More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0259 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0204  reverse gyrase  77.88 
 
 		 1231 aa  1958    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1396  reverse gyrase  36.05 
 
 		 1242 aa  702    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0811  reverse gyrase  44.83 
 
 		 1284 aa  1056    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0259  reverse gyrase  100 
 
 		 1227 aa  2461    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.665057  normal  0.100628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2236  reverse gyrase  37.57 
 
 		 1220 aa  750    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.309719  hitchhiker  0.000091621 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0014  reverse gyrase  36.15 
 
 		 1122 aa  688    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.492155  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0692  reverse gyrase  77.9 
 
 		 1232 aa  1939    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000186605 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1418  reverse gyrase  36.82 
 
 		 1143 aa  660    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00239755  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1363  reverse gyrase  35.62 
 
 		 1124 aa  687    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0575  reverse gyrase  40.82 
 
 		 1283 aa  811    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1663  reverse gyrase  37.55 
 
 		 1144 aa  728    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1245  reverse gyrase  76.32 
 
 		 1237 aa  1921    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  unclonable  0.000744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1131  reverse gyrase  33.74 
 
 		 1122 aa  632  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0951  reverse gyrase  34.9 
 
 		 1030 aa  622  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1941  reverse gyrase  33.02 
 
 		 1166 aa  614  9.999999999999999e-175  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0752  reverse gyrase  34.7 
 
 		 1104 aa  612  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.412278  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0775  reverse gyrase  34.94 
 
 		 1104 aa  607  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1748  reverse gyrase  34.13 
 
 		 1149 aa  592  1e-167  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.21829  normal  0.0908503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1381  DNA topoisomerase I  31.05 
 
 		 696 aa  231  7e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1223  DNA topoisomerase I  30.37 
 
 		 697 aa  228  8e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2181  DNA topoisomerase I  30.03 
 
 		 693 aa  225  4.9999999999999996e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0024842  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1700  DNA topoisomerase I  29.02 
 
 		 693 aa  224  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00616947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1027  DNA topoisomerase I  30.94 
 
 		 702 aa  223  1.9999999999999999e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0779  DNA topoisomerase I  30.55 
 
 		 706 aa  220  1e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000394767  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0840  DNA topoisomerase  28.62 
 
 		 694 aa  217  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000150599  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0916  DNA topoisomerase I  29.89 
 
 		 693 aa  217  9.999999999999999e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000916095  hitchhiker  0.000814664 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1381  DNA topoisomerase I  29.86 
 
 		 695 aa  217  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.500118 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0600  DNA topoisomerase I  29.77 
 
 		 711 aa  216  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00101448  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1526  DNA topoisomerase I  29.04 
 
 		 696 aa  216  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000864041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2658  DNA topoisomerase I  30.59 
 
 		 859 aa  215  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00218044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0460  DNA topoisomerase I  28.01 
 
 		 702 aa  214  7e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.159815  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0572  DNA topoisomerase I  29.87 
 
 		 686 aa  213  2e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0758735  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1984  DNA topoisomerase I  28.86 
 
 		 710 aa  210  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.073944  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0923  DNA topoisomerase I  30.62 
 
 		 714 aa  210  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1854  DNA topoisomerase I  28.37 
 
 		 700 aa  209  2e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1347  DNA topoisomerase I  30.91 
 
 		 780 aa  209  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000873362  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1289  DNA topoisomerase I  29.81 
 
 		 684 aa  209  3e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.781177  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1551  DNA topoisomerase I  28.59 
 
 		 689 aa  209  3e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0571  DNA topoisomerase I  28.53 
 
 		 702 aa  208  6e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1102  DNA topoisomerase I  29.68 
 
 		 691 aa  208  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000153126  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1678  DNA topoisomerase I  28.5 
 
 		 700 aa  208  6e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1956  DNA topoisomerase I  27.97 
 
 		 700 aa  207  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0175  DNA topoisomerase I  29 
 
 		 694 aa  207  7e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.636929  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14470  DNA topoisomerase I  29.51 
 
 		 868 aa  207  8e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1583  DNA topoisomerase I  29.32 
 
 		 868 aa  206  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.590699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3876  DNA topoisomerase I  29.79 
 
 		 876 aa  206  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198302  normal  0.779454 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1674  DNA topoisomerase I  27.81 
 
 		 700 aa  206  2e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1304  DNA topoisomerase I  29.12 
 
 		 708 aa  206  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.01574  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2230  DNA topoisomerase I  28.39 
 
 		 694 aa  205  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02352  DNA topoisomerase I  30.87 
 
