More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0463 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0463  Crp/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
221 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.607183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2554  cyclic nucleotide-binding protein  41.12 
 
 
225 aa  175  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.531309  normal  0.0738389 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2092  cyclic nucleotide-binding protein  35.19 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.052922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1724  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.83 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3227  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.71 
 
 
232 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1411  cyclic nucleotide-binding protein  26.36 
 
 
281 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0270  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
269 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.597021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2775  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.45 
 
 
232 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.9012  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  28.42 
 
 
223 aa  81.3  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0781  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.77 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0113537  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0757  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.54 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0100726  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2386  CRP/FNR family transcriptional regulator  22.86 
 
 
225 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1294  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  27.81 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.957461  normal  0.413121 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.37 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1200  CRP/FNR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0841805  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0327  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.39 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.539351  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1972  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.39 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0968  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.39 
 
 
233 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0355  Crp-like transcriptional regulator  24.75 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.128458  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0755  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.2571 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2039  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.31 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05940  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.66 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.558941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09760  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 
226 aa  73.6  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18160  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.59 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000607267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0778  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
236 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000312841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0754  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
236 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0000212493  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0388  cAMP-regulatory protein  24.35 
 
 
212 aa  72.8  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0189183  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1119  catabolite gene activator (cAMP receptor protein) (cAMP-regulatory protein)  27.51 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.87 
 
 
228 aa  72  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1814  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.47 
 
 
225 aa  72  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.11 
 
 
227 aa  72  0.000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1838  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.64 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0983527  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.73 
 
 
234 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2102  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.55 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1763  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.99 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.796832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1678  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.77 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.5 
 
 
236 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.24 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0624  cAMP-regulatory protein  23.86 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.24 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3873  cAMP-regulatory protein  24.86 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000105148  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3873  cAMP-regulatory protein  23.86 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000159716  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.37 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0618  cAMP-regulatory protein  23.86 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000475791  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3412  cAMP-regulatory protein  23.86 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000398691  normal  0.338767 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3292  cAMP-regulatory protein  23.86 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0112541  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3747  cAMP-regulatory protein  23.86 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0179283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0662  cAMP-regulatory protein  24.86 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000339306  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0608  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.23 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.847542  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0617  cAMP-regulatory protein  23.86 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000135204  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3690  cAMP-regulatory protein  23.86 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0119951  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.56 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0578  cAMP-regulatory protein  23.86 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.001638  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0585  cAMP-regulatory protein  23.86 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000009188  normal  0.481967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0652  cAMP-regulatory protein  23.86 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000433673  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.91 
 
 
239 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0824  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.32 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0928817  normal  0.0486748 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3509  cAMP-regulatory protein  23.86 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000247338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4850  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.08 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3004  cAMP-regulatory protein  23.3 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000032723  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5808  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.98 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.254135  normal  0.0101482 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0106  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.89 
 
 
222 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  21.83 
 
 
227 aa  68.6  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  26.84 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.59 
 
 
231 aa  68.2  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0755  cAMP-regulatory protein  23.86 
 
 
211 aa  67.8  0.0000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3800  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.51 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2066  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0111986  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  25.39 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3468  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3212  CRP/FNR family transcriptional regulator  25.7 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0543887  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
229 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1944  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.47 
 
 
227 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1425  CRP/FNR family transcriptional regulator  26.7 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0139  cAMP-regulatory protein  24.57 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  27.6 
 
 
225 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0705  cyclic nucleotide-binding protein  23.66 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0517  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.49 
 
 
224 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0435  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.52 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.376669 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0548  cAMP-regulatory protein  23.63 
 
 
210 aa  66.6  0.0000000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8112  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.7 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.6 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.96 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1859  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.87 
 
 
220 aa  65.9  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.34 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2357  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.59 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4620  Crp/FNR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.128051 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3550  cAMP-regulatory protein  22.73 
 
 
217 aa  65.1  0.0000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2129  Crp/Fnr family transcriptional regulator  25.43 
 
 
225 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185639  normal  0.344505 
 
 
-
 
NC_002936  DET0299  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.08 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  26.4 
 
 
225 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3190  cAMP-regulatory protein  22.95 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000213612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1633  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.91 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391452  normal  0.0281193 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
229 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  24.73 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.41 
 
 
227 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1939  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  24.29 
 
 
235 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>