119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0756 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0756  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
220 aa  430  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1162  Crp/FNR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
220 aa  148  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1578  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
201 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  35.39 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1303  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3951  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.15 
 
 
220 aa  95.5  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.67 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1053  transcriptional regulator, putative  25.99 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0216294 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.13 
 
 
226 aa  75.1  0.0000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  22.22 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0034  cyclic nucleotide-binding protein  25.11 
 
 
219 aa  63.2  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000350916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0702  cyclic nucleotide-binding protein  20.57 
 
 
233 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2472  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.32 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2778  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.99 
 
 
238 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0529131  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.09 
 
 
248 aa  58.5  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0478  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  25.96 
 
 
216 aa  58.5  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03090  cAMP-binding protein  24.78 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0333204  hitchhiker  1.31136e-22 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0705  cyclic nucleotide-binding protein  20.1 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2465  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.11 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.07605e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  19.82 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3340  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.46 
 
 
207 aa  55.1  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0648445 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.89 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.79 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01090  transcriptional regulator, crp family  21.36 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  21.65 
 
 
226 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0528  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.9 
 
 
244 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1423  cyclic nucleotide-binding protein  22.35 
 
 
222 aa  51.6  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0243241  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0336  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  24.77 
 
 
223 aa  51.6  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0158598  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2189  hypothetical protein  21.67 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0895568  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0911  cyclic nucleotide-binding protein  23.39 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000610478  hitchhiker  0.00000000000000386547 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0741  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.12 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.343914  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.56 
 
 
231 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3735  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.59 
 
 
210 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.12 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.68 
 
 
225 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000947161  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.16 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0503167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.69 
 
 
225 aa  48.1  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2562  cyclic AMP receptor protein  21.58 
 
 
222 aa  48.1  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.553837  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.88 
 
 
239 aa  48.1  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.51 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.76 
 
 
234 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3287  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.72 
 
 
239 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.370075  normal  0.683237 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.35 
 
 
230 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12618  transcriptional regulator, Crp family protein  22.56 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2635  cyclic nucleotide-binding protein  20.31 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3445  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.53 
 
 
228 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.90711  unclonable  0.00000836213 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.78 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4234  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.32 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.81 
 
 
227 aa  46.6  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.75 
 
 
222 aa  46.2  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3326  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.21 
 
 
239 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3149  cyclic nucleotide-binding protein  20.73 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6158  cyclic nucleotide-binding protein  21.81 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  17.54 
 
 
235 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990851  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5316  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.47 
 
 
354 aa  46.2  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.100222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.43 
 
 
241 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1641  cyclic nucleotide-binding  20.47 
 
 
267 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  22.47 
 
 
223 aa  45.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.97 
 
 
229 aa  45.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5419  DNA-binding transcriptional activator YeiL  22.97 
 
 
223 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3553  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.29 
 
 
348 aa  45.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.528491 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.65 
 
 
226 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6174  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.91 
 
 
212 aa  45.1  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2580  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.74 
 
 
231 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0428  Crp family transcriptional regulator  25.65 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0204  Crp/Fnr family transcriptional regulator  24.08 
 
 
226 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0718939  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4026  cyclic nucleotide-binding protein  22.4 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5533  DNA-binding transcriptional activator YeiL  22.52 
 
 
223 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.26 
 
 
225 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.55 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.46 
 
 
231 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4138  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.4 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.60462  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.65 
 
 
226 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.81 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0718  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.81 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3455  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.24 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.97 
 
 
236 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1694  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233971  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2501  cyclic nucleotide-binding protein  24.46 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0611932  hitchhiker  0.00056277 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.9 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.07 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.79 
 
 
350 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.62 
 
 
227 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1233  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.11 
 
 
225 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0234193  normal  0.501568 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  22.75 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5695  cyclic nucleotide-binding protein  23.19 
 
 
233 aa  43.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0746044  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.93 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.81 
 
 
237 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1802  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.43 
 
 
238 aa  43.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.51 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5315  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.31 
 
 
228 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.527594 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.58 
 
 
236 aa  42.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.5 
 
 
232 aa  42.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2448  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.43 
 
 
238 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0681  Crp/FNR family transcriptional regulator  16.92 
 
 
234 aa  42.7  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0670228  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4151  cyclic nucleotide-binding protein  19.46 
 
 
260 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.066887  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4215  cyclic nucleotide-binding protein  19.46 
 
 
260 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.32687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4871  CRP/FNR family transcriptional regulator  18.13 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0245964  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  17.54 
 
 
227 aa  42.7  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3302  cyclic nucleotide-binding protein  19.46 
 
 
260 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.896655  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>