More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3731 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  100 
 
 		 517 aa  1056    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  51.42 
 
 		 517 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  39.4 
 
 		 513 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  39.4 
 
 		 526 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  36.16 
 
 		 543 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0017  type IV pilus biosynthesis protein PilQ  34.74 
 
 		 499 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0629  type II secretion system protein E  36.83 
 
 		 519 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  37.99 
 
 		 544 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  35.41 
 
 		 520 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  36.39 
 
 		 538 aa  234  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  34.45 
 
 		 518 aa  233  5e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  35.86 
 
 		 506 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  35.63 
 
 		 536 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  35.63 
 
 		 536 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  35.63 
 
 		 536 aa  220  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  35.63 
 
 		 536 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  35.63 
 
 		 536 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  35.63 
 
 		 536 aa  219  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  35.61 
 
 		 594 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  32.02 
 
 		 510 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  29.09 
 
 		 616 aa  164  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  34.65 
 
 		 544 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  34.25 
 
 		 553 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1163  type II secretion system protein E  38.38 
 
 		 782 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  30.85 
 
 		 467 aa  157  6e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1351  type II secretion system protein GspE  38.3 
 
 		 778 aa  156  8e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1133  type II secretion system protein  38.65 
 
 		 778 aa  156  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  31.5 
 
 		 502 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  31.34 
 
 		 520 aa  151  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  30.12 
 
 		 553 aa  151  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  31.5 
 
 		 502 aa  151  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  30.25 
 
 		 500 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  34.29 
 
 		 611 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  37.06 
 
 		 591 aa  150  4e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  30.37 
 
 		 871 aa  150  5e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  35.84 
 
 		 578 aa  150  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  31 
 
 		 495 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  29.5 
 
 		 501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  32.58 
 
 		 560 aa  149  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0360  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein T  26.59 
 
 		 503 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.547799  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  32.4 
 
 		 570 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  32.64 
 
 		 541 aa  148  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  33.16 
 
 		 571 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3029  general secretion pathway protein E  29.84 
 
 		 550 aa  147  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599486  hitchhiker  0.00121357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  31.87 
 
 		 595 aa  147  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  29.42 
 
 		 594 aa  146  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0931  type II secretion system protein E  31.93 
 
 		 551 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.1993  normal  0.0211669 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  34.05 
 
 		 611 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  30.91 
 
 		 576 aa  145  2e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  34.05 
 
 		 611 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  33.97 
 
 		 611 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  30.89 
 
 		 603 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  33.16 
 
 		 595 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  30.92 
 
 		 578 aa  144  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  32.14 
 
 		 563 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  31.88 
 
 		 482 aa  144  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  32.68 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  33.24 
 
 		 606 aa  144  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  33.02 
 
 		 604 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  34.68 
 
 		 605 aa  144  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  33.43 
 
 		 564 aa  144  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 565 aa  144  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  31.55 
 
 		 577 aa  143  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  36.49 
 
 		 561 aa  143  8e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.75 
 
 		 569 aa  143  8e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  34.25 
 
 		 522 aa  143  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  31.29 
 
 		 562 aa  143  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  30.03 
 
 		 499 aa  143  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  31.72 
 
 		 561 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5434  type II secretion system protein E  26.72 
 
 		 609 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3108  type II secretion system protein E  32.14 
 
 		 573 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.275217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  31.62 
 
 		 583 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  32.77 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  33.16 
 
 		 595 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  35.88 
 
 		 599 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  31.1 
 
 		 558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.13 
 
 		 569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  35.66 
 
 		 550 aa  142  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5028  type II secretion system protein E  26.72 
 
 		 609 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  36.39 
 
 		 611 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  29.85 
 
 		 558 aa  141  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  34.14 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  32.51 
 
 		 599 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.74 
 
 		 568 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  30.18 
 
 		 503 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 600 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  31.97 
 
 		 559 aa  140  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.5 
 
 		 570 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  30.42 
 
 		 518 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2780  type II secretion system protein E  31.15 
 
 		 548 aa  140  4.999999999999999e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  31.34 
 
 		 561 aa  140  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  30.83 
 
 		 561 aa  140  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.5 
 
 		 570 aa  140  6e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.33 
 
 		 578 aa  140  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  34.82 
 
 		 585 aa  140  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1088  type II secretion system protein E  33.76 
 
 		 482 aa  140  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.5 
 
 		 570 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  32.59 
 
 		 490 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.5 
 
 		 570 aa  140  7e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  35.88 
 
 		 599 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>