More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2362 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2362  chemiosmotic efflux system B protein B  100 
 
 
377 aa  771    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  41.77 
 
 
581 aa  290  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.287598  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1715  putative cation efflux system transmembrane protein  43.07 
 
 
500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0232855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2704  RND family efflux transporter MFP subunit  39.64 
 
 
538 aa  276  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.534684  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.35 
 
 
537 aa  275  8e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.580159  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0412  secretion protein HlyD  41.14 
 
 
537 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4263  RND family efflux transporter MFP subunit  43.07 
 
 
504 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0959435 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1529  secretion protein HlyD  40.36 
 
 
467 aa  272  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2479  secretion protein HlyD  40.48 
 
 
504 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.518843  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4105  secretion protein HlyD  42.07 
 
 
527 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1536  secretion protein HlyD  40.57 
 
 
625 aa  265  7e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1482  RND family efflux transporter MFP subunit  37.87 
 
 
537 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0952522  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2263  heavy metal efflux pump membrane fusion protein, putative  40.11 
 
 
422 aa  263  4e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2264  secretion protein HlyD  38.18 
 
 
546 aa  256  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3977  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.53 
 
 
512 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0088  RND family efflux transporter MFP subunit  38.89 
 
 
468 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4233  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.42 
 
 
568 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1407  secretion protein HlyD  41.12 
 
 
540 aa  249  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4050  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.48 
 
 
517 aa  249  7e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4256  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.12 
 
 
526 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.19 
 
 
432 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1548  secretion protein HlyD  35.07 
 
 
466 aa  245  9e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0420429  normal  0.648627 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3649  RND family efflux transporter MFP subunit  38.91 
 
 
472 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.28 
 
 
465 aa  232  6e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000291349 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2165  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.26 
 
 
456 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4431  RND family efflux transporter MFP subunit  37.57 
 
 
683 aa  229  9e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1331  RND family efflux transporter MFP subunit  36.09 
 
 
451 aa  227  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.44 
 
 
460 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  39.88 
 
 
518 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0135  RND family efflux transporter MFP subunit  35.07 
 
 
455 aa  222  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4405  secretion protein HlyD  36.59 
 
 
550 aa  219  5e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.164815  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2457  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.9 
 
 
457 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.704065  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3130  secretion protein HlyD  35.63 
 
 
473 aa  216  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.308652  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  34.92 
 
 
455 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4832  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 
472 aa  213  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4111  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.63 
 
 
494 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9868  Membrane-fusion protein  37.31 
 
 
475 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  35.8 
 
 
451 aa  209  6e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.484161  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.39 
 
 
508 aa  209  8e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.590428 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1389  RND family efflux transporter MFP subunit  35.45 
 
 
502 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.545507 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.21 
 
 
486 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1553  RND family efflux transporter MFP subunit  35.35 
 
 
715 aa  206  6e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.09 
 
 
509 aa  205  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.430144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3936  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  33.63 
 
 
491 aa  202  7e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3855  RND family efflux transporter MFP subunit  32.95 
 
 
502 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3642  putative cation efflux system protein cusB precursor  35.65 
 
 
475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499465  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1930  membrane-fusion protein-like  34.43 
 
 
629 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3695  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0060  secretion protein HlyD precursor  34.29 
 
 
477 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4658  secretion protein HlyD  32.74 
 
 
478 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1604  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.94 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.344035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3474  heavy metal efflux system protein, putative  31.87 
 
 
526 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.692441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4592  RND family efflux transporter MFP subunit  33.72 
 
 
477 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.246658  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3812  RND family efflux transporter MFP subunit  35.54 
 
 
498 aa  197  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.999648  normal  0.340628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3427  cation efflux system protein cusB precursor  35.03 
 
 
474 aa  197  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3988  RND family efflux transporter MFP subunit  34.06 
 
 
640 aa  196  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3973  RND family efflux transporter MFP subunit  34.62 
 
 
473 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181102 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3982  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 
500 aa  195  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06365  hypothetical protein  32.72 
 
 
577 aa  195  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4597  heavy metal efflux system protein, putative  32.09 
 
 
472 aa  194  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4358  secretion protein HlyD  33.82 
 
 
472 aa  194  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3782  RND family efflux transporter MFP subunit  31.81 
 
 
502 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2740  secretion protein HlyD  35.21 
 
 
462 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.135625  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2393  RND family efflux transporter MFP subunit  30.12 
 
 
525 aa  194  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.55 
 
 
500 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3535  RND family efflux transporter MFP subunit  31.52 
 
 
529 aa  192  7e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6135  proton antiporter metal efflux protein SilB  33.24 
 
 
521 aa  190  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.418414  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4857  cation efflux system protein CusB  33.13 
 
 
529 aa  189  7e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00319  putative cation efflux system protein  32.23 
 
 
672 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0715  putative cation efflux system protein  32.62 
 
 
489 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3508  secretion protein HlyD  31.87 
 
 
460 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1853  secretion protein HlyD  32.54 
 
 
471 aa  186  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0283  RND family efflux transporter MFP subunit  31.52 
 
 
512 aa  186  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  30.68 
 
 
513 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4102  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.68 
 
 
513 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4303  RND family efflux transporter MFP subunit  30.68 
 
 
514 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0717978 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001396  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  31.31 
 
 
571 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1369  RND family efflux transporter MFP subunit  32.63 
 
 
488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271399  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4172  RND family efflux transporter MFP subunit  30.68 
 
 
513 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0154  heavy metal efflux protein, putative  30.4 
 
 
513 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.235604  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1102  secretion protein HlyD  34.85 
 
 
470 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.03 
 
 
438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.538499  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0277  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.77 
 
 
627 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96943  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.22 
 
 
671 aa  181  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0177  hypothetical protein  31.44 
 
 
509 aa  181  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0150  RND family efflux transporter MFP subunit  31.53 
 
 
509 aa  181  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0999403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0211  membrane-fusion protein-like protein  30.4 
 
 
650 aa  180  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  31.68 
 
 
502 aa  180  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2061  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.73 
 
 
482 aa  179  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2433  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.73 
 
 
482 aa  179  9e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0190  RND family efflux transporter MFP subunit  30.37 
 
 
599 aa  178  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1618  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.13 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.215683  hitchhiker  0.000019246 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1948  heavy metal efflux transporter, MFP subunit, putative  33.13 
 
 
439 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1779  secretion protein HlyD  30 
 
 
427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0975048  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4512  RND family efflux transporter MFP subunit  32.53 
 
 
552 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201635  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2394  secretion protein HlyD  32.51 
 
 
410 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.372512  normal  0.032408 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2311  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.14 
 
 
705 aa  170  4e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3492  secretion protein HlyD  31.19 
 
 
545 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.341782 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5356  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.34 
 
 
510 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2211  RND family efflux transporter MFP subunit  30.33 
 
 
486 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11358  putative metal transport-related, exported protein  31.09 
 
 
561 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>