More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0619 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0178  methyl-accepting chemotaxis protein  68.44 
 
 		 696 aa  917    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000210736  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0181  methyl-accepting chemotaxis protein  70.63 
 
 		 696 aa  978    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00160845  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0484  methyl-accepting chemotaxis protein  62.88 
 
 		 706 aa  850    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00175726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0619  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 696 aa  1410    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00139031  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0850  methyl-accepting chemotaxis protein  59.71 
 
 		 721 aa  779    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000224033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1009  methyl-accepting chemotaxis protein  65.57 
 
 		 697 aa  894    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1284  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  52.14 
 
 		 707 aa  669    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2142  methyl-accepting chemotaxis protein  67.43 
 
 		 712 aa  691    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2270  methyl-accepting chemotaxis protein  55.6 
 
 		 699 aa  732    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000173504  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2549  methyl-accepting chemotaxis protein  72.99 
 
 		 699 aa  1006    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0016673  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2783  methyl-accepting chemotaxis protein  59.05 
 
 		 705 aa  800    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.260069  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0345  methyl-accepting chemotaxis protein DmcB  74.74 
 
 		 410 aa  568  1e-160  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0640  methyl-accepting chemotaxis protein  50.35 
 
 		 744 aa  477  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0072  methyl-accepting chemotaxis protein  52.11 
 
 		 712 aa  381  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0347  methyl-accepting chemotaxis protein DmcA  40.14 
 
 		 729 aa  363  4e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1054  methyl-accepting chemotaxis protein  42.28 
 
 		 692 aa  267  5.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00043245  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1386  methyl-accepting chemotaxis protein  38.11 
 
 		 611 aa  255  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.09 
 
 		 650 aa  233  9e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0346  protease PrtB  48.8 
 
 		 274 aa  211  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.18 
 
 		 664 aa  200  9e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0344435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1338  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.94 
 
 		 957 aa  196  9e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.578016  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1435  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.43 
 
 		 678 aa  190  5.999999999999999e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000167242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.46 
 
 		 663 aa  189  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.113755  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2162  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.51 
 
 		 665 aa  185  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.68 
 
 		 658 aa  184  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3450  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.8 
 
 		 664 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.1 
 
 		 655 aa  179  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.85 
 
 		 679 aa  177  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.5 
 
 		 695 aa  177  8e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  28.22 
 
 		 632 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2151  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.21 
 
 		 656 aa  173  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.62 
 
 		 661 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  26.79 
 
 		 629 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  27.45 
 
 		 629 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0918  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.49 
 
 		 657 aa  167  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.17 
 
 		 638 aa  167  9e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.884167  hitchhiker  0.000462611 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  26.14 
 
 		 629 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  25.8 
 
 		 632 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  25.66 
 
 		 632 aa  164  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3786  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.57 
 
 		 610 aa  164  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0254049  normal  0.3858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  26.66 
 
 		 629 aa  163  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.7 
 
 		 630 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  24.84 
 
 		 626 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  26.02 
 
 		 658 aa  161  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.96 
 
 		 660 aa  160  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  26.2 
 
 		 658 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  26.2 
 
 		 658 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  26.2 
 
 		 658 aa  160  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0488  methyl-accepting chemotaxis protein  24.66 
 
 		 660 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  26.18 
 
 		 658 aa  160  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.54 
 
 		 951 aa  159  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143462  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0354  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  26.32 
 
 		 630 aa  159  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.04 
 
 		 628 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.96 
 
 		 638 aa  159  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  27.04 
 
 		 643 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.3 
 
 		 625 aa  158  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  27.5 
 
 		 660 aa  158  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  26.37 
 
 		 658 aa  157  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.04 
 
 		 638 aa  157  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  27.9 
 
 		 660 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4882  methyl-accepting chemotaxis protein  25.74 
 
 		 666 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  27.9 
 
 		 660 aa  157  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  27.9 
 
 		 660 aa  157  6e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  27.9 
 
 		 660 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5256  methyl-accepting chemotaxis protein  25.74 
 
 		 666 aa  157  6e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.51 
 
 		 650 aa  157  9e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0469  methyl-accepting chemotaxis protein  26.06 
 
 		 658 aa  156  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.683606  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5151  methyl-accepting chemotaxis protein  23.76 
 
 		 666 aa  156  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  24.52 
 
 		 660 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4724  methyl-accepting chemotaxis protein  25.74 
 
 		 666 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  24.52 
 
 		 660 aa  156  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  24.96 
 
 		 626 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00464  methyl-accepting chemotaxis protein  24.72 
 
 		 636 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0486  methyl-accepting chemotaxis protein  24.52 
 
 		 660 aa  155  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0631  methyl-accepting chemotaxis protein  24.52 
 
 		 660 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5124  methyl-accepting chemotaxis protein  25.74 
 
 		 669 aa  155  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.23 
 
 		 640 aa  155  2e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.51 
 
 		 628 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.69 
 
 		 658 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  25.8 
 
 		 660 aa  154  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2088  methyl-accepting chemotaxis protein  28.08 
 
 		 660 aa  154  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.35017  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.94 
 
 		 634 aa  154  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2122  methyl-accepting chemotaxis protein  27.4 
 
 		 660 aa  153  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0687  methyl-accepting chemotaxis protein  26.04 
 
 		 658 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1723  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.22 
 
 		 626 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0124  chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  25.27 
 
 		 626 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.201174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  26.61 
 
 		 666 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5569  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.98 
 
 		 630 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5156  methyl-accepting chemotaxis protein  26.41 
 
 		 666 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.82 
 
 		 660 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4352  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.16 
 
 		 624 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132701 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0619  methyl-accepting chemotaxis protein  25.83 
 
 		 658 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  24.89 
 
 		 629 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3295  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.27 
 
 		 720 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000403269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.99 
 
 		 638 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.92 
 
 		 624 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.53 
 
 		 675 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  24.09 
 
 		 639 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.71 
 
 		 609 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.98 
 
 		 657 aa  148  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>