More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0811 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  37.03 
 
 		 1242 aa  730    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  35.95 
 
 		 1124 aa  724    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  44.79 
 
 		 1227 aa  1057    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  36.56 
 
 		 1220 aa  713    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  44.99 
 
 		 1231 aa  1078    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  35.31 
 
 		 1143 aa  661    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  36.44 
 
 		 1122 aa  721    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  36.95 
 
 		 1144 aa  737    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  44.25 
 
 		 1232 aa  1040    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  35.13 
 
 		 1122 aa  641    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  100 
 
 		 1284 aa  2609    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  39.54 
 
 		 1283 aa  834    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  44.42 
 
 		 1237 aa  1063    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  32.95 
 
 		 1166 aa  630  1e-179  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  33.91 
 
 		 1030 aa  620  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  34.81 
 
 		 1104 aa  619  1e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  34.7 
 
 		 1104 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  34.67 
 
 		 1149 aa  610  1e-173  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  29.19 
 
 		 697 aa  226  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  29.56 
 
 		 691 aa  218  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  29.56 
 
 		 691 aa  218  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  28.46 
 
 		 710 aa  216  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  29.6 
 
 		 711 aa  215  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  28.72 
 
 		 700 aa  215  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  27.68 
 
 		 695 aa  215  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 696 aa  214  9e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  28.72 
 
 		 700 aa  214  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  29.15 
 
 		 693 aa  213  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  30.42 
 
 		 691 aa  212  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  27.81 
 
 		 836 aa  212  5e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  29.02 
 
 		 702 aa  211  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  29.59 
 
 		 693 aa  209  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00715  DNA topoisomerase I  27.58 
 
 		 841 aa  209  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.446013  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  29.06 
 
 		 696 aa  208  5e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 		 872 aa  208  7e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  27.39 
 
 		 877 aa  207  1e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  27.39 
 
 		 877 aa  206  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  29.17 
 
 		 689 aa  206  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  28.78 
 
 		 697 aa  205  6e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 686 aa  204  7e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  27.53 
 
 		 798 aa  204  9e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0497  DNA topoisomerase I  31.23 
 
 		 919 aa  204  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324618  normal  0.923376 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  27.65 
 
 		 702 aa  204  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0754  DNA topoisomerase I  28.29 
 
 		 788 aa  203  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  29.82 
 
 		 696 aa  202  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  28.72 
 
 		 708 aa  201  5e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  29.02 
 
 		 691 aa  201  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  28.05 
 
 		 703 aa  201  7e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  29.82 
 
 		 700 aa  201  7.999999999999999e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 		 703 aa  201  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  29.46 
 
 		 692 aa  200  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  26.94 
 
 		 825 aa  200  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  29.77 
 
 		 700 aa  200  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  29.54 
 
 		 700 aa  200  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  28.57 
 
 		 711 aa  200  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  29.19 
 
 		 874 aa  199  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  28.02 
 
 		 768 aa  199  4.0000000000000005e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  26.75 
 
 		 910 aa  199  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  26.87 
 
 		 804 aa  199  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 		 691 aa  199  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  30.72 
 
 		 692 aa  198  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  27.34 
 
 		 798 aa  198  5.000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  27.27 
 
 		 695 aa  198  7e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2200  DNA topoisomerase I  27.55 
 
 		 895 aa  197  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.170187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  30.38 
 
 		 692 aa  197  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  30.07 
 
 		 835 aa  197  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  28.86 
 
 		 858 aa  197  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  30.05 
 
 		 692 aa  196  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1416  DNA topoisomerase I  27.38 
 
 		 883 aa  196  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  28.59 
 
 		 859 aa  196  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  30.22 
 
 		 692 aa  196  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  30.05 
 
 		 692 aa  196  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  30.05 
 
 		 692 aa  196  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  27.88 
 
 		 703 aa  196  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  30.05 
 
 		 692 aa  196  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  30.05 
 
 		 692 aa  196  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  27.37 
 
 		 693 aa  195  4e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  28.06 
 
 		 780 aa  194  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1273  DNA topoisomerase  30.16 
 
 		 948 aa  194  9e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.188892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  27.23 
 
 		 836 aa  193  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  25.93 
 
 		 798 aa  194  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  29.65 
 
 		 692 aa  194  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  27.69 
 
 		 694 aa  194  1e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  27.87 
 
 		 704 aa  193  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  27.57 
 
 		 694 aa  193  2e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  28.84 
 
 		 706 aa  192  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  27.23 
 
 		 743 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  27.84 
 
 		 751 aa  192  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  28.04 
 
 		 702 aa  192  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1013  DNA topoisomerase I, putative  32.11 
 
 		 705 aa  192  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  27.58 
 
 		 765 aa  192  4e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3931  DNA topoisomerase I  29.65 
 
 		 692 aa  192  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000332787  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1756  DNA topoisomerase I  28.28 
 
 		 904 aa  191  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0109  DNA topoisomerase I  26.05 
 
 		 799 aa  192  5e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  27.93 
 
 		 886 aa  191  5.999999999999999e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0030  DNA topoisomerase I  26.71 
 
 		 881 aa  191  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  26.78 
 
 		 839 aa  191  9e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  26.7 
 
 		 802 aa  190  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  28.84 
 
 		 714 aa  190  1e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  30.58 
 
 		 633 aa  191  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>