More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1941 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  100 
 
 		 1166 aa  2365    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  51.59 
 
 		 1149 aa  1231    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  34.09 
 
 		 1283 aa  638    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  34.13 
 
 		 1237 aa  637    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  33.7 
 
 		 1231 aa  632  1e-179  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  34 
 
 		 1220 aa  630  1e-179  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  35.66 
 
 		 1242 aa  628  1e-178  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  32.95 
 
 		 1284 aa  619  1e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  34.21 
 
 		 1124 aa  611  1e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  32.96 
 
 		 1227 aa  612  1e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  33.52 
 
 		 1232 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  34.43 
 
 		 1122 aa  591  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  33.33 
 
 		 1144 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  34.02 
 
 		 1122 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  33.47 
 
 		 1030 aa  546  1e-153  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  32.95 
 
 		 1104 aa  539  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  32.04 
 
 		 1143 aa  531  1e-149  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  32.7 
 
 		 1104 aa  526  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  31.48 
 
 		 696 aa  214  7e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1013  DNA topoisomerase I, putative  28.25 
 
 		 705 aa  208  5e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  30.87 
 
 		 696 aa  207  1e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  28.53 
 
 		 839 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  30.37 
 
 		 702 aa  204  9e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  31.3 
 
 		 702 aa  202  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  29.51 
 
 		 868 aa  202  3.9999999999999996e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  29.71 
 
 		 693 aa  201  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  29.33 
 
 		 859 aa  200  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  30 
 
 		 700 aa  199  3e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  28.79 
 
 		 858 aa  199  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  30.6 
 
 		 704 aa  198  5.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  30.43 
 
 		 700 aa  196  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  30.66 
 
 		 700 aa  196  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  30.22 
 
 		 697 aa  195  3e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  30.14 
 
 		 883 aa  195  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  30.1 
 
 		 700 aa  195  4e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  29.94 
 
 		 700 aa  194  1e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  29.76 
 
 		 711 aa  194  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.73 
 
 		 689 aa  192  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  27.98 
 
 		 696 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  28.09 
 
 		 711 aa  192  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1150  hypothetical protein  27.79 
 
 		 780 aa  192  4e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  30.05 
 
 		 695 aa  191  8e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  30.02 
 
 		 694 aa  190  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  29.13 
 
 		 669 aa  190  1e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1210  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 792 aa  189  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00167448  hitchhiker  0.000869825 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  27.41 
 
 		 695 aa  188  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  28.96 
 
 		 747 aa  188  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1133  DNA topoisomerase I  30.58 
 
 		 816 aa  188  7e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2030  DNA topoisomerase I  27.46 
 
 		 894 aa  187  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0825092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2162  DNA topoisomerase I  29.41 
 
 		 867 aa  187  8e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.010806  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  30.17 
 
 		 708 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  28.83 
 
 		 789 aa  187  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 845 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  27.72 
 
 		 780 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  28.86 
 
 		 910 aa  187  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  29.56 
 
 		 633 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  29.92 
 
 		 762 aa  186  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  28.23 
 
 		 691 aa  186  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  28.23 
 
 		 691 aa  186  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  27.9 
 
 		 706 aa  186  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  27.13 
 
 		 710 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  26.99 
 
 		 836 aa  186  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  28.64 
 
 		 693 aa  186  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1024  DNA topoisomerase I  29.39 
 
 		 696 aa  186  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.352033  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 872 aa  186  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  27.56 
 
 		 751 aa  186  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  28.93 
 
 		 703 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2250  DNA topoisomerase I  28.87 
 
 		 880 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  27.47 
 
 		 767 aa  185  4.0000000000000006e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  29.11 
 
 		 703 aa  185  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  27.51 
 
 		 697 aa  185  6e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  28.43 
 
 		 686 aa  184  6e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  28.79 
 
 		 879 aa  184  6e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2609  DNA topoisomerase I  28.94 
 
 		 880 aa  184  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0281339  decreased coverage  0.00102405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1855  DNA topoisomerase I  28.94 
 
 		 880 aa  184  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000497797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2489  DNA topoisomerase I  28.94 
 
 		 880 aa  184  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.297791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2496  DNA topoisomerase I  28.94 
 
 		 880 aa  184  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  29.44 
 
 		 691 aa  184  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  28.37 
 
 		 869 aa  184  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  28.37 
 
 		 869 aa  184  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  27.78 
 
 		 835 aa  184  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  28.37 
 
 		 869 aa  184  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  27.6 
 
 		 760 aa  183  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  29.89 
 
 		 694 aa  184  1e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2196  DNA topoisomerase I  27.77 
 
 		 865 aa  182  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.735168  unclonable  0.00000487546 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1971  DNA topoisomerase I  28.77 
 
 		 883 aa  183  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819086  normal  0.697086 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  28.02 
 
 		 825 aa  182  2.9999999999999997e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0291  DNA topoisomerase I  28.4 
 
 		 923 aa  182  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  29.58 
 
 		 633 aa  182  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  27.9 
 
 		 836 aa  182  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  27.81 
 
 		 872 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2193  DNA topoisomerase I  28.98 
 
 		 883 aa  182  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  28.62 
 
 		 841 aa  181  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  28.84 
 
 		 703 aa  181  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  28.69 
 
 		 694 aa  181  7e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  29.09 
 
 		 877 aa  180  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2705  DNA topoisomerase I  27.75 
 
 		 878 aa  180  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0030  DNA topoisomerase I  29.33 
 
 		 881 aa  180  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  27.24 
 
 		 758 aa  180  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  29.25 
 
 		 877 aa  181  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>