More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0024 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03864  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.96 
 
 		 1407 aa  1444    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4007  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  53.96 
 
 		 1407 aa  1443    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0588  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  49.1 
 
 		 1396 aa  1285    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0448  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  54.92 
 
 		 1399 aa  1489    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.402854  unclonable  0.0000011362 
 
 
-
 
NC_002950  PG0395  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  47.34 
 
 		 1433 aa  1250    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2420  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  46.05 
 
 		 1424 aa  1225    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00279093  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1067  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  54.61 
 
 		 1400 aa  1492    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0024  DNA-directed RNA polymerase subunit beta/beta'  100 
 
 		 2837 aa  5819    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3033  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.47 
 
 		 1409 aa  1475    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.188142  hitchhiker  0.00329895 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3034  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.04 
 
 		 1368 aa  1321    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0207324 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4768  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.48 
 
 		 1406 aa  1456    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1242  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  58.76 
 
 		 1400 aa  1646    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1243  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.59 
 
 		 1377 aa  1247    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.510388  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0224  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.33 
 
 		 1345 aa  1317    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0225  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  54.11 
 
 		 1405 aa  1482    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0620  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  54.77 
 
 		 1399 aa  1484    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.354282  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2640  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.6 
 
 		 1412 aa  1477    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0388  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  55.43 
 
 		 1401 aa  1514    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0363  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  55.22 
 
 		 1401 aa  1514    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4554  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  54.77 
 
 		 1399 aa  1485    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397479 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1886  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  52.34 
 
 		 1406 aa  1426    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.315745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1887  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  46.85 
 
 		 1372 aa  1268    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0313  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  54.63 
 
 		 1403 aa  1510    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267546  hitchhiker  0.00189389 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3188  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.32 
 
 		 1415 aa  1475    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3189  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.25 
 
 		 1368 aa  1308    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.544144  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0169  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  66.22 
 
 		 1380 aa  1623    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.410065  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0170  DNA-directed RNA polymerase  75.07 
 
 		 1410 aa  2196    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.141232  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0398  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  49.29 
 
 		 1359 aa  1363    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0653652  normal  0.0371296 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0399  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  54.55 
 
 		 1398 aa  1479    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.589703  normal  0.0776208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1350  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.4 
 
 		 1380 aa  1252    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0511813  normal  0.845887 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1351  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  59.4 
 
 		 1399 aa  1652    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.221368 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3785  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.67 
 
 		 1412 aa  1481    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468466  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2330  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  55.26 
 
 		 1403 aa  1498    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000376079  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5085  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  55.21 
 
 		 1399 aa  1494    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00230086  normal  0.866295 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1699  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.25 
 
 		 1377 aa  1223    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1712  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  59.31 
 
 		 1415 aa  1668    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0695  RNA polymerase, beta prime subunit  55.31 
 
 		 1396 aa  1512    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000131874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3440  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.31 
 
 		 1414 aa  1473    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.19828  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1961  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  45.47 
 
 		 1498 aa  1179    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.549575  normal  0.98666 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0358  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  45.78 
 
 		 1502 aa  1188    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0619  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  49.09 
 
 		 1370 aa  1355    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000502856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0620  DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime  55.63 
 
 		 1392 aa  1504    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  decreased coverage  2.7637000000000004e-19 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2998  DNA-directed RNA polymerase., acetylornithine deacetylase  55.33 
 
 		 1386 aa  1480    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0289  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.73 
 
 		 1408 aa  1469    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000201644  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0760  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  54.59 
 
 		 1408 aa  1491    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2694  DNA-directed RNA polymerase  61.6 
 
 		 1393 aa  1714    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2695  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  53.32 
 
 		 1393 aa  1261    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3075  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.53 
 
 		 1412 aa  1480    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1593  DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime  56.12 
 
 		 1394 aa  1520    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2285  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.91 
 
