More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1363 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  79.36 
 
 		 1122 aa  1867    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  55.78 
 
 		 1144 aa  1242    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  36.67 
 
 		 1231 aa  726    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  35.74 
 
 		 1220 aa  645    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  35.62 
 
 		 1232 aa  687    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  100 
 
 		 1124 aa  2270    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  36.39 
 
 		 1143 aa  735    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  35.65 
 
 		 1284 aa  709    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  38.46 
 
 		 1283 aa  764    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  36.91 
 
 		 1237 aa  720    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  35.62 
 
 		 1227 aa  674    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  34.77 
 
 		 1242 aa  631  1e-179  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  35.59 
 
 		 1030 aa  619  1e-175  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  36.55 
 
 		 1104 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  36.61 
 
 		 1104 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  34.21 
 
 		 1166 aa  611  1e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  35.32 
 
 		 1122 aa  605  1.0000000000000001e-171  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  31.71 
 
 		 1149 aa  506  9.999999999999999e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  34.39 
 
 		 693 aa  264  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  34.84 
 
 		 695 aa  257  8e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  34.74 
 
 		 633 aa  255  4.0000000000000004e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  34.24 
 
 		 693 aa  254  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  34.07 
 
 		 697 aa  252  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  34.56 
 
 		 633 aa  249  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  34.32 
 
 		 696 aa  249  3e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  32.27 
 
 		 697 aa  247  8e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  32.6 
 
 		 702 aa  245  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  33.05 
 
 		 710 aa  244  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  32.01 
 
 		 789 aa  244  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  31.85 
 
 		 836 aa  244  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  34.63 
 
 		 700 aa  243  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  32.65 
 
 		 686 aa  243  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  32.61 
 
 		 696 aa  243  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  32.43 
 
 		 711 aa  241  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  34.29 
 
 		 700 aa  241  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  30.7 
 
 		 758 aa  241  8e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  32.53 
 
 		 748 aa  238  4e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  34.54 
 
 		 702 aa  236  1.0000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0227  DNA topoisomerase I  31.52 
 
 		 845 aa  237  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0428468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  30.81 
 
 		 825 aa  237  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  32.03 
 
 		 696 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  32.94 
 
 		 691 aa  236  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  29.85 
 
 		 760 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  30.43 
 
 		 858 aa  234  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  31.89 
 
 		 694 aa  234  6e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2189  DNA topoisomerase I  31.73 
 
 		 857 aa  234  8.000000000000001e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0016  DNA topoisomerase I  31.53 
 
 		 851 aa  233  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.954343  normal  0.0614036 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0015  DNA topoisomerase I  31.53 
 
 		 851 aa  233  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2326  DNA topoisomerase I  30.88 
 
 		 799 aa  233  1e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.240337  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  31.14 
 
 		 872 aa  233  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  30.56 
 
 		 839 aa  233  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1150  hypothetical protein  30.25 
 
 		 780 aa  233  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  32.88 
 
 		 835 aa  233  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2343  DNA topoisomerase I  33.4 
 
 		 841 aa  233  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  30.72 
 
 		 743 aa  232  4e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  32.39 
 
 		 708 aa  231  7e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  30.67 
 
 		 823 aa  231  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  30.13 
 
 		 768 aa  231  8e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  30.37 
 
 		 836 aa  231  8e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  29.93 
 
 		 834 aa  231  8e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  31.69 
 
 		 711 aa  230  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2705  DNA topoisomerase I  31.28 
 
 		 878 aa  230  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  31.03 
 
 		 802 aa  230  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  30.29 
 
 		 747 aa  230  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  31.79 
 
 		 684 aa  230  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  32.83 
 
 		 820 aa  229  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  32.47 
 
 		 692 aa  229  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  32.12 
 
 		 669 aa  229  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  33.1 
 
 		 704 aa  229  3e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  32.47 
 
 		 692 aa  228  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  29.76 
 
 		 751 aa  228  4e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  32.65 
 
 		 692 aa  228  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  32.3 
 
 		 692 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  32.3 
 
 		 692 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  30.05 
 
 		 877 aa  228  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  32.3 
 
 		 692 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  32.3 
 
 		 692 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1024  DNA topoisomerase I  35.04 
 
 		 696 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.352033  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 877 aa  228  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  30.02 
 
 		 703 aa  228  6e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2250  DNA topoisomerase I  30.77 
 
 		 880 aa  228  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2478  DNA topoisomerase I  30.89 
 
 		 895 aa  228  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  30.73 
 
 		 859 aa  227  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0754  DNA topoisomerase I  31.04 
 
 		 788 aa  227  8e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  32.13 
 
 		 692 aa  227  8e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  30.68 
 
 		 798 aa  227  8e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  31.12 
 
 		 691 aa  226  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  32.5 
 
 		 780 aa  226  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  31.12 
 
 		 691 aa  226  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  32.13 
 
 		 692 aa  226  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  31.58 
 
 		 706 aa  226  2e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  32.14 
 
 		 692 aa  226  2e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0358  DNA topoisomerase I  30.68 
 
 		 683 aa  226  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000301729  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  31.97 
 
 		 694 aa  226  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2489  DNA topoisomerase I  30.26 
 
 		 880 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.297791  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  31.95 
 
 		 783 aa  226  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  30.13 
 
 		 910 aa  226  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2609  DNA topoisomerase I  30.26 
 
 		 880 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0281339  decreased coverage  0.00102405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1855  DNA topoisomerase I  30.26 
 
 		 880 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000497797 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2496  DNA topoisomerase I  30.26 
 
 		 880 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>