More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0304 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0304  histidine kinase  100 
 
 		 697 aa  1376    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0625  hypothetical protein  47.31 
 
 		 683 aa  603  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0156  histidine kinase  42.34 
 
 		 905 aa  472  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.541599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2939  putative sensor with HAMP domain  41.53 
 
 		 669 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8784  hypothetical protein  42.4 
 
 		 637 aa  465  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3337  putative sensor with HAMP domain  39.68 
 
 		 807 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.966356  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0356  hypothetical protein  40.63 
 
 		 735 aa  461  9.999999999999999e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00751906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3805  putative sensor with HAMP domain  40.22 
 
 		 821 aa  428  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3193  hypothetical protein  40.75 
 
 		 817 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2806  histidine kinase  38.97 
 
 		 797 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222704  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3599  nitrate and nitrite sensing domain-containing protein  39.62 
 
 		 841 aa  385  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.487934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3980  sensor protein  40.21 
 
 		 843 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0120875 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1289  histidine kinase  38.11 
 
 		 801 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.130589  hitchhiker  0.00742101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3669  histidine kinase  37.96 
 
 		 854 aa  376  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.473559  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3255  histidine kinase  39.34 
 
 		 769 aa  379  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.43957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2384  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.09 
 
 		 1132 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02250  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  35.15 
 
 		 991 aa  334  4e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2444  ATP-binding region, ATPase-like  34.8 
 
 		 836 aa  331  4e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1433  ATP-binding region, ATPase-like  35.5 
 
 		 795 aa  327  6e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2860  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 		 1007 aa  320  5e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.984065  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0278  putative sensor with HAMP domain  34.91 
 
 		 854 aa  320  6e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2050  ATP-binding region, ATPase-like  33.56 
 
 		 763 aa  317  4e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.797326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2066  ATP-binding region ATPase domain protein  34.12 
 
 		 818 aa  301  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37470  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase  34.43 
 
 		 839 aa  298  3e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0974  histidine kinase  33.97 
 
 		 950 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.137701  normal  0.407195 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2200  putative sensor with HAMP domain  36.45 
 
 		 769 aa  291  3e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.930898  hitchhiker  0.000377518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5990  sensor protein  34.52 
 
 		 1281 aa  279  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.330888  normal  0.0251678 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7862  putative sensor with HAMP domain  33.65 
 
 		 1560 aa  276  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.712713 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3054  putative sensor with HAMP domain  44.5 
 
 		 829 aa  273  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3126  hypothetical protein  32.11 
 
 		 805 aa  270  5e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.51395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1797  hypothetical protein  33.92 
 
 		 950 aa  267  4e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0389  sensor protein  31.89 
 
 		 1026 aa  264  4.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206732  normal  0.420146 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0644  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 1282 aa  261  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1803  putative sensor with HAMP domain  33.91 
 
 		 973 aa  258  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0110319  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3048  putative sensor with HAMP domain  32.68 
 
 		 965 aa  253  6e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138126  normal  0.807901 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0813  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 1119 aa  253  9.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.067118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1821  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.62 
 
 		 1049 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.284128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2045  ATP-binding region, ATPase-like  35.6 
 
 		 687 aa  251  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0970  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  31.79 
 
 		 1051 aa  248  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0961575 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1788  hypothetical protein  32.07 
 
 		 974 aa  241  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0458  putative sensor with HAMP domain  32.3 
 
 		 1092 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0940  signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 1077 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1808  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.05 
 
 		 957 aa  237  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5172  putative sensor with HAMP domain  32.12 
 
 		 1023 aa  234  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24610  signal transduction histidine kinase  32.22 
 
 		 1182 aa  232  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.685325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0760  histidine kinase  33.5 
 
 		 1148 aa  228  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0211999 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3228  sensor protein  30.36 
 
 		 817 aa  228  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0816  ATPase domain-containing protein  31.19 
 
 		 1164 aa  226  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.480121  normal  0.16017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1145  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  40.41 
 
