More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0575 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  41.54 
 
 		 1231 aa  866    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  37.11 
 
 		 1242 aa  794    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  34.4 
 
 		 1166 aa  667    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  39.87 
 
 		 1144 aa  854    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  37.47 
 
 		 1220 aa  793    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  37.87 
 
 		 1122 aa  751    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  35.58 
 
 		 1030 aa  700    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  34.86 
 
 		 1149 aa  648    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  37.14 
 
 		 1122 aa  772    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  35.45 
 
 		 1104 aa  651    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  39.46 
 
 		 1284 aa  866    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  36.99 
 
 		 1143 aa  695    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  40.98 
 
 		 1227 aa  834    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  100 
 
 		 1283 aa  2600    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  38.66 
 
 		 1124 aa  805    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  40.54 
 
 		 1237 aa  849    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  35.45 
 
 		 1104 aa  644    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  40.53 
 
 		 1232 aa  824    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  31.05 
 
 		 869 aa  243  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  31.05 
 
 		 869 aa  243  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  31.05 
 
 		 869 aa  243  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  30.75 
 
 		 869 aa  238  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  30.51 
 
 		 695 aa  238  8e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  30.69 
 
 		 691 aa  237  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  31.64 
 
 		 886 aa  236  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  29.94 
 
 		 686 aa  235  3e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  28.66 
 
 		 760 aa  234  6e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  31.26 
 
 		 869 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  31.1 
 
 		 693 aa  234  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  32.5 
 
 		 715 aa  233  2e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  31.47 
 
 		 870 aa  233  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  30.65 
 
 		 702 aa  233  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  31.12 
 
 		 693 aa  231  5e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  30.31 
 
 		 692 aa  231  9e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  30.16 
 
 		 692 aa  230  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  31.46 
 
 		 868 aa  230  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  30.01 
 
 		 692 aa  229  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  30.01 
 
 		 692 aa  229  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  30.01 
 
 		 692 aa  229  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  30.01 
 
 		 692 aa  229  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  32.36 
 
 		 751 aa  229  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  30.01 
 
 		 692 aa  228  4e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  31.49 
 
 		 711 aa  229  4e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  30.01 
 
 		 692 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  34.45 
 
 		 696 aa  228  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  29.62 
 
 		 700 aa  228  6e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  30.25 
 
 		 876 aa  227  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  31.45 
 
 		 696 aa  227  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  30.28 
 
 		 877 aa  227  1e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  31.67 
 
 		 859 aa  227  1e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  33.64 
 
 		 708 aa  227  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  29.74 
 
 		 689 aa  227  1e-57  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  30.5 
 
 		 836 aa  226  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 868 aa  226  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  30.51 
 
 		 692 aa  225  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  29.31 
 
 		 700 aa  225  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  29.95 
 
 		 868 aa  225  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  30.57 
 
 		 692 aa  225  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  29.87 
 
 		 692 aa  225  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  30.91 
 
 		 879 aa  225  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 743 aa  224  6e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  29.86 
 
 		 879 aa  224  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  33.03 
 
 		 706 aa  224  9e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  29.8 
 
 		 868 aa  224  9e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  30.51 
 
 		 789 aa  223  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  30.05 
 
 		 894 aa  223  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  30.15 
 
 		 710 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  29.01 
 
 		 700 aa  222  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  29.62 
 
 		 694 aa  222  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  30.55 
 
 		 872 aa  222  3.9999999999999997e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  29.53 
 
 		 767 aa  222  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  32.59 
 
 		 693 aa  221  7e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  30.25 
 
 		 836 aa  221  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  30.29 
 
 		 697 aa  221  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  30.52 
 
 		 691 aa  221  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  28.44 
 
 		 694 aa  221  8.999999999999998e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  28.99 
 
 		 694 aa  221  1e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  29.9 
 
 		 780 aa  221  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  31.57 
 
 		 684 aa  219  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1322  DNA topoisomerase I  29.41 
 
 		 872 aa  220  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425671  normal  0.143441 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  30.19 
 
 		 691 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1971  DNA topoisomerase I  29.66 
 
 		 883 aa  219  2.9999999999999998e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819086  normal  0.697086 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  31.27 
 
 		 633 aa  218  4e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  32.73 
 
 		 702 aa  219  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  31.24 
 
 		 839 aa  218  5e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  28.96 
 
 		 711 aa  218  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  31.23 
 
 		 841 aa  218  7e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  31.39 
 
 		 758 aa  217  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  31.78 
 
 		 697 aa  217  9.999999999999999e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2001  DNA topoisomerase I  30.34 
 
 		 964 aa  217  9.999999999999999e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  28.92 
 
 		 691 aa  216  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  30.8 
 
 		 633 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1273  DNA topoisomerase  30.56 
 
 		 948 aa  216  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.188892 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 		 747 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  28.92 
 
 		 691 aa  216  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2496  DNA topoisomerase I  29.86 
 
 		 880 aa  216  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2224  DNA topoisomerase I  32.75 
 
 		 898 aa  216  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.648811  hitchhiker  0.00821912 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2609  DNA topoisomerase I  29.86 
 
 		 880 aa  216  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0281339  decreased coverage  0.00102405 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2489  DNA topoisomerase I  29.86 
 
 		 880 aa  216  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.297791  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1855  DNA topoisomerase I  29.86 
 
 		 880 aa  216  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000497797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>