More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5001 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_5001  P-type DNA transfer ATPase VirB11  100 
 
 		 334 aa  680    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.547731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0248  Type IV secretory pathway AvhB11 protein  56.92 
 
 		 343 aa  368  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.776231 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4369  type II secretion system protein E  52.92 
 
 		 342 aa  340  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.957498 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5078  P-type DNA transfer ATPase VirB11  53.85 
 
 		 337 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382056 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4338  type II secretion system protein E  53.25 
 
 		 344 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553621  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0685  P-type DNA transfer ATPase VirB11  50.93 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1678  type IV secretory pathway, VirB11 component  43.64 
 
 		 361 aa  265  1e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.247964 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0863  P-type DNA transfer ATPase VirB11  42.31 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.349465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2445  P-type DNA transfer ATPase VirB11  40.98 
 
 		 347 aa  245  6.999999999999999e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.938664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1762  putative type IV secretion system protein VirB11  41.45 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6497  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.71 
 
 		 372 aa  235  7e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2649  putative type IV secretion system protein VirB11  40.58 
 
 		 372 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.788763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4170  type II secretion system protein E  38.27 
 
 		 343 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0059  type IV secretion system protein VirB11  42.04 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9811  type IV secretion protein AvhB11  39.44 
 
 		 340 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5822  P-type DNA transfer ATPase VirB11  42.47 
 
 		 382 aa  232  6e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0054  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.74 
 
 		 362 aa  231  1e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0170  P-type DNA transfer ATPase VirB11  41.43 
 
 		 375 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.178356 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4194  P-type DNA transfer ATPase VirB11  39.26 
 
 		 383 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0456  putative type IV secretion system protein VirB11  41.09 
 
 		 379 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3530  type IV secretion system protein VirB11  40.18 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4555  P-type DNA transfer ATPase VirB11  38.36 
 
 		 343 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.303267  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6397  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.5 
 
 		 342 aa  225  7e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8218  type IV secretion system protein VirB11  39.2 
 
 		 344 aa  222  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.662964  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6152  type IV secretion system protein VirB11  38.63 
 
 		 346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6333  P-type DNA transfer ATPase VirB11  43.54 
 
 		 357 aa  219  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a019  conjugal transfer protein VirB11  38.28 
 
 		 333 aa  219  7e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4845  type II secretion system protein E  40.3 
 
 		 352 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3321  ATP/GTP-binding motif-containing protein  40.3 
 
 		 352 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4437  type II secretion system protein E  40.8 
 
 		 349 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0007  type IV secretion system ATPase VirB11  37.96 
 
 		 330 aa  214  9.999999999999999e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0478715  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0740  type IV secretion system ATPase VirB11  40 
 
 		 331 aa  212  5.999999999999999e-54  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.252836  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0019  type IV secretion system ATPase VirB11  36.45 
 
 		 332 aa  211  1e-53  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0988827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1145  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.76 
 
 		 355 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0039  cmgB11  36.01 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0041  type IV secretion system ATPase VirB11  37.27 
 
 		 332 aa  197  3e-49  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6214  P-type DNA transfer ATPase VirB11  37.35 
 
 		 349 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.263277 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08204  type II secretion system protein E  37.73 
 
 		 338 aa  194  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.291523  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5020  type II secretion system protein E  37.58 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0172  P-type DNA transfer ATPase VirB11  35.02 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0899621  n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0016  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.43 
 
 		 339 aa  185  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0046  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.77 
 
 		 342 aa  181  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0161  hypothetical protein  33.02 
 
 		 334 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0179  hypothetical protein  33.02 
 
 		 334 aa  176  5e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0024  P-type DNA transfer ATPase VirB11  34.52 
 
 		 353 aa  170  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7526  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.44 
 
 		 345 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0812069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1479  Sigma 54 interacting domain protein  32.79 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0116  P-type DNA transfer ATPase VirB11  33.33 
 
 		 349 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.165684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7353  type II secretion system protein E  32.93 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0424132  normal  0.297904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  33.11 
 
 		 474 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  33.11 
 
 		 521 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  33.11 
 
 		 520 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  33.11 
 
 		 520 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  33.11 
 
 		 520 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  33.11 
 
 		 515 aa  143  5e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  33.11 
 
 		 523 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  33.11 
 
 		 523 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  32.11 
 
 		 472 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  32.11 
 
 		 472 aa  142  8e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  33.89 
 
 		 474 aa  139  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  32.06 
 
 		 444 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  30.97 
 
 		 455 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0670  type II secretion system protein E  31.14 
 
 		 466 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.811515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 467 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2497  type II secretion system protein E  34.38 
 
 		 321 aa  135  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  32.23 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0537  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  30.57 
 
 		 472 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  32.69 
 
 		 594 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  30.69 
 
 		 428 aa  132  7.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.07 
 
 		 483 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0032  type II secretion system protein E  32.01 
 
 		 404 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  30.89 
 
 		 478 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  30.84 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  29.43 
 
 		 482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  29.67 
 
 		 572 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  30.49 
 
 		 445 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0072  type II secretion system protein E  31.61 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.928138  normal  0.608061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  30.5 
 
 		 432 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  30.85 
 
 		 412 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  30.03 
 
 		 482 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  29.62 
 
 		 482 aa  128  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  29.97 
 
 		 478 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  30.82 
 
 		 479 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  28.03 
 
 		 500 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  31.06 
 
 		 438 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  30.69 
 
 		 463 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  32.29 
 
 		 563 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  29.3 
 
 		 487 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  29.07 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0595  P-type conjugative transfer ATPase TrbB  33.57 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  29.84 
 
 		 624 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  29.7 
 
 		 477 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  27.48 
 
 		 491 aa  127  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  30.62 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  28.85 
 
 		 468 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  31.1 
 
 		 477 aa  127  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  30 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  29.39 
 
 		 467 aa  126  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>