More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0924 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 
627 aa  1291    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  44.46 
 
 
604 aa  535  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  43.96 
 
 
596 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  42.16 
 
 
609 aa  486  1e-136  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.05 
 
 
618 aa  484  1e-135  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  40.5 
 
 
597 aa  481  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  40.3 
 
 
611 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.65 
 
 
573 aa  458  1e-127  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  40.13 
 
 
599 aa  441  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  38.95 
 
 
1228 aa  429  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  37.34 
 
 
592 aa  418  9.999999999999999e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.5 
 
 
578 aa  380  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  34.39 
 
 
602 aa  375  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.23 
 
 
590 aa  351  2e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  34.83 
 
 
593 aa  347  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.73 
 
 
584 aa  342  1e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  35.54 
 
 
595 aa  340  5.9999999999999996e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  32.46 
 
 
584 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.95 
 
 
1091 aa  336  5.999999999999999e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.25 
 
 
576 aa  334  3e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  34.65 
 
 
587 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  34.65 
 
 
587 aa  333  4e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  34.07 
 
 
599 aa  331  3e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  33.5 
 
 
677 aa  330  5.0000000000000004e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  33.17 
 
 
584 aa  327  3e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.89 
 
 
597 aa  325  2e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.06 
 
 
583 aa  324  3e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.58 
 
 
580 aa  324  3e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  33.76 
 
 
608 aa  323  6e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.23 
 
 
581 aa  321  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  33.72 
 
 
606 aa  322  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
588 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  32.45 
 
 
593 aa  320  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  32.63 
 
 
619 aa  318  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  32.14 
 
 
584 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  34.51 
 
 
600 aa  316  7e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  33.9 
 
 
580 aa  307  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.72 
 
 
595 aa  307  4.0000000000000004e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.8 
 
 
593 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  32.71 
 
 
573 aa  306  6e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32 
 
 
589 aa  306  6e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  32.71 
 
 
573 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  33.9 
 
 
608 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  33.39 
 
 
611 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.96 
 
 
588 aa  303  5.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  32.55 
 
 
618 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  32.01 
 
 
609 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.38 
 
 
596 aa  301  2e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  31.24 
 
 
590 aa  301  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  30.64 
 
 
1194 aa  300  7e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.24 
 
 
590 aa  300  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  30.91 
 
 
579 aa  297  4e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.72 
 
 
581 aa  293  6e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  31.54 
 
 
588 aa  293  6e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  32.53 
 
 
598 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  33.39 
 
 
600 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  31.99 
 
 
598 aa  291  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  32.38 
 
 
597 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  32.7 
 
 
581 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  33.53 
 
 
606 aa  286  1.0000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  32.16 
 
 
596 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.48 
 
 
612 aa  284  3.0000000000000004e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.78 
 
 
579 aa  283  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.16 
 
 
572 aa  282  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  34.35 
 
 
593 aa  281  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  31.19 
 
 
587 aa  280  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.39 
 
 
583 aa  280  5e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  32.05 
 
 
607 aa  280  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  34.13 
 
 
578 aa  279  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  30.84 
 
 
576 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  31.35 
 
 
611 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  31.31 
 
 
579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  35.21 
 
 
619 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.24 
 
 
573 aa  273  5.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  32.41 
 
 
578 aa  273  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  31.02 
 
 
579 aa  272  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  33.91 
 
 
596 aa  273  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  30.33 
 
 
605 aa  271  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  29.96 
 
 
581 aa  269  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.23 
 
 
574 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.85 
 
 
581 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.93 
 
 
574 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.14 
 
 
577 aa  266  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  31.06 
 
 
592 aa  266  1e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  32.23 
 
 
581 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  32.87 
 
 
581 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  33.08 
 
 
577 aa  264  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  28.57 
 
 
578 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  28.57 
 
 
578 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  31.67 
 
 
603 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  28.5 
 
 
581 aa  260  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.75 
 
 
581 aa  259  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  30.76 
 
 
573 aa  258  2e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.96 
 
 
603 aa  258  3e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.46 
 
 
581 aa  258  3e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  32.45 
 
 
577 aa  257  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.25 
 
 
593 aa  257  5e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  31.36 
 
 
1138 aa  256  9e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  31.59 
 
 
577 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  31.59 
 
 
577 aa  255  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>