 		 886 aa  206  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.346512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1335  DNA topoisomerase I  28.84 
 
 		 691 aa  206  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.419976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1310  DNA topoisomerase I  28.84 
 
 		 691 aa  206  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0747  DNA topoisomerase I  29.11 
 
 		 694 aa  205  4e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.894323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1655  DNA topoisomerase I  29.2 
 
 		 869 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.967668  normal  0.788315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2741  DNA topoisomerase I  29.5 
 
 		 746 aa  204  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123661  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1005  DNA topoisomerase I  30.08 
 
 		 706 aa  204  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00429671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2148  DNA topoisomerase I  29.7 
 
 		 868 aa  204  9e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0485  DNA topoisomerase I  28.64 
 
 		 711 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2058  DNA topoisomerase I  27.88 
 
 		 700 aa  204  9.999999999999999e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07540  DNA topoisomerase I  28.79 
 
 		 691 aa  203  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00641456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1995  DNA topoisomerase I  29.64 
 
 		 691 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2420  DNA topoisomerase I  28.1 
 
 		 715 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25110  DNA topoisomerase I  29.53 
 
 		 868 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1971  DNA topoisomerase I  30.16 
 
 		 883 aa  202  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819086  normal  0.697086 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3717  DNA topoisomerase I  28.55 
 
 		 696 aa  203  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000589001  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2139  DNA topoisomerase I  28.84 
 
 		 869 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.124713 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1851  DNA topoisomerase I  27.89 
 
 		 839 aa  202  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1679  DNA topoisomerase I  28.84 
 
 		 869 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229175 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3603  DNA topoisomerase I  28.84 
 
 		 869 aa  202  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0171104  normal  0.313127 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1021  DNA topoisomerase I  28.41 
 
 		 669 aa  202  3.9999999999999996e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0905515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2485  DNA topoisomerase I  30.06 
 
 		 692 aa  202  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000595417  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1615  DNA topoisomerase I  30.37 
 
 		 836 aa  201  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.830191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0083  DNA topoisomerase I  29.39 
 
 		 751 aa  201  9e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3514  DNA topoisomerase I  29.61 
 
 		 869 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0191  DNA topoisomerase I  29.19 
 
 		 823 aa  200  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3287  DNA topoisomerase I  29.31 
 
 		 870 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01574  DNA topoisomerase I  29.14 
 
 		 876 aa  200  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1208  DNA topoisomerase I  29.86 
 
 		 721 aa  199  3e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000400838  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0161  DNA topoisomerase I  28.33 
 
 		 695 aa  199  3e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3656  DNA topoisomerase I  29.42 
 
 		 692 aa  199  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0171  DNA topoisomerase I  28.48 
 
 		 743 aa  199  3e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0213  DNA topoisomerase I  28.99 
 
 		 767 aa  199  3e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00304522  normal  0.312261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0106  DNA topoisomerase I  29.61 
 
 		 747 aa  198  4.0000000000000005e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1146  DNA topoisomerase I  28.68 
 
 		 879 aa  198  5.000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2356  DNA topoisomerase I  28.77 
 
 		 879 aa  198  6e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0613436  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003948  DNA topoisomerase I  28.5 
 
 		 876 aa  197  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0644345  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1644  DNA topoisomerase I  30.88 
 
 		 762 aa  196  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1560  DNA topoisomerase I  29.49 
 
 		 877 aa  196  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0914  DNA topoisomerase I  28.39 
 
 		 868 aa  196  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2632  DNA topoisomerase I  28.19 
 
 		 797 aa  196  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.080388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0846  DNA topoisomerase I  29.21 
 
 		 877 aa  195  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0873  DNA topoisomerase I  28.64 
 
 		 877 aa  195  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.143011 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0816  DNA topoisomerase I  28.28 
 
 		 689 aa  194  7e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.996687  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3574  DNA topoisomerase I  29.02 
 
 		 692 aa  194  9e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000026995  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3592  DNA topoisomerase I  28.86 
 
 		 692 aa  193  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00080901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0497  DNA topoisomerase I  29.48 
 
 		 919 aa  193  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324618  normal  0.923376 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3971  DNA topoisomerase I  28.86 
 
 		 692 aa  193  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000571341  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3826  DNA topoisomerase I  29.06 
 
 		 852 aa  194  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.801079  normal  0.0383535 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1704  DNA topoisomerase I  29.95 
 
 		 858 aa  193  1e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.11411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3845  DNA topoisomerase I  28.86 
 
 		 692 aa  193  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.270330000000001e-60 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>