 		 1390 aa  1239    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0576876  normal  0.366235 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2286  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  58.38 
 
 		 1400 aa  1649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.604145 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0023  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  57.9 
 
 		 1427 aa  1594    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269767  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0024  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.71 
 
 		 1392 aa  1192    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0677  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  59.9 
 
 		 1375 aa  1676    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.347752  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0678  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  55.13 
 
 		 1358 aa  1228    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.299005  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0951  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  75.5 
 
 		 1410 aa  2202    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0952  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  66.97 
 
 		 1380 aa  1636    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0568  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.59 
 
 		 1385 aa  1197    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.941099 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0569  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  58.85 
 
 		 1404 aa  1642    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.870967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3591  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  54.18 
 
 		 1405 aa  1447    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.151123  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0924  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  47.68 
 
 		 1361 aa  1328    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.235944  hitchhiker  0.0000468436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0925  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.09 
 
 		 1410 aa  1454    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.15771  hitchhiker  0.00023271 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3457  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  58.72 
 
 		 1401 aa  1638    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.416565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3458  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.33 
 
 		 1373 aa  1223    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0273  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  54.23 
 
 		 1409 aa  1494    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0012908  unclonable  0.000000465088 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4441  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.54 
 
 		 1408 aa  1431    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0307  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  52.9 
 
 		 1412 aa  1471    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0164  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  54.19 
 
 		 1410 aa  1469    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.564754  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3194  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  58.38 
 
 		 1400 aa  1649    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0226545  normal  0.686552 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3195  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.67 
 
 		 1374 aa  1249    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0415  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  54.16 
 
 		 1405 aa  1452    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0443299  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1531  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.48 
 
 		 1380 aa  1253    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1532  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  59.11 
 
 		 1399 aa  1644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2176  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  52.34 
 
 		 1399 aa  1425    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.120941 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3333  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.48 
 
 		 1413 aa  1471    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.762028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3334  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  48.52 
 
 		 1368 aa  1306    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.11598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0503  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  52.56 
 
 		 1408 aa  1418    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.630998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4675  DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime  52.23 
 
 		 1445 aa  1379    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0479992 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0234  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.98 
 
 		 1379 aa  1229    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0235  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  58.98 
 
 		 1410 aa  1670    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0585906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1485  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  58.72 
 
 		 1427 aa  1620    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.614048  normal  0.379046 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1486  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.87 
 
 		 1392 aa  1486    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.792933  normal  0.131501 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2766  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.6 
 
 		 1413 aa  1483    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0599  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.29 
 
 		 1395 aa  1433    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.275775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1818  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  59.17 
 
 		 1399 aa  1654    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1819  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  51.36 
 
 		 1379 aa  1264    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3168  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  47.84 
 
 		 1438 aa  1259    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.694613 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1564  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.21 
 
 		 1420 aa  1441    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0193  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.96 
 
 		 1405 aa  1476    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.508945  hitchhiker  0.0000984081 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0188  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  54.03 
 
 		 1405 aa  1479    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0790536  decreased coverage  0.000914175 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0452  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.07 
 
 		 1426 aa  1505    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0142  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  54.04 
 
 		 1408 aa  1475    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0021761  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1801  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  57.38 
 
 		 1405 aa  1611    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.669394  normal  0.126804 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1802  DNA-directed RNA polymerase subunit beta  52.4 
 
 		 1357 aa  1213    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.817598  normal  0.172687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0260  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.46 
 
 		 1413 aa  1483    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08780  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  55.17 
 
 		 1399 aa  1500    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0182127 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0341  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  53.6 
 
 		 1413 aa  1483    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1549  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  47.6 
 
 		 1370 aa  1291    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1550  DNA-directed RNA polymerase, beta' subunit  55.67 
 
 		 1351 aa  1499    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0840  DNA-directed RNA polymerase, beta subunit  52.14 
 
 		 1360 aa  1168    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00386613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>