More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0640 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0640  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
744 aa  1504    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0181  methyl-accepting chemotaxis protein  47.27 
 
 
696 aa  474  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00160845  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0619  methyl-accepting chemotaxis protein  50.35 
 
 
696 aa  462  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00139031  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2142  methyl-accepting chemotaxis protein  49.48 
 
 
712 aa  464  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0178  methyl-accepting chemotaxis protein  47.07 
 
 
696 aa  454  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000210736  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0850  methyl-accepting chemotaxis protein  46.84 
 
 
721 aa  454  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000224033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0484  methyl-accepting chemotaxis protein  49.31 
 
 
706 aa  448  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00175726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2783  methyl-accepting chemotaxis protein  46.1 
 
 
705 aa  449  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.260069  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1284  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  46.18 
 
 
707 aa  440  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2270  methyl-accepting chemotaxis protein  41.39 
 
 
699 aa  440  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000173504  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1009  methyl-accepting chemotaxis protein  47.72 
 
 
697 aa  437  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0345  methyl-accepting chemotaxis protein DmcB  60.21 
 
 
410 aa  431  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2549  methyl-accepting chemotaxis protein  46.22 
 
 
699 aa  432  1e-119  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0016673  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0072  methyl-accepting chemotaxis protein  43.84 
 
 
712 aa  314  3.9999999999999997e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0347  methyl-accepting chemotaxis protein DmcA  35.33 
 
 
729 aa  294  5e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1386  methyl-accepting chemotaxis protein  40.19 
 
 
611 aa  254  5.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.68 
 
 
649 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.127099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.69 
 
 
720 aa  228  3e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000403269  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1054  methyl-accepting chemotaxis protein  36.55 
 
 
692 aa  225  2e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00043245  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3293  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.59 
 
 
720 aa  217  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.601  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  29.87 
 
 
713 aa  207  7e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.1 
 
 
785 aa  205  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.83 
 
 
730 aa  204  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4113  methyl-accepting chemotaxis protein  26.26 
 
 
778 aa  202  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.433818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6717  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.65 
 
 
741 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.447835  normal  0.587139 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.1 
 
 
730 aa  201  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0943  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.32 
 
 
793 aa  200  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.27721  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3161  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.41 
 
 
731 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.072786  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1730  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.93 
 
 
707 aa  196  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000446671  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2682  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  25.68 
 
 
723 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.121525  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0972  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  27.03 
 
 
779 aa  187  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412028  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  28.77 
 
 
695 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000221184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0439  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  25.15 
 
 
740 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.86 
 
 
657 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0007  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.83 
 
 
636 aa  179  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3926  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.69 
 
 
665 aa  178  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0006  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.45 
 
 
667 aa  177  4e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4431  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  29.12 
 
 
629 aa  177  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  28.68 
 
 
738 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3984  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.5 
 
 
688 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1338  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.53 
 
 
957 aa  173  1e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.578016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4675  methyl-accepting chemotaxis protein  26.28 
 
 
701 aa  170  8e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.595763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  24.72 
 
 
712 aa  169  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5329  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.82 
 
 
691 aa  169  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.8679  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.57 
 
 
625 aa  167  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.4 
 
 
735 aa  167  8e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  25.16 
 
 
712 aa  167  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.5 
 
 
628 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.5 
 
 
628 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1099  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.93 
 
 
699 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.28 
 
 
714 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  25.84 
 
 
629 aa  164  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  27.45 
 
 
714 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  24.05 
 
 
643 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  27.89 
 
 
632 aa  163  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  27.53 
 
 
626 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  26.44 
 
 
629 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  25.5 
 
 
629 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  24.53 
 
 
713 aa  162  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.61 
 
 
716 aa  160  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  27.76 
 
 
632 aa  159  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2546  chemotaxis sensory transducer  25.52 
 
 
690 aa  159  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  25.12 
 
 
688 aa  159  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  24.49 
 
 
712 aa  158  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  29.18 
 
 
629 aa  158  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  27 
 
 
630 aa  158  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  25.49 
 
 
626 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.63 
 
 
624 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.82 
 
 
832 aa  157  8e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00284544  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  27.06 
 
 
714 aa  157  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.6 
 
 
688 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  25.82 
 
 
626 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2154  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.04 
 
 
627 aa  155  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0789614  normal  0.507372 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2086  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.96 
 
 
657 aa  154  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  28.9 
 
 
639 aa  154  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.41 
 
 
688 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  27.17 
 
 
714 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.99 
 
 
714 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.1 
 
 
951 aa  151  4e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143462  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.55 
 
 
660 aa  151  5e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.34 
 
 
707 aa  151  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.852924  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.55 
 
 
660 aa  150  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1450  methyl-accepting chemotaxis protein  24.5 
 
 
706 aa  149  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000571496  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.06 
 
 
714 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.76 
 
 
626 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.55 
 
 
746 aa  148  3e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.2502  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.46 
 
 
624 aa  148  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000033578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  26.6 
 
 
715 aa  148  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1220  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.8 
 
 
706 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3170  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.8 
 
 
706 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.942476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1187  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.8 
 
 
706 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  27.4 
 
 
629 aa  147  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2273  methyl-accepting chemotaxis protein  28.72 
 
 
650 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.487735  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3088  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.37 
 
 
706 aa  146  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193815  hitchhiker  0.00820004 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1951  methyl-accepting chemotaxis protein  26.54 
 
 
720 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1371  methyl-accepting chemotaxis transducer  26.28 
 
 
624 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.318672 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0128  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.34 
 
 
663 aa  145  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0154965  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1699  methyl-accepting chemotaxis protein  28.81 
 
 
660 aa  145  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.606414  hitchhiker  0.000000000000351139 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2246  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  26.09 
 
 
629 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.265681  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2909  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.93 
 
 
706 aa  145  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.307732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>