89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0346 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0346  protease PrtB  100 
 
 		 274 aa  560  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1009  methyl-accepting chemotaxis protein  48.4 
 
 		 697 aa  250  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0178  methyl-accepting chemotaxis protein  49.2 
 
 		 696 aa  241  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000210736  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2549  methyl-accepting chemotaxis protein  49.6 
 
 		 699 aa  239  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0016673  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0181  methyl-accepting chemotaxis protein  47.64 
 
 		 696 aa  232  5e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00160845  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0484  methyl-accepting chemotaxis protein  46.8 
 
 		 706 aa  229  4e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00175726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0619  methyl-accepting chemotaxis protein  48.8 
 
 		 696 aa  207  1e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00139031  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2783  methyl-accepting chemotaxis protein  42.25 
 
 		 705 aa  194  9e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.260069  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0850  methyl-accepting chemotaxis protein  39.44 
 
 		 721 aa  186  3e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000224033  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2270  methyl-accepting chemotaxis protein  37.85 
 
 		 699 aa  185  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000173504  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1284  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  29.55 
 
 		 707 aa  116  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1148  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  32.13 
 
 		 650 aa  106  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.605213  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1435  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.73 
 
 		 678 aa  103  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000167242  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2162  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.24 
 
 		 665 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3450  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.86 
 
 		 664 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4543  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.9 
 
 		 663 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.113755  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0749  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.72 
 
 		 657 aa  73.2  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.388814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0680  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.39 
 
 		 679 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0516  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28 
 
 		 664 aa  70.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0344435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04800  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.29 
 
 		 658 aa  67.4  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22560  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.47 
 
 		 659 aa  65.1  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2151  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 		 656 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  30.53 
 
 		 604 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2760  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.74 
 
 		 639 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.82 
 
 		 695 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0266885  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2152  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.33 
 
 		 655 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.697016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1501  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  35.56 
 
 		 681 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.78 
 
 		 684 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0545  methyl-accepting chemotaxis protein (MCP)  23.74 
 
 		 676 aa  57  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.25556e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  26.35 
 
 		 811 aa  57.4  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3269  sensor protein  26.41 
 
 		 619 aa  56.2  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2999  diguanylate cyclase  23.35 
 
 		 548 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0284  Cache domain protein  25.69 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 		 552 aa  52.4  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0651  diguanylate cyclase  25.23 
 
 		 574 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000777615  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  19.26 
 
 		 678 aa  50.8  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.59 
 
 		 677 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0173542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.35 
 
 		 646 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.21 
 
 		 686 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4649  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.27 
 
 		 653 aa  49.7  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2968  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.74 
 
 		 673 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000001862  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0679  putative chemotaxis signal transduction protein  28.28 
 
 		 125 aa  48.9  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 		 508 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0174896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  32.97 
 
 		 649 aa  47.8  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 		 885 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.25 
 
 		 334 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06690  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.98 
 
 		 534 aa  47.4  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3325  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.21 
 
 		 491 aa  46.6  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3307  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  22.78 
 
 		 646 aa  46.6  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.154231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  25.29 
 
 		 705 aa  46.2  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3992  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 		 599 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 		 599 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.480091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.74 
 
 		 626 aa  45.8  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2567  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 768 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0479714  hitchhiker  0.00000000485501 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20990  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.06 
 
 		 654 aa  44.7  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000706955  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3790  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.37 
 
 		 599 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.178746 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  29.06 
 
 		 654 aa  45.4  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0425  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  29.92 
 
 		 630 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.461628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5980  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.37 
 
 		 599 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4256  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.37 
 
 		 599 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.844754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1642  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 		 599 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.255489 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2779  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 		 465 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.01 
 
 		 658 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.89 
 
 		 632 aa  44.3  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3741  putative PAS/PAC sensor protein  21.18 
 
 		 1268 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2315  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 		 679 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0977353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3886  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 		 580 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000303887  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0384  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.04 
 
 		 532 aa  43.9  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.93 
 
 		 609 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4247  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.39 
 
 		 599 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22390  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.88 
 
 		 675 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  30.7 
 
 		 1153 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with GAF sensor  30.7 
 
 		 1153 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.970502 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  24.89 
 
 		 627 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.55 
 
 		 630 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3534  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  25 
 
 		 629 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.667463  normal  0.0882884 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0556  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30 
 
 		 690 aa  43.1  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0606  putative methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  27.78 
 
 		 617 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.535208  normal  0.212062 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  35.05 
 
 		 653 aa  43.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.55 
 
 		 630 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30 
 
 		 690 aa  42.7  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.22 
 
 		 630 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  29.17 
 
 		 655 aa  42.7  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  29.17 
 
 		 655 aa  42.7  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  27.27 
 
 		 652 aa  42.4  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.22 
 
 		 630 aa  42.4  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  24.53 
 
 		 638 aa  42.4  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  28.46 
 
 		 624 aa  42.4  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 997 aa  42.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>