 		 670 aa  224  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34290  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  30.37 
 
 		 996 aa  224  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5418  putative sensor with HAMP domain  44.03 
 
 		 1060 aa  222  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 1268 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.67551  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34340  nitrate/nitrite-sensing histidine kinase with HAMP domain protein  30.34 
 
 		 879 aa  219  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2826  ATP-binding region, ATPase-like  30.66 
 
 		 1004 aa  214  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.869401 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4266  histidine kinase  30.85 
 
 		 1031 aa  211  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3875  ATPase domain-containing protein  30.73 
 
 		 1022 aa  206  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.122967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01800  HAMP domain-containing histidine kinase  35.2 
 
 		 1310 aa  204  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0171  histidine kinase  30.13 
 
 		 1152 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.370967  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5183  histidine kinase  40.56 
 
 		 863 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3381  histidine kinase  39.69 
 
 		 799 aa  191  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0645358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5272  histidine kinase  39.48 
 
 		 1047 aa  190  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0272  putative sensor with HAMP domain  40.44 
 
 		 1402 aa  189  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.152127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3314  putative sensor with HAMP domain  40.06 
 
 		 1000 aa  187  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3848  histidine kinase HAMP region domain protein  42.46 
 
 		 733 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.629022  normal  0.0726472 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0310  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.18 
 
 		 1034 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.284011  normal  0.0972051 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1536  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 860 aa  181  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.276779  normal  0.310149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.32 
 
 		 1435 aa  180  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00114048  normal  0.193576 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0699  sensor protein  32.68 
 
 		 839 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.21511  normal  0.286322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 851 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4130  histidine kinase  27.68 
 
 		 832 aa  171  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1206  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 851 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1216  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.1 
 
 		 851 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0769481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2445  putative sensor with HAMP domain  41.9 
 
 		 1076 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448379 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13401  hypothetical protein  37.29 
 
 		 876 aa  169  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00581352  normal  0.147663 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4330  ATP-binding region, ATPase-like  33.25 
 
 		 516 aa  167  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3692  putative sensor with HAMP domain-containing protein  32.25 
 
 		 814 aa  164  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22058  normal  0.92604 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0757  ATPase domain-containing protein  34.56 
 
 		 798 aa  165  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1514  histidine kinase  32.43 
 
 		 895 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.483804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2844  histidine kinase  34.99 
 
 		 794 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.27066  normal  0.363063 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5599  histidine kinase  34.58 
 
 		 764 aa  160  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4889  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 		 803 aa  158  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.03086 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0363  ATP-binding region ATPase domain protein  41.96 
 
 		 769 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.518292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2534  ATP-binding region ATPase domain protein  36.4 
 
 		 436 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2755  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 453 aa  144  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.136018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5487  ATPase domain-containing protein  33.83 
 
 		 600 aa  140  6e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556771  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2807  ATP-binding region, ATPase-like  32.98 
 
 		 465 aa  139  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.592977  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06940  signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 		 412 aa  138  3.0000000000000003e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.520688  normal  0.077784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1060  ATP-binding region ATPase domain protein  39.91 
 
 		 484 aa  138  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.497874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0489  histidine kinase  36.99 
 
 		 832 aa  137  5e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4816  ATP-binding region ATPase domain protein  34.84 
 
 		 630 aa  131  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.33051  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5470  histidine kinase  32.87 
 
 		 575 aa  122  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1437  ATP-binding region ATPase domain protein  39.69 
 
 		 485 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.95356  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33570  histidine kinase  35.25 
 
 		 524 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.112009  normal  0.643392 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1138  ATP-binding region ATPase domain protein  29.93 
 
 		 539 aa  100  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4180  ATP-binding region ATPase domain protein  30.12 
 
 		 458 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412198  normal  0.250223 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  32.19 
 
 		 483 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5024  histidine kinase  32.28 
 
 		 485 aa  61.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168004  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2343  histidine kinase  31.07 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3487  hypothetical protein  35.92 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 515 aa  58.5  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>