More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1418 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  36.47 
 
 		 1231 aa  649    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  37.36 
 
 		 1232 aa  652    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  36.78 
 
 		 1144 aa  768    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  37.43 
 
 		 1122 aa  745    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  36.39 
 
 		 1124 aa  744    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  100 
 
 		 1143 aa  2306    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  35.16 
 
 		 1284 aa  645    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  36.99 
 
 		 1283 aa  673    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  37.11 
 
 		 1237 aa  689    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  36.82 
 
 		 1227 aa  654    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  35.13 
 
 		 1242 aa  624  1e-177  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  35.88 
 
 		 1122 aa  625  1e-177  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  35.16 
 
 		 1220 aa  604  1.0000000000000001e-171  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  35.78 
 
 		 1104 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  36.03 
 
 		 1104 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  32.04 
 
 		 1166 aa  533  1e-150  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  32.05 
 
 		 1030 aa  519  1.0000000000000001e-145  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  31.06 
 
 		 1149 aa  498  1e-139  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  32.79 
 
 		 695 aa  261  6e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  34.35 
 
 		 711 aa  257  1.0000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  32.57 
 
 		 697 aa  254  7e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  31.85 
 
 		 710 aa  252  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  31.53 
 
 		 700 aa  249  2e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  31.03 
 
 		 700 aa  244  6e-63  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  33.01 
 
 		 696 aa  243  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0393  DNA topoisomerase I  32.67 
 
 		 884 aa  243  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000925228  unclonable  0.0000000013775 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  31.54 
 
 		 693 aa  243  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  33.44 
 
 		 686 aa  242  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  31.29 
 
 		 696 aa  242  2.9999999999999997e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  31.85 
 
 		 910 aa  241  6.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  32.86 
 
 		 858 aa  240  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  31.22 
 
 		 886 aa  240  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  32.54 
 
 		 633 aa  240  1e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  30.87 
 
 		 700 aa  240  1e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  31.27 
 
 		 694 aa  239  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  32.99 
 
 		 633 aa  239  3e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  31.85 
 
 		 693 aa  238  5.0000000000000005e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  31.71 
 
 		 894 aa  237  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  31.28 
 
 		 691 aa  235  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  30.32 
 
 		 767 aa  234  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1783  DNA topoisomerase I  31.2 
 
 		 903 aa  234  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  30.32 
 
 		 689 aa  233  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  31.69 
 
 		 691 aa  232  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  31.69 
 
 		 691 aa  232  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  30.46 
 
 		 700 aa  232  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  30.68 
 
 		 700 aa  232  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  31.65 
 
 		 747 aa  231  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  31.78 
 
 		 762 aa  231  6e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  30.91 
 
 		 868 aa  231  6e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1660  DNA topoisomerase I  30.94 
 
 		 892 aa  231  7e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000915276  normal  0.794129 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  30.38 
 
 		 702 aa  231  9e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  33.28 
 
 		 697 aa  230  9e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  30.58 
 
 		 876 aa  230  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  30.92 
 
 		 868 aa  230  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  30.98 
 
 		 868 aa  230  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  30.76 
 
 		 721 aa  229  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  30.98 
 
 		 868 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1273  DNA topoisomerase  31.09 
 
 		 948 aa  229  2e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.188892 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1024  DNA topoisomerase I  31.79 
 
 		 696 aa  229  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.352033  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  31.21 
 
 		 711 aa  229  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1901  DNA topoisomerase I  30.79 
 
 		 896 aa  229  3e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164413  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  31.34 
 
 		 696 aa  228  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  31.81 
 
 		 689 aa  228  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  30.91 
 
 		 702 aa  228  4e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  32.59 
 
 		 872 aa  228  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  31.53 
 
 		 839 aa  228  5.0000000000000005e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  30.71 
 
 		 690 aa  228  6e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  31.32 
 
 		 751 aa  228  7e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  30.58 
 
 		 869 aa  227  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  30.91 
 
 		 870 aa  227  8e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  30.43 
 
 		 693 aa  227  8e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  30.95 
 
 		 694 aa  227  8e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  30.51 
 
 		 869 aa  227  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  30.51 
 
 		 869 aa  227  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  31.76 
 
 		 746 aa  226  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  30.02 
 
 		 695 aa  227  1e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1164  DNA topoisomerase I  30.26 
 
 		 879 aa  226  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144967  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  31.75 
 
 		 780 aa  226  1e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  31.36 
 
 		 879 aa  226  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  30.51 
 
 		 869 aa  227  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  30.46 
 
 		 869 aa  225  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  31.7 
 
 		 853 aa  226  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1846  DNA topoisomerase I  30.72 
 
 		 865 aa  226  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.996923  normal  0.0120486 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1614  DNA topoisomerase I  30.72 
 
 		 865 aa  226  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.848842  hitchhiker  0.000000000000466003 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  30.77 
 
 		 760 aa  225  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1768  DNA topoisomerase I  30.79 
 
 		 968 aa  225  4e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  32.24 
 
 		 694 aa  225  4e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  30.82 
 
 		 883 aa  225  4.9999999999999996e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04911  DNA topoisomerase I  30.24 
 
 		 968 aa  224  7e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.624674 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  30.63 
 
 		 874 aa  224  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  30.2 
 
 		 684 aa  224  8e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1841  DNA topoisomerase I  30.56 
 
 		 865 aa  223  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.253396  hitchhiker  0.0000000000877757 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  32.17 
 
 		 789 aa  223  9.999999999999999e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  30.16 
 
 		 802 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1904  DNA topoisomerase I  30.56 
 
 		 865 aa  223  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.42777  hitchhiker  2.78185e-16 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06301  DNA topoisomerase I  31.64 
 
 		 916 aa  223  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.059761 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2193  DNA topoisomerase I  30.87 
 
 		 883 aa  223  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1432  DNA topoisomerase I  30.56 
 
 		 865 aa  223  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0283977  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  30.23 
 
 		 704 aa  223  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1857  DNA topoisomerase I  30.71 
 
 		 865 aa  223  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.2475e-18 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>