More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1366 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1366  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 481 aa  952    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.986261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0331  LysR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 417 aa  292  8e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3811  LysR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.310651 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6554  LysR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 415 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.976511 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6042  LysR family transcriptional regulator  36.34 
 
 		 419 aa  227  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.137483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3897  LysR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 414 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7575  LysR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 417 aa  223  7e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3922  LysR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3891  LysR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 400 aa  220  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2093  LysR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.883671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2816  LysR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 383 aa  195  2e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0493129  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31260  Transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 397 aa  193  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0094  LysR family substrate-binding transcriptional regulator  33.17 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5744  transcriptional regulator, LysR family  35.7 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0821476  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0095  LysR family substrate binding transcriptional regulator  33.17 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3202  LysR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185561 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03234  transcriptional regulator  34.24 
 
 		 435 aa  187  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2516  LysR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 397 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4119  LysR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 392 aa  184  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3707  LysR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0214669 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2029  LysR family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 397 aa  176  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3271  LysR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0338  LysR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 410 aa  154  4e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.385737  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1777  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 351 aa  144  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.142089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3543  LysR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 419 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0643746  normal  0.113442 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4394  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3958  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 325 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00354063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3275  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 		 300 aa  123  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0115346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3111  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.24 
 
 		 300 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0457  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 328 aa  120  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.973452  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1620  LysR family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 312 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2667  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1380  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 309 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1596  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 321 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.49  normal  0.186614 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5141  LysR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 320 aa  118  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0705436 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6156  LysR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.334485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1848  LysR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 314 aa  116  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8659  transcriptional regulator, LysR family  31.06 
 
 		 304 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7648  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 341 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1107  transcriptional regulator, LysR family  30.66 
 
 		 299 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36180  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 315 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.682607  hitchhiker  0.00107493 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3084  putative transcriptional regulator  31.6 
 
 		 315 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0040  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 316 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2503  LysR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 306 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.89546 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5915  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 303 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0456  LysR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2632  LysR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 306 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.724671  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00118  galactose-binding protein regulator  31.34 
 
 		 302 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.260191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6812  transcriptional regulator, LysR family  33.8 
 
 		 321 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.062616  hitchhiker  0.00583234 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5645  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 316 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0239097  normal  0.200885 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5214  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 316 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5687  transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8309  transcriptional regulator, LysR family  29.18 
 
 		 318 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.207125  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2608  LysR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 303 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2686  LysR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 303 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.247375 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2584  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 303 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0798399  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1032  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 333 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.277484 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1757  LysR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 317 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1974  LysR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 303 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5745  transcriptional regulator, LysR family  31.56 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2000  transcriptional regulator, LysR family  29.05 
 
 		 299 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.40236  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3272  transcriptional regulator, LysR family  27.62 
 
 		 302 aa  108  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4584  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974851 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1464  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2337  pca operon transcriptional activator PcaQ  26.97 
 
 		 309 aa  107  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.269299  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3439  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 311 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.444229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5481  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 316 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046066 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6715  LysR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 316 aa  107  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.674594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4926  LysR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 316 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5497  LysR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 315 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2121  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.04 
 
 		 306 aa  106  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.547513  normal  0.230532 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1042  transcriptional regulator, LysR family  29.39 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429419  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0704  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.271413  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5159  LysR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 318 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0642  transcriptional regulator PcaQ  27.08 
 
 		 302 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4280  LysR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 313 aa  105  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1381  transcriptional regulator, LysR family  30.23 
 
 		 314 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.31695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0604  pca operon transcription factor PcaQ  27.08 
 
 		 302 aa  105  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2257  LysR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.206337  hitchhiker  0.000000365434 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2027  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 307 aa  104  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.294769  hitchhiker  0.0000000175537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1601  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 307 aa  104  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1752  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 307 aa  104  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.53029e-17 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1504  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 307 aa  104  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3466  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 321 aa  104  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935879  normal  0.213991 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6124  pca operon transcription factor PcaQ  26.15 
 
 		 284 aa  104  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0261121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3518  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 321 aa  103  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.625066  normal  0.0991501 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0515  putative DNA-binding transcriptional regulator  24.91 
 
 		 298 aa  103  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.523289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2237  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 339 aa  103  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.956085 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01379  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.8 
 
 		 307 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2224  transcriptional regulator, LysR family  26.8 
 
 		 307 aa  103  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.1844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01391  hypothetical protein  26.8 
 
 		 307 aa  103  8e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1633  LysR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 331 aa  103  9e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.749714  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1317  transcriptional regulator, LysR family  30.79 
 
 		 314 aa  103  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.754776  normal  0.339821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38270  pca operon transcription factor PcaQ  30.2 
 
 		 310 aa  103  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0562  LysR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 312 aa  103  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260746  normal  0.122148 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0720  LysR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.317431 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1964  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0145  LysR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685524 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1765  LysR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111845 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2435  LysR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 318 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>