More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0752 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  34.86 
 
 		 1227 aa  662    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  34.94 
 
 		 1242 aa  644    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  35.29 
 
 		 1284 aa  676    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  36.75 
 
 		 1124 aa  672    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  38.68 
 
 		 1030 aa  669    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  37.1 
 
 		 1122 aa  673    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  100 
 
 		 1104 aa  2237    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  97.1 
 
 		 1104 aa  2026    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  35.09 
 
 		 1232 aa  651    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  34.99 
 
 		 1220 aa  640    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  35.65 
 
 		 1283 aa  663    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  35.86 
 
 		 1144 aa  657    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  35.88 
 
 		 1237 aa  705    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  53.51 
 
 		 1122 aa  1179    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  35.27 
 
 		 1231 aa  672    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  36.38 
 
 		 1143 aa  627  1e-178  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  33.19 
 
 		 1166 aa  590  1e-167  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  33.47 
 
 		 1149 aa  558  1e-157  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  32.31 
 
 		 693 aa  232  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  31.39 
 
 		 693 aa  225  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  31.17 
 
 		 746 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1346  DNA topoisomerase I  31 
 
 		 708 aa  221  5e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000122971  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  32.18 
 
 		 702 aa  219  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  30.98 
 
 		 691 aa  219  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2069  DNA topoisomerase I  31.14 
 
 		 758 aa  217  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  29.9 
 
 		 696 aa  216  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  31.29 
 
 		 711 aa  216  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  30.03 
 
 		 762 aa  216  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  30.23 
 
 		 695 aa  215  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  30 
 
 		 696 aa  213  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  30.39 
 
 		 751 aa  213  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1026  DNA topoisomerase I  30.02 
 
 		 697 aa  209  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00786254  unclonable  0.0000000108626 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  30.24 
 
 		 684 aa  209  2e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  29.65 
 
 		 711 aa  209  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  29.89 
 
 		 694 aa  209  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  29.13 
 
 		 710 aa  208  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  29.36 
 
 		 694 aa  207  9e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  30.93 
 
 		 686 aa  206  2e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  28.09 
 
 		 700 aa  206  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0528  DNA topoisomerase I  30.57 
 
 		 776 aa  206  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000697651  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  29.97 
 
 		 836 aa  206  2e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  28.41 
 
 		 700 aa  206  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  30.13 
 
 		 747 aa  206  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0011  DNA topoisomerase I  29.71 
 
 		 760 aa  205  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  29.15 
 
 		 697 aa  204  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0027  DNA topoisomerase I  30 
 
 		 874 aa  204  7e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  30.51 
 
 		 700 aa  204  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3660  DNA topoisomerase I  29.16 
 
 		 783 aa  203  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.739108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4636  DNA topoisomerase I  29.52 
 
 		 894 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  29.14 
 
 		 669 aa  202  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1768  DNA topoisomerase I  28.89 
 
 		 968 aa  202  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1210  DNA topoisomerase I  29.57 
 
 		 792 aa  202  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00167448  hitchhiker  0.000869825 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  27.93 
 
 		 700 aa  202  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0597  DNA topoisomerase I  30.11 
 
 		 899 aa  201  5e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.577445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  28.9 
 
 		 694 aa  201  5e-50  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04911  DNA topoisomerase I  28.73 
 
 		 968 aa  201  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.624674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  30.11 
 
 		 858 aa  201  6e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  30.56 
 
 		 700 aa  201  9e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  28.91 
 
 		 877 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  30.97 
 
 		 696 aa  200  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  28.91 
 
 		 877 aa  200  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1013  DNA topoisomerase I, putative  29.3 
 
 		 705 aa  200  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0304  DNA topoisomerase I  30.33 
 
 		 748 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000372801  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.62 
 
 		 689 aa  199  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2090  DNA topoisomerase I  29.63 
 
 		 834 aa  199  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475207  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2212  DNA topoisomerase I  29.25 
 
 		 798 aa  199  3e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  28.37 
 
 		 695 aa  199  3e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1955  DNA topoisomerase I  29.43 
 
 		 784 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.3591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04981  DNA topoisomerase I  29.15 
 
 		 870 aa  198  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.225706  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1765  DNA topoisomerase I  28.99 
 
 		 899 aa  198  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.125266  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2722  DNA topoisomerase I  28.04 
 
 		 690 aa  197  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000409136  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3591  DNA topoisomerase I  28.39 
 
 		 824 aa  197  7e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.405231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2100  DNA topoisomerase I  29.68 
 
 		 765 aa  197  7e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.000378679  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2296  DNA topoisomerase I  28.96 
 
 		 704 aa  197  8.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0086  DNA topoisomerase I  29.68 
 
 		 765 aa  197  9e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.0000000043689  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  29.88 
 
 		 797 aa  197  9e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  29.18 
 
 		 714 aa  197  9e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3880  DNA topoisomerase I  30.33 
 
 		 692 aa  197  9e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000115411  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3274  DNA topoisomerase I  28.71 
 
 		 910 aa  197  1e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.384669 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2839  DNA topoisomerase I  29.48 
 
 		 768 aa  197  1e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3875  DNA topoisomerase I  30.33 
 
 		 692 aa  197  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000221974  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3689  DNA topoisomerase I  29.09 
 
 		 756 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000324271  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2445  DNA topoisomerase I  29.28 
 
 		 758 aa  197  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000450772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3684  DNA topoisomerase I  30.17 
 
 		 692 aa  196  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0116868  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  30.17 
 
 		 692 aa  196  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  30.17 
 
 		 692 aa  196  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  30.17 
 
 		 692 aa  196  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3437  DNA topoisomerase I  28.3 
 
 		 872 aa  196  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.500167 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  30 
 
 		 692 aa  196  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1690  DNA topoisomerase I  29.31 
 
 		 836 aa  195  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0132784  unclonable  0.00000000244427 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0406  DNA topoisomerase I  28.98 
 
 		 841 aa  195  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.064646  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  28.21 
 
 		 839 aa  195  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1312  DNA topoisomerase I  30.17 
 
 		 692 aa  195  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000876522  unclonable  7.60195e-25 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2831  DNA topoisomerase I  30.18 
 
 		 894 aa  195  4e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442826 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  28.85 
 
 		 876 aa  195  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  30.06 
 
 		 780 aa  195  5e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0334  DNA topoisomerase I  27.69 
 
 		 825 aa  195  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2549  DNA topoisomerase I  30.08 
 
 		 757 aa  194  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0550694  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 886 aa  194  6e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  30.33 
 
 		 692 aa  194  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>