More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1131 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  35.68 
 
 		 1144 aa  643    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  36.87 
 
 		 1242 aa  655    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  33.74 
 
 		 1227 aa  641    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  36.53 
 
 		 1220 aa  676    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  35.26 
 
 		 1284 aa  653    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  53.43 
 
 		 1104 aa  1112    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  53.25 
 
 		 1104 aa  1111    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  100 
 
 		 1122 aa  2295    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  37.04 
 
 		 1122 aa  638    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  37.87 
 
 		 1283 aa  729    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  35.32 
 
 		 1237 aa  647    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  33.47 
 
 		 1231 aa  633  1e-180  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  35.88 
 
 		 1143 aa  632  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  33.23 
 
 		 1232 aa  624  1e-177  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  35.32 
 
 		 1124 aa  623  1e-177  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  38.07 
 
 		 1030 aa  624  1e-177  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  34.02 
 
 		 1166 aa  588  1e-166  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  32.69 
 
 		 1149 aa  546  1e-153  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  31.15 
 
 		 696 aa  229  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  30.48 
 
 		 760 aa  227  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  32.3 
 
 		 693 aa  226  2e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  30.41 
 
 		 669 aa  221  5e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  30.05 
 
 		 686 aa  219  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  31.15 
 
 		 693 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  31.34 
 
 		 746 aa  217  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  29.49 
 
 		 869 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  29.49 
 
 		 869 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  30.74 
 
 		 747 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  29.49 
 
 		 869 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  31.76 
 
 		 710 aa  216  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.49 
 
 		 869 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  31.28 
 
 		 894 aa  214  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  32.14 
 
 		 697 aa  215  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  30.74 
 
 		 708 aa  215  4.9999999999999996e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  29.63 
 
 		 696 aa  214  7e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  30.31 
 
 		 700 aa  213  2e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  30.31 
 
 		 700 aa  213  2e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  31.67 
 
 		 697 aa  213  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  30.64 
 
 		 695 aa  213  2e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  30.28 
 
 		 695 aa  213  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  30.48 
 
 		 711 aa  213  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  30.16 
 
 		 836 aa  213  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  30.98 
 
 		 696 aa  212  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  30.3 
 
 		 868 aa  212  4e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  30.31 
 
 		 700 aa  211  5e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  29.11 
 
 		 758 aa  210  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  30.53 
 
 		 702 aa  210  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  30 
 
 		 798 aa  209  2e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  29.8 
 
 		 868 aa  209  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  31.06 
 
 		 691 aa  209  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  30.51 
 
 		 706 aa  209  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1783  DNA topoisomerase I  29.08 
 
 		 903 aa  209  3e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  29.8 
 
 		 868 aa  209  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  30.27 
 
 		 748 aa  209  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  30.88 
 
 		 859 aa  208  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  31.8 
 
 		 700 aa  208  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  31.58 
 
 		 700 aa  208  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  31.18 
 
 		 694 aa  207  7e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  30.68 
 
 		 751 aa  207  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  29.08 
 
 		 869 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  29.25 
 
 		 870 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 876 aa  206  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  29.32 
 
 		 835 aa  206  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  29.8 
 
 		 689 aa  205  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  30.97 
 
 		 692 aa  204  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  30.71 
 
 		 690 aa  204  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  28.87 
 
 		 868 aa  204  7e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  30.57 
 
 		 780 aa  204  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  30.48 
 
 		 708 aa  204  9e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  30.48 
 
 		 692 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  30.48 
 
 		 692 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  30.48 
 
 		 692 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  30.48 
 
 		 692 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1535  DNA topoisomerase I  29.51 
 
 		 896 aa  204  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.351865  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  30.64 
 
 		 692 aa  204  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  30.97 
 
 		 692 aa  204  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  30.28 
 
 		 706 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  30.31 
 
 		 692 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0393  DNA topoisomerase I  29.41 
 
 		 884 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925228  unclonable  0.0000000013775 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  29.3 
 
 		 868 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  29.62 
 
 		 825 aa  202  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  28.64 
 
 		 706 aa  202  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  30.45 
 
 		 684 aa  202  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  30.48 
 
 		 692 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  28.87 
 
 		 872 aa  202  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  30.46 
 
 		 692 aa  201  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  31.89 
 
 		 633 aa  201  5e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  30.1 
 
 		 689 aa  201  6e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  29.82 
 
 		 743 aa  201  6e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  31.26 
 
 		 694 aa  201  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  28.43 
 
 		 839 aa  201  7e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  30.4 
 
 		 704 aa  201  7e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  29.45 
 
 		 691 aa  201  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  29.45 
 
 		 691 aa  201  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  30.83 
 
 		 711 aa  201  9e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  30.39 
 
 		 703 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  31.06 
 
 		 633 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1901  DNA topoisomerase I  28.78 
 
 		 896 aa  201  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164413  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  30.64 
 
 		 692 aa  200  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2478  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 		 895 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>