  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0403  hypothetical protein  32.92 
 
 
333 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1864  hypothetical protein  32.87 
 
 
342 aa  154  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0578  hypothetical protein  31.69 
 
 
349 aa  150  3e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.518293  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1236  hypothetical protein  31.51 
 
 
364 aa  150  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2825  hypothetical protein  31.29 
 
 
357 aa  150  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0564066 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0706  protein of unknown function DUF1016  30.81 
 
 
389 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0672  hypothetical protein  28.78 
 
 
341 aa  149  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.507614 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0993  hypothetical protein  28.87 
 
 
359 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4863  protein of unknown function DUF1016  31.25 
 
 
347 aa  146  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00272744  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3741  protein of unknown function DUF1016  31.61 
 
 
323 aa  145  8.000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0451  protein of unknown function DUF1016  29.78 
 
 
375 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2787  hypothetical protein  30.33 
 
 
370 aa  136  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1129  protein of unknown function DUF1016  28.39 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5953  hypothetical protein  30.61 
 
 
344 aa  125  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.347886  normal  0.254473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2044  protein of unknown function DUF1016  50 
 
 
171 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4738  hypothetical protein  26.77 
 
 
341 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0271412  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1220  hypothetical protein  26.69 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1226  protein of unknown function DUF1016  32.38 
 
 
232 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.275658  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0031  hypothetical protein  27.79 
 
 
376 aa  119  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419729  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1562  hypothetical protein  33.92 
 
 
371 aa  119  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2614  protein of unknown function DUF1016  37.5 
 
 
199 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2313  hypothetical protein  31.94 
 
 
245 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3020  hypothetical protein  26.09 
 
 
378 aa  113  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2039  protein of unknown function DUF1016  29.29 
 
 
400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.454734  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0874  hypothetical protein  31.62 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0124164  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1752  hypothetical protein  37.86 
 
 
167 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4764  hypothetical protein  36.54 
 
 
160 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2121  protein of unknown function DUF1016  43.36 
 
 
150 aa  84.7  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0937  protein of unknown function DUF1016  38.24 
 
 
154 aa  72.4  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.362074  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1094  protein of unknown function DUF1016  32.5 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0181  protein of unknown function DUF1016  27.27 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0489456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2615  hypothetical protein  29.79 
 
 
120 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>