130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0926 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0926  amidohydrolase 2  100 
 
 
358 aa  729    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.514632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1238  amidohydrolase 2  56.8 
 
 
296 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.1941  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3862  amidohydrolase 2  52.98 
 
 
308 aa  314  9.999999999999999e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.379337  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5357  amidohydrolase 2  56.52 
 
 
333 aa  308  8e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3202  amidohydrolase 2  55.75 
 
 
297 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.763184  normal  0.0700709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6825  amidohydrolase 2  53.87 
 
 
297 aa  303  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2978  amidohydrolase 2  54.01 
 
 
297 aa  298  9e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3966  amidohydrolase 2  53.36 
 
 
884 aa  295  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.657438  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0424  amidohydrolase 2  53.24 
 
 
311 aa  295  1e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07730  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  54.71 
 
 
289 aa  292  5e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2309  amidohydrolase 2  53.71 
 
 
285 aa  288  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.351929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1007  amidohydrolase 2  52.17 
 
 
301 aa  288  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36488 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1273  amidohydrolase 2  52.58 
 
 
308 aa  285  8e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6430  amidohydrolase family protein  52.08 
 
 
309 aa  283  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467968  hitchhiker  0.00713466 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0596  amidohydrolase 2  27.21 
 
 
279 aa  125  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1160  amidohydrolase  31.29 
 
 
385 aa  123  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2788  amidohydrolase family protein  31.29 
 
 
341 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0006  amidohydrolase 2  32.61 
 
 
300 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0277  amidohydrolase  30.65 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2942  amidohydrolase  30.97 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4683  amidohydrolase 2  33.57 
 
 
268 aa  95.5  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3823  amidohydrolase 2  32.8 
 
 
297 aa  84  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2871  amidohydrolase 2  30.23 
 
 
289 aa  72.4  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1278  amidohydrolase family protein  30.97 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00759688  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1017  amidohydrolase 2  28.98 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0756102  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0547  amidohydrolase 2  22.07 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2965  amidohydrolase 2  26.64 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1291  amidohydrolase 2  24.41 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127908  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5612  amidohydrolase 2  31.87 
 
 
277 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0495  amidohydrolase 2  32.9 
 
 
278 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1437  amidohydrolase 2  31.76 
 
 
277 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  26.92 
 
 
286 aa  61.6  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0179  amidohydrolase 2  29.31 
 
 
294 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4910  amidohydrolase 2  33.55 
 
 
279 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1611  amidohydrolase 2  29.51 
 
 
299 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4394  amidohydrolase 2  29.12 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.247071  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4481  amidohydrolase 2  29.12 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4775  amidohydrolase 2  29.12 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1590  amidohydrolase 2  31.54 
 
 
276 aa  60.8  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00255924  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2836  amidohydrolase 2  27.62 
 
 
291 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.192303  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1757  amidohydrolase 2  32.8 
 
 
293 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000243959  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1455  hypothetical protein  25.17 
 
 
282 aa  60.1  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00169486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4144  amidohydrolase 2  28.33 
 
 
297 aa  60.1  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.46392  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1417  amidohydrolase 2  29.19 
 
 
289 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1397  amidohydrolase 2  26.75 
 
 
289 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.70619  normal  0.985512 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1805  amidohydrolase 2  25.76 
 
 
310 aa  59.3  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000310667  hitchhiker  0.00134282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4901  amidohydrolase 2  30.11 
 
 
293 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0686596  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4952  amidohydrolase 2  27.84 
 
 
300 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.260366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1655  putative amidohydrolase  29.28 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1435  amidohydrolase 2  28.32 
 
 
282 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2819  amidohydrolase 2  27.75 
 
 
282 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4678  amidohydrolase 2  27.16 
 
 
289 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8667  amidohydrolase 2  30.72 
 
 
279 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4401  amidohydrolase 2  27.66 
 
 
288 aa  57.4  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400198  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26550  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.36 
 
 
268 aa  57.4  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000376652  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2837  amidohydrolase 2  25.6 
 
 
269 aa  57  0.0000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0275  amidohydrolase 2  27.68 
 
 
287 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0000138051  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4537  amidohydrolase 2  28.41 
 
 
295 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1256  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
283 aa  56.6  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00133666  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0606  amidohydrolase 2  27.37 
 
 
291 aa  56.2  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.47355 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7141  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1422  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
273 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0499  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
271 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0376  amidohydrolase 2  25.39 
 
 
286 aa  53.9  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2586  amidohydrolase 2  25.44 
 
 
262 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000259256  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00750  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.71 
 
 
300 aa  53.5  0.000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0637  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
301 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2036  amidohydrolase 2  25.41 
 
 
218 aa  52.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2839  amidohydrolase 2  31.87 
 
 
287 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.975955  normal  0.522178 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13544  hypothetical protein  27.67 
 
 
278 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.70136e-92  hitchhiker  0.000000875537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2058  amidohydrolase 2  42.25 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0236729  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4140  amidohydrolase 2  25.77 
 
 
261 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3998  amidohydrolase 2  24.88 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.166388  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0995  amidohydrolase 2  25.68 
 
 
287 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0364  amidohydrolase 2  23.36 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1932  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
280 aa  51.6  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1842  amidohydrolase 2  26.82 
 
 
279 aa  51.2  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  25 
 
 
279 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3610  amidohydrolase 2  23.87 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1073  amidohydrolase 2  28.57 
 
 
275 aa  50.8  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.270435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2930  amidohydrolase 2  27.98 
 
 
392 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549104  normal  0.491948 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1233  hypothetical protein  23.29 
 
 
283 aa  50.4  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.047212  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3385  amidohydrolase 2  28.72 
 
 
276 aa  50.1  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0664  amidohydrolase 2  27.27 
 
 
334 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0014  amidohydrolase 2  22.22 
 
 
374 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00386007  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1557  amidohydrolase 2  26.24 
 
 
289 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1776  amidohydrolase 2  25.81 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.938541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1823  amidohydrolase 2  25.81 
 
 
277 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.979278  normal  0.694594 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1607  amidohydrolase 2  22.84 
 
 
332 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4025  amidohydrolase 2  25.59 
 
 
294 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0646692  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3070  amidohydrolase 2  22.97 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0243811  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2763  amidohydrolase 2  29.45 
 
 
244 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165032  normal  0.0238203 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2657  amidohydrolase 2  26.14 
 
 
333 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.840659  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4417  amidohydrolase 2  28.38 
 
 
286 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3173  amidohydrolase 2  30.63 
 
 
287 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.820351  normal  0.79914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2838  amidohydrolase 2  25.97 
 
 
334 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0085644  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8361  amidohydrolase 2  27.81 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3428  amidohydrolase 2  22.94 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3529  hypothetical protein  30.63 
 
 
287 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3429  amidohydrolase 2  24.48 
 
 
301 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.671238 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>