More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0014 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  35.41 
 
 		 1242 aa  646    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  36.07 
 
 		 1227 aa  684    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  36.81 
 
 		 1231 aa  730    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  56.59 
 
 		 1144 aa  1253    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  79.36 
 
 		 1124 aa  1885    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  36.22 
 
 		 1284 aa  719    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  37.67 
 
 		 1143 aa  749    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  36.57 
 
 		 1232 aa  709    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  100 
 
 		 1122 aa  2257    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  37.06 
 
 		 1283 aa  743    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  36.83 
 
 		 1220 aa  652    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  37.08 
 
 		 1237 aa  728    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  36.66 
 
 		 1122 aa  632  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  36.25 
 
 		 1030 aa  621  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  37.36 
 
 		 1104 aa  620  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  37.27 
 
 		 1104 aa  617  1e-175  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  34.27 
 
 		 1166 aa  594  1e-168  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  32.72 
 
 		 1149 aa  511  1e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  35.84 
 
 		 695 aa  270  1e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  36.38 
 
 		 693 aa  270  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  36.2 
 
 		 696 aa  268  5.999999999999999e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  34.19 
 
 		 686 aa  256  2.0000000000000002e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  33.84 
 
 		 693 aa  255  3e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  33.05 
 
 		 702 aa  255  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0666  DNA topoisomerase I  34.73 
 
 		 633 aa  254  8.000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000220674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  34.01 
 
 		 697 aa  252  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1430  DNA topoisomerase I  32.13 
 
 		 789 aa  250  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000308935  decreased coverage  0.00155997 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  32.52 
 
 		 836 aa  249  2e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  32.77 
 
 		 711 aa  248  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  32.7 
 
 		 684 aa  249  3e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  32.33 
 
 		 697 aa  248  4.9999999999999997e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0690  DNA topoisomerase I  34.75 
 
 		 633 aa  246  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000142344  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  33.74 
 
 		 702 aa  247  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  33.74 
 
 		 691 aa  246  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  33.33 
 
 		 696 aa  245  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  33.05 
 
 		 710 aa  244  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  33.92 
 
 		 689 aa  244  9e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  32.14 
 
 		 894 aa  242  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  33.73 
 
 		 700 aa  241  4e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  33.11 
 
 		 696 aa  242  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  32.02 
 
 		 711 aa  241  5e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  33.39 
 
 		 700 aa  241  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0358  DNA topoisomerase I  31.79 
 
 		 683 aa  240  1e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000301729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  31.75 
 
 		 868 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  31.02 
 
 		 748 aa  239  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  31.75 
 
 		 868 aa  239  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  31.19 
 
 		 760 aa  238  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2842  DNA topoisomerase I  31.34 
 
 		 798 aa  237  1.0000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  31.83 
 
 		 868 aa  236  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  33.22 
 
 		 690 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  30.61 
 
 		 751 aa  236  2.0000000000000002e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  31.37 
 
 		 869 aa  235  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  31.31 
 
 		 694 aa  235  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  31.37 
 
 		 869 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  31.37 
 
 		 869 aa  235  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  31.61 
 
 		 879 aa  235  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2478  DNA topoisomerase I  30.86 
 
 		 895 aa  234  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  30.29 
 
 		 758 aa  234  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  30.29 
 
 		 747 aa  234  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  30.24 
 
 		 743 aa  234  7.000000000000001e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2056  DNA topoisomerase I  30.91 
 
 		 706 aa  234  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2189  DNA topoisomerase I  29.62 
 
 		 857 aa  234  9e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.824425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  31.54 
 
 		 869 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  31.01 
 
 		 858 aa  233  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  32.06 
 
 		 694 aa  232  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2073  DNA topoisomerase I  31.86 
 
 		 802 aa  233  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  31.84 
 
 		 839 aa  233  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  31.15 
 
 		 798 aa  232  3e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0659  DNA topoisomerase I  31.38 
 
 		 851 aa  232  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.579537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0196  DNA topoisomerase  33.2 
 
 		 835 aa  231  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0750  DNA topoisomerase I  32.88 
 
 		 820 aa  231  4e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  30.2 
 
 		 825 aa  231  5e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3340  DNA topoisomerase  32.4 
 
 		 853 aa  231  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2463  DNA topoisomerase I  30.91 
 
 		 804 aa  231  5e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2343  DNA topoisomerase I  34.1 
 
 		 841 aa  231  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.767533 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  30.78 
 
 		 767 aa  231  7e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_002936  DET0717  DNA topoisomerase I  30.57 
 
 		 703 aa  230  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0604415  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0652  DNA topoisomerase I  30.41 
 
 		 703 aa  229  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.957627  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  32.93 
 
 		 704 aa  230  1e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  31.28 
 
 		 708 aa  229  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  32.44 
 
 		 780 aa  229  2e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  32.37 
 
 		 859 aa  229  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  30.69 
 
 		 768 aa  229  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  30.34 
 
 		 870 aa  229  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1273  DNA topoisomerase  32.78 
 
 		 948 aa  229  3e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.188892 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_624  topoisomerase IA  30.64 
 
 		 703 aa  228  4e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2277  DNA topoisomerase I  32.6 
 
 		 854 aa  228  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0137658 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2705  DNA topoisomerase I  30.37 
 
 		 878 aa  228  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  30.23 
 
 		 886 aa  228  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0754  DNA topoisomerase I  32.22 
 
 		 788 aa  228  6e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  31.36 
 
 		 695 aa  228  7e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2433  DNA topoisomerase I  31.07 
 
 		 798 aa  227  8e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.336729  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1150  hypothetical protein  29.92 
 
 		 780 aa  227  8e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  31 
 
 		 876 aa  227  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  29.39 
 
 		 877 aa  227  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  31.9 
 
 		 706 aa  227  9e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  31.32 
 
 		 715 aa  227  9e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3010  DNA topoisomerase I  31.45 
 
 		 783 aa  227  9e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.846821  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  31.08 
 
 		 691 aa  227  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  29.39 
 
 		 877 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>