153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0172 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_0172  DNA sulfur modification protein DndD  100 
 
 		 664 aa  1329    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2475  hypothetical protein  40.39 
 
 		 658 aa  425  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.255265  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2400  DNA sulfur modification protein DndD  33.93 
 
 		 661 aa  350  6e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2457  DNA sulfur modification protein DndD  33.78 
 
 		 661 aa  347  5e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0218685 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4842  DNA sulfur modification protein DndD  34.96 
 
 		 668 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.883756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2210  hypothetical protein  34.02 
 
 		 662 aa  336  9e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1931  hypothetical protein  33.38 
 
 		 660 aa  323  7e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0280705 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4571  SMC protein-like  36 
 
 		 671 aa  317  3e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.171482  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1369  DNA sulfur modification protein DndD  29.34 
 
 		 677 aa  269  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.24042  normal  0.947657 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0010  DNA sulfur modification protein DndD  29.94 
 
 		 660 aa  269  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0358  SMC protein-like protein  28.78 
 
 		 673 aa  262  1e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0988635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0740  hypothetical protein  29.95 
 
 		 660 aa  256  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.324626  normal  0.305327 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2307  SMC domain-containing protein  29.36 
 
 		 676 aa  249  1e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.267261  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0470  SMC domain-containing protein  27.95 
 
 		 666 aa  229  1e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.349593  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0832  DNA repair ATPase  26.17 
 
 		 663 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1983  DNA repair ATPase  34.22 
 
 		 436 aa  138  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2952  hypothetical protein  25.3 
 
 		 683 aa  127  7e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13796  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0828  ATPase  26.59 
 
 		 671 aa  108  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.877736  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1376  hypothetical protein  21.68 
 
 		 663 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.783168 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1538  DNA repair ATPase-like protein  26.67 
 
 		 657 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.938843  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2480  SMC domain-containing protein  23.55 
 
 		 699 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000187418  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2920  hypothetical protein  23.23 
 
 		 693 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3199  hypothetical protein  23.09 
 
 		 693 aa  72  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2201  hypothetical protein  21.77 
 
 		 690 aa  70.5  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.668811  normal  0.078416 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0498  SMC domain-containing protein  22.62 
 
 		 642 aa  68.2  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.29132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  34.81 
 
 		 1020 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2311  hypothetical protein  47.69 
 
 		 354 aa  63.5  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3664  dsDNA exonuclease SbcC  35.82 
 
 		 1017 aa  63.2  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0005  hypothetical protein  30.05 
 
 		 672 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  27.7 
 
 		 1018 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  27.7 
 
 		 1018 aa  59.3  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  40.38 
 
 		 1020 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2312  hypothetical protein  25.96 
 
 		 260 aa  58.2  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3181  hypothetical protein  30.3 
 
 		 395 aa  56.6  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2151  hypothetical protein  21.34 
 
 		 690 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  27.03 
 
 		 1018 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  27.03 
 
 		 1018 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  27.03 
 
 		 1018 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01270  DNA repair ATPase  34.21 
 
 		 1047 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  27.03 
 
 		 1018 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2573  SMC domain-containing protein  32.5 
 
 		 1023 aa  55.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  26.35 
 
 		 1018 aa  55.1  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2305  SMC domain protein  33.33 
 
 		 1025 aa  55.1  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000506659 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  25.07 
 
 		 1047 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0521  SMC domain protein  33 
 
 		 1011 aa  53.9  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  26.57 
 
 		 1048 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  26.57 
 
 		 1048 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  35 
 
 		 1018 aa  53.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  31.68 
 
 		 1018 aa  53.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  26.57 
 
 		 1047 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  26.57 
 
 		 1047 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  31.68 
 
 		 1018 aa  52.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2166  SMC domain-containing protein  32.08 
 
 		 1249 aa  52.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  26.57 
 
 		 1047 aa  52.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  26.57 
 
 		 1047 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0627  exonuclease  35.05 
 
 		 995 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.246624  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  28.57 
 
 		 1018 aa  52.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  33.33 
 
 		 881 aa  52  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  32.73 
 
 		 1049 aa  52.4  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  33.33 
 
 		 1144 aa  52  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  39.47 
 
 		 1047 aa  51.6  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  39.47 
 
 		 1048 aa  51.6  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  31.82 
 
 		 1018 aa  51.2  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  49.09 
 
 		 1227 aa  51.2  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  31.68 
 
 		 1013 aa  51.2  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05654  DNA repair exonuclease  32.73 
 
 		 1018 aa  51.2  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5894  DNA repair ATPase-like protein  28.16 
 
 		 1029 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0510725  hitchhiker  0.00862936 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  49.09 
 
 		 1227 aa  50.8  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27300  DNA repair ATPase  32.41 
 
 		 1022 aa  50.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0427932  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  28.66 
 
 		 1046 aa  50.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2085  DNA repair ATPase-like protein  25.25 
 
 		 686 aa  50.4  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0395547  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  32.98 
 
 		 1180 aa  50.8  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  34.26 
 
 		 962 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  26.83 
 
 		 890 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  30.83 
 
 		 950 aa  50.4  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  29.8 
 
 		 1042 aa  50.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4360  putative ATP-dependent dsDNA exonuclease  33.68 
 
 		 986 aa  50.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.288982  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1736  SMC domain-containing protein  33 
 
 		 1029 aa  50.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0965884  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  30.61 
 
 		 1018 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  30 
 
 		 1018 aa  50.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  38.16 
 
 		 1046 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  38.16 
 
 		 1046 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  47.27 
 
 		 1046 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  38.16 
 
 		 1046 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  28.4 
 
 		 989 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  31.67 
 
 		 1214 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  35.09 
 
 		 802 aa  49.3  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1924  DNA repair exonuclease, SbcC  40.74 
 
 		 995 aa  49.7  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0557877  decreased coverage  0.00069537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  33.33 
 
 		 1211 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  35.09 
 
 		 891 aa  50.1  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  32.23 
 
 		 1214 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  43.86 
 
 		 891 aa  48.9  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  45.45 
 
 		 1165 aa  49.3  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  27.59 
 
 		 1214 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31440  DNA repair ATPase  40 
 
 		 986 aa  48.9  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.651152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  31.67 
 
 		 1214 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  32.67 
 
 		 1020 aa  48.5  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  32.23 
 
 		 1214 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  45.45 
 
 		 1083 aa  48.5  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  29.05 
 
 		 926 aa  48.5  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>