More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0736 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 497 aa  1025    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  62.03 
 
 		 481 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  51.27 
 
 		 479 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  50.66 
 
 		 484 aa  502  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  46.62 
 
 		 487 aa  444  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  45.83 
 
 		 487 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  46.19 
 
 		 487 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 		 485 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  43.49 
 
 		 485 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  43.07 
 
 		 485 aa  414  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  43.7 
 
 		 485 aa  410  1e-113  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  43.15 
 
 		 481 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  42.24 
 
 		 481 aa  391  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  34.9 
 
 		 321 aa  177  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  33.77 
 
 		 332 aa  172  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  36.04 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 331 aa  159  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  31.79 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  29.48 
 
 		 337 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  30.45 
 
 		 350 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  31.76 
 
 		 364 aa  130  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  29.48 
 
 		 337 aa  130  6e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  29.81 
 
 		 349 aa  125  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  28.01 
 
 		 334 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  30.43 
 
 		 364 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  29.28 
 
 		 326 aa  109  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  30.12 
 
 		 310 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2585  OmpA/MotB domain-containing protein  28.96 
 
 		 310 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  27.74 
 
 		 319 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  36.51 
 
 		 422 aa  88.6  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.98 
 
 		 447 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 263 aa  87.8  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  43.27 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  40.19 
 
 		 321 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  45.45 
 
 		 337 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2990  OmpA/MotB domain-containing protein  27.07 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.83716  normal  0.0642517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  37.5 
 
 		 429 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  37.21 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  39.02 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  38.21 
 
 		 344 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0810  OmpA domain-containing protein  40.57 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.716109  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  37.29 
 
 		 407 aa  83.2  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  38.21 
 
 		 344 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0775  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 457 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  38.21 
 
 		 344 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  37.4 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  40.95 
 
 		 244 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  38.21 
 
 		 345 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  35.34 
 
 		 403 aa  81.6  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  34.44 
 
 		 209 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  42.42 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  34.44 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  39.81 
 
 		 420 aa  80.5  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  37.84 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  42.71 
 
 		 623 aa  80.1  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  42 
 
 		 331 aa  80.1  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0241  OmpA/MotB domain-containing protein  36.61 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  37.61 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  35.77 
 
 		 344 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.78 
 
 		 478 aa  79.7  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  37.74 
 
 		 327 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  41.35 
 
 		 345 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2757  putative outer membrane lipoprotein  33.59 
 
 		 160 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.116959  decreased coverage  0.00399171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  40.2 
 
 		 240 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0728  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 		 209 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  38.53 
 
 		 217 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  35.11 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  35.11 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  37.72 
 
 		 388 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  36.7 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  37.74 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02494  predicted outer membrane lipoprotein  33.59 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1069  OmpA/MotB domain protein  33.59 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000483624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0181  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.235186 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02458  hypothetical protein  33.59 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0788684  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2889  putative outer membrane lipoprotein  33.59 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00115542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2764  putative outer membrane lipoprotein  33.59 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000137509  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1078  putative outer membrane lipoprotein  33.59 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0037573  hitchhiker  0.00684711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3844  putative outer membrane lipoprotein  34.13 
 
 		 160 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00547019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  30.89 
 
 		 669 aa  77  0.0000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1537  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0995  OmpA/MotB domain protein  33.94 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0151074  decreased coverage  0.0000793596 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  39.62 
 
 		 454 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  35.43 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4203  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.36 
 
 		 163 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381253  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  36.89 
 
 		 209 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  39.42 
 
 		 264 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  35.11 
 
 		 205 aa  75.9  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  33.6 
 
 		 229 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  42.2 
 
 		 200 aa  75.5  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  40.38 
 
 		 481 aa  75.5  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1671  OmpA/MotB domain-containing protein  31.54 
 
 		 229 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 369 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  40.2 
 
 		 225 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  39.42 
 
 		 239 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>