264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0709 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0503167  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0687  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  46.9 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2618  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0733  cyclic nucleotide-binding protein  40.09 
 
 		 232 aa  186  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.96 
 
 		 232 aa  161  7e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1694  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233971  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2762  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  24.62 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.62 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1971  transcriptional regulator  24.55 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.4 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.85 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1945  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.68 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.94 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.72 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.94 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 232 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4102  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.83 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.363021  normal  0.0126572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.1 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.3 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.05 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2867  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.343371  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1428  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0334282  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.42 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.33 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0454  cAMP-regulatory protein  22.27 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.993891  normal  0.32004 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.42 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0457  cAMP-regulatory protein  22.27 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.89409  normal  0.110467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.87 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0262  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0238  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  21.28 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.78 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  25.4 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  20.11 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3158  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.17 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0424  cAMP-regulatory protein  21.8 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.328198  normal  0.870698 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  24.87 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0576  CRP/FNR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.670039  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  23.81 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.29 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4632  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  20.63 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  20.63 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.59 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.59 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2941  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.29 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1262  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.247212  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2081  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23 
 
 		 229 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.264181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1523  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.54 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.08 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2547  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.389339  normal  0.365128 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 228 aa  53.1  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  21.47 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  21.16 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  22.46 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.32 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.32 
 
 		 236 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0236133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  20.94 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  20.74 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  24.34 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2928  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.71 
 
 		 232 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.39759 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2755  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.27 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5111  cAMP-regulatory protein  20.94 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  20.42 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1850  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  20.63 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4381  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 231 aa  52.4  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3275  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.7 
 
 		 195 aa  52  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0513046  hitchhiker  0.00943034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4243  Crp/Fnr family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 305 aa  52  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.286118 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>