More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1086 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  100 
 
 		 354 aa  724    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  76.29 
 
 		 353 aa  572  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  74.64 
 
 		 354 aa  549  1e-155  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  74.36 
 
 		 354 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  75.22 
 
 		 349 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  72 
 
 		 350 aa  537  1e-151  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  72.29 
 
 		 350 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  70.25 
 
 		 354 aa  529  1e-149  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  68.86 
 
 		 351 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  67.43 
 
 		 352 aa  506  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  67.43 
 
 		 352 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  67.43 
 
 		 352 aa  504  9.999999999999999e-143  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  68.51 
 
 		 352 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  68.19 
 
 		 352 aa  489  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  65 
 
 		 346 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  64.52 
 
 		 346 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  63.93 
 
 		 346 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  63.34 
 
 		 346 aa  465  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  55.79 
 
 		 339 aa  417  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  53.43 
 
 		 409 aa  403  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  53.55 
 
 		 365 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  54.83 
 
 		 321 aa  374  1e-102  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20757  uroporphyrinogen decarboxylase  46.92 
 
 		 431 aa  323  3e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0771142  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  44.21 
 
 		 360 aa  285  8e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3008  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  44.14 
 
 		 357 aa  279  6e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  41.98 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  41.4 
 
 		 340 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3020  uroporphyrinogen decarboxylase  42.46 
 
 		 351 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  41.3 
 
 		 335 aa  275  7e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1058  uroporphyrinogen decarboxylase  40.12 
 
 		 364 aa  275  8e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0123  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 		 354 aa  275  9e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0180562  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3425  uroporphyrinogen decarboxylase  40 
 
 		 342 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014949  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  38.94 
 
 		 352 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5896  uroporphyrinogen decarboxylase  44.35 
 
 		 354 aa  272  5.000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1748  uroporphyrinogen decarboxylase  42.14 
 
 		 348 aa  272  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0130  uroporphyrinogen decarboxylase  40.41 
 
 		 351 aa  271  1e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0339923  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  38.64 
 
 		 353 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  41.4 
 
 		 339 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0468  uroporphyrinogen decarboxylase  41.06 
 
 		 354 aa  270  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.551624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6506  uroporphyrinogen decarboxylase  40.65 
 
 		 339 aa  269  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  40.88 
 
 		 352 aa  268  8.999999999999999e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0946  uroporphyrinogen decarboxylase  40.41 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0448  uroporphyrinogen decarboxylase  40.82 
 
 		 355 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  41.52 
 
 		 343 aa  268  1e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  39.83 
 
 		 359 aa  268  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1292  uroporphyrinogen decarboxylase  40.88 
 
 		 356 aa  268  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1187  uroporphyrinogen decarboxylase  42.26 
 
 		 353 aa  268  1e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002177  uroporphyrinogen III decarboxylase  39.83 
 
 		 355 aa  267  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3422  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 		 354 aa  267  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  39.88 
 
 		 340 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 354 aa  268  2e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0427  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 		 354 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  38.17 
 
 		 348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0440  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.47 
 
 		 354 aa  266  4e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.104978 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  40.52 
 
 		 340 aa  266  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  41.81 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0272  uroporphyrinogen decarboxylase  39.77 
 
 		 352 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.109144 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  40.52 
 
 		 380 aa  266  5e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  40.77 
 
 		 354 aa  266  5.999999999999999e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.844287  normal  0.0137069 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2341  uroporphyrinogen decarboxylase  39.23 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00219  uroporphyrinogen decarboxylase  38.95 
 
 		 355 aa  265  1e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0609  uroporphyrinogen decarboxylase  42.12 
 
 		 354 aa  264  1e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.884937  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2714  uroporphyrinogen decarboxylase  39.53 
 
 		 351 aa  265  1e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0245  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 355 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1992  uroporphyrinogen decarboxylase  39.23 
 
 		 351 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0332  uroporphyrinogen decarboxylase  39.75 
 
 		 350 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0475139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 354 aa  262  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0439  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3590  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2765  uroporphyrinogen decarboxylase  41.64 
 
 		 365 aa  263  4.999999999999999e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0435  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 354 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0689  uroporphyrinogen decarboxylase  41.83 
 
 		 354 aa  262  6e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0223  uroporphyrinogen decarboxylase  39.65 
 
 		 354 aa  262  6e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0482  uroporphyrinogen decarboxylase  39.59 
 
 		 354 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03630  uroporphyrinogen decarboxylase  39.94 
 
 		 343 aa  262  8e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0377  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00215009  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0219  uroporphyrinogen decarboxylase  39.65 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3406  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0116  uroporphyrinogen decarboxylase  41.06 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.754255  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1818  uroporphyrinogen decarboxylase  40.18 
 
 		 402 aa  260  2e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.935684  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2851  uroporphyrinogen decarboxylase  38.66 
 
 		 355 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.180798  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3920  uroporphyrinogen decarboxylase  40.48 
 
 		 354 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0387  uroporphyrinogen decarboxylase  41.25 
 
 		 354 aa  260  3e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4042  uroporphyrinogen decarboxylase  40.48 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.984022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0413  uroporphyrinogen decarboxylase  40.48 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3846  uroporphyrinogen decarboxylase  40.48 
 
 		 354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118509 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0251  uroporphyrinogen decarboxylase  38.35 
 
 		 351 aa  258  9e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.821676  normal  0.456057 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0174  uroporphyrinogen decarboxylase  38.64 
 
 		 351 aa  258  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2681  uroporphyrinogen decarboxylase  39.3 
 
 		 354 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.418282 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5466  uroporphyrinogen decarboxylase  38.78 
 
 		 354 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.843277 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0287  uroporphyrinogen decarboxylase  39.53 
 
 		 351 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551213 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0210  uroporphyrinogen decarboxylase  39.58 
 
 		 354 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0124917 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6502  uroporphyrinogen decarboxylase  39.17 
 
 		 341 aa  256  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.607973 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03874  uroporphyrinogen decarboxylase  38.48 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3997  uroporphyrinogen decarboxylase  38.48 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03827  hypothetical protein  38.48 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4540  uroporphyrinogen decarboxylase  38.48 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4488  uroporphyrinogen decarboxylase  38.48 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4231  uroporphyrinogen decarboxylase  38.48 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>