More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2973 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  49.45 
 
 		 208 aa  158  4e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  43.39 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  47.15 
 
 		 216 aa  128  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 213 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 208 aa  115  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  44.97 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  48.99 
 
 		 208 aa  111  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  54.05 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 200 aa  109  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 209 aa  104  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 196 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  95.1  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  50.5 
 
 		 167 aa  94.7  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 183 aa  94.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  55.73 
 
 		 220 aa  91.3  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  45.03 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 230 aa  85.5  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  48.7 
 
 		 195 aa  78.6  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  50.62 
 
 		 245 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  60.34 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  55.93 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  51.47 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  56.14 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  46.91 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  42.53 
 
 		 220 aa  58.2  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 186 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  50.91 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  49.23 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 299 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  36.07 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1637  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.890844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  38.24 
 
 		 220 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 212 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 259 aa  54.7  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 225 aa  53.9  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  48.28 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1794  transcriptional regulator  35.05 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  61.22 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>