122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2618 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2618  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  100 
 
 		 228 aa  471  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0709  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  47 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0503167  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0687  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  44.75 
 
 		 228 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0733  cyclic nucleotide-binding protein  38.46 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0714  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  32.88 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2755  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.33 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1971  transcriptional regulator  27.4 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0372  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.55 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0755  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.56 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.125698 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2082  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.04 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2058  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.04 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.607183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1376  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.271211  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2946  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02791  CRP family global nitrogen regulatory protein  26.29 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.696842  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02691  CRP family global nitrogen regulatory protein  25.77 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3283  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 223 aa  57.4  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0248  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02681  CRP family global nitrogen regulatory protein  25.26 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.548193  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0269  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2075  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03241  CRP family global nitrogen regulatory protein  25.76 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1612  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0127  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.867755  normal  0.325855 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1065  Crp/Fnr family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.547512  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2492  response regulator receiver  22.22 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0101485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2023  Crp/FNR family transcriptional regulator  25 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0496812 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.78 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24561  CRP family global nitrogen regulatory protein  25.26 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.24 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1853  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.6 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  22.28 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47010  Carbon monoxide oxidation transcription regulator, Crp/Fnr family: CooA  18.6 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1332  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.407818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 		 231 aa  49.7  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20 
 
 		 236 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1694  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 230 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233971  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  21.63 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  21.63 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  21.63 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  21.63 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  21.63 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  21.63 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  21.63 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  21.63 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  21.63 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.8 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  21.15 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  22.8 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2762  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.21 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  21.15 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2191  cAMP-regulatory protein  23.19 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  21.15 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  21.15 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  21.15 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  21.13 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002279  cyclic AMP receptor protein  23.19 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  17.44 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00075  cAMP-regulatory protein  22.77 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.92 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2796  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.38 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6276  CRP/FNR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.298402  normal  0.17195 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2737  cAMP-regulatory protein  22.28 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  21.63 
 
 		 211 aa  45.4  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1062  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.46 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1250  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.403908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  24.1 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1482  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000238682  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3737  cAMP-regulatory protein  22.44 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0176942 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3771  cAMP-regulatory protein  22.44 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  0.523362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3663  cAMP-regulatory protein  22.44 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3663  cAMP-regulatory protein  22.44 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.185514  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3834  cAMP-regulatory protein  22.44 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.429858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0689  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator  23.94 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03208  DNA-binding transcriptional dual regulator  22.44 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0355  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.44 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000236327  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03160  hypothetical protein  22.44 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0202429  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  19.69 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1592  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.7 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3784  cAMP-regulatory protein  22.71 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0916512  hitchhiker  0.00483948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  21.43 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4632  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 234 aa  43.9  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0369  cAMP-regulatory protein  22.38 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3945  cAMP-regulatory protein  21.95 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3554  cAMP-regulatory protein  22.44 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3827  cAMP-regulatory protein  22.86 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3702  cAMP-regulatory protein  21.95 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4032  cAMP-regulatory protein  22.44 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.203601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3853  cAMP-regulatory protein  22.44 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0248  cAMP-regulatory protein  21.95 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0355  cAMP-regulatory protein  22.44 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0526852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3639  cAMP-regulatory protein  22.44 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.05 
 
 		 225 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3733  cAMP-regulatory protein  22.44 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4667  cAMP-regulatory protein  22.44 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00224827  normal  0.233908